56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1353 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0546  DNA methylase containing a Zn-ribbon  48.32 
 
 		 1003 aa  924    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1353  putative DNA methylase containing a Zn-ribbon  100 
 
 		 995 aa  2061    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0013  DNA methylase containing a Zn-ribbon  63.86 
 
 		 979 aa  1310    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2173  putative DNA methylase containing a Zn-ribbon  50.45 
 
 		 979 aa  961    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.145611  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1600  protein of unknown function DUF1156  35.81 
 
 		 964 aa  569  1e-160  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000970911  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4236  hypothetical protein  24.02 
 
 		 934 aa  166  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3117  hypothetical protein  24.96 
 
 		 936 aa  157  7e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2009  hypothetical protein  23.04 
 
 		 996 aa  151  6e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.785597  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4275  hypothetical protein  24.39 
 
 		 1001 aa  151  6e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.196704 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3988  hypothetical protein  23.63 
 
 		 982 aa  112  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.172712 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0506  hypothetical protein  21.03 
 
 		 1003 aa  103  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.967914  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0239  hypothetical protein  25.43 
 
 		 1106 aa  83.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00821808 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3987  hypothetical protein  22.28 
 
 		 967 aa  82  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.375617 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2761  adenine-specific DNA methylase  22.32 
 
 		 892 aa  77.8  0.0000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1772  adenine-specific DNA methylase  21.79 
 
 		 916 aa  77.4  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1608  hypothetical protein  23.26 
 
 		 1279 aa  74.3  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2190  hypothetical protein  21.45 
 
 		 792 aa  72  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0719  hypothetical protein  22.73 
 
 		 947 aa  72  0.00000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000148143 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1948  hypothetical protein  20 
 
 		 731 aa  71.2  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0382  protein of unknown function DUF1156  21.29 
 
 		 894 aa  70.5  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.41417  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2630  hypothetical protein  22.55 
 
 		 561 aa  70.1  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.100326  normal  0.0779546 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2279  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  20.98 
 
 		 651 aa  67.8  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.132856  hitchhiker  0.000043664 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0199  protein of unknown function DUF1156  22.64 
 
 		 969 aa  65.9  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676396  normal  0.41687 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1235  protein of unknown function DUF1156  23.35 
 
 		 951 aa  62.8  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3008  hypothetical protein  24.17 
 
 		 1012 aa  62.8  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0635  hypothetical protein  20.24 
 
 		 972 aa  61.6  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0198  hypothetical protein  21.83 
 
 		 933 aa  61.6  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.213354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0638  protein of unknown function DUF1156  20.32 
 
 		 906 aa  58.2  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00295664  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2145  protein of unknown function DUF1156  49.06 
 
 		 937 aa  57.4  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000164543  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1753  hypothetical protein  68.57 
 
 		 960 aa  57.4  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1594  hypothetical protein  28.08 
 
 		 920 aa  56.6  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0655  hypothetical protein  20.72 
 
 		 969 aa  56.6  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1395  hypothetical protein  54.17 
 
 		 194 aa  57  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1808  hypothetical protein  24.52 
 
 		 1008 aa  57  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0837285  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2719  hypothetical protein  22.3 
 
 		 965 aa  56.6  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000742651 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2132  hypothetical protein  24.07 
 
 		 1118 aa  55.5  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1848  hypothetical protein  22.27 
 
 		 968 aa  55.1  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0310  DNA methylase N-4/N-6  21.92 
 
 		 599 aa  55.1  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0682  hypothetical protein  25.45 
 
 		 848 aa  53.9  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2991  hypothetical protein  54.35 
 
 		 933 aa  52.4  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0317555  normal  0.296182 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2103  protein of unknown function DUF1156  61.76 
 
 		 961 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.423161 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3100  hypothetical protein  25.52 
 
 		 1070 aa  50.1  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1018  protein of unknown function DUF1156  61.76 
 
 		 968 aa  49.7  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1184  adenine-specific DNA methylase  20.51 
 
 		 610 aa  49.7  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3347  adenine-specific DNA methylase  19.35 
 
 		 878 aa  49.7  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2684  hypothetical protein  23.27 
 
 		 1045 aa  49.7  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0982  hypothetical protein  20.96 
 
 		 1001 aa  49.3  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1119  hypothetical protein  22.71 
 
 		 1030 aa  48.9  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000327751 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2496  protein of unknown function DUF1156  59.38 
 
 		 962 aa  48.5  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0099  hypothetical protein  24.11 
 
 		 1071 aa  48.5  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.658498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4967  protein of unknown function DUF1156  32.35 
 
 		 745 aa  48.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.241084 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3562  adenine-specific DNA methylase  33.33 
 
 		 455 aa  45.8  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0059  hypothetical protein  19.52 
 
 		 947 aa  45.8  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0639  DNA methylase N-4/N-6  23.67 
 
 		 852 aa  45.1  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.028356 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3097  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  23.74 
 
 		 737 aa  44.7  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.622238  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1367  hypothetical protein  20.61 
 
 		 746 aa  44.7  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>