74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2279 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2279  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  100 
 
 		 651 aa  1332    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.132856  hitchhiker  0.000043664 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1791  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  47.95 
 
 		 703 aa  491  1e-137  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3347  adenine-specific DNA methylase  28.75 
 
 		 878 aa  263  8e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0382  protein of unknown function DUF1156  29.5 
 
 		 894 aa  251  3e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.41417  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1772  adenine-specific DNA methylase  26.7 
 
 		 916 aa  243  9e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2281  adenine-specific DNA methylase  30.16 
 
 		 751 aa  240  6.999999999999999e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0186187  hitchhiker  0.00483181 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1367  hypothetical protein  29.11 
 
 		 746 aa  239  1e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2761  adenine-specific DNA methylase  27.52 
 
 		 892 aa  235  2.0000000000000002e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3097  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  30.35 
 
 		 737 aa  232  2e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.622238  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1948  hypothetical protein  30.05 
 
 		 731 aa  212  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2196  adenine-specific DNA methylase  30.59 
 
 		 747 aa  210  6e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3423  hypothetical protein  40.2 
 
 		 256 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1184  adenine-specific DNA methylase  26.23 
 
 		 610 aa  129  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4236  hypothetical protein  24.57 
 
 		 934 aa  127  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3117  hypothetical protein  24.7 
 
 		 936 aa  126  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0506  hypothetical protein  24.19 
 
 		 1003 aa  109  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.967914  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2684  hypothetical protein  25.9 
 
 		 1045 aa  108  4e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0099  hypothetical protein  24.34 
 
 		 1071 aa  104  6e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.658498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3988  hypothetical protein  24.35 
 
 		 982 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.172712 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2132  hypothetical protein  27.82 
 
 		 1118 aa  102  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3100  hypothetical protein  25.57 
 
 		 1070 aa  98.6  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0239  hypothetical protein  24.49 
 
 		 1106 aa  97.1  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00821808 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1608  hypothetical protein  26.38 
 
 		 1279 aa  90.1  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1808  hypothetical protein  23.29 
 
 		 1008 aa  86.7  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0837285  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5892  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  23.48 
 
 		 911 aa  83.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5492  adenine-specific DNA methylase  23.48 
 
 		 911 aa  83.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.219644  normal  0.117593 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0719  hypothetical protein  25.23 
 
 		 947 aa  82.4  0.00000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000148143 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2009  hypothetical protein  21.7 
 
 		 996 aa  81.6  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.785597  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3987  hypothetical protein  24.46 
 
 		 967 aa  81.3  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.375617 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4275  hypothetical protein  22.32 
 
 		 1001 aa  80.1  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.196704 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2173  putative DNA methylase containing a Zn-ribbon  21.91 
 
 		 979 aa  78.6  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.145611  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4967  protein of unknown function DUF1156  35 
 
 		 745 aa  74.3  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.241084 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2103  protein of unknown function DUF1156  21.9 
 
 		 961 aa  73.9  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.423161 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0310  DNA methylase N-4/N-6  34.43 
 
 		 599 aa  70.5  0.00000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0635  hypothetical protein  25 
 
 		 972 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1353  putative DNA methylase containing a Zn-ribbon  20.98 
 
 		 995 aa  67.8  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1594  hypothetical protein  20.81 
 
 		 920 aa  66.2  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0013  DNA methylase containing a Zn-ribbon  20.28 
 
 		 979 aa  65.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3275  adenine-specific DNA methylase  24.48 
 
 		 596 aa  64.7  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.762851  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1235  protein of unknown function DUF1156  27.62 
 
 		 951 aa  63.2  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1600  protein of unknown function DUF1156  25.86 
 
 		 964 aa  61.2  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000970911  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0199  protein of unknown function DUF1156  25.47 
 
 		 969 aa  60.8  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676396  normal  0.41687 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0546  DNA methylase containing a Zn-ribbon  20.57 
 
 		 1003 aa  60.5  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0982  hypothetical protein  21.14 
 
 		 1001 aa  60.5  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0682  hypothetical protein  24.48 
 
 		 848 aa  59.7  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2991  hypothetical protein  23.95 
 
 		 933 aa  58.9  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0317555  normal  0.296182 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2630  hypothetical protein  26.42 
 
 		 561 aa  57.8  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.100326  normal  0.0779546 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3008  hypothetical protein  27.67 
 
 		 1012 aa  56.2  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1494  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.89 
 
 		 1068 aa  55.5  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1386  adenine-specific DNA methylase  25.37 
 
 		 540 aa  54.7  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0156455 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0638  protein of unknown function DUF1156  28.21 
 
 		 906 aa  54.7  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00295664  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0198  hypothetical protein  22.96 
 
 		 933 aa  54.7  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.213354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0655  hypothetical protein  23.78 
 
 		 969 aa  54.3  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0639  DNA methylase N-4/N-6  24.6 
 
 		 852 aa  52.8  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.028356 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2719  hypothetical protein  27.44 
 
 		 965 aa  53.1  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000742651 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2145  protein of unknown function DUF1156  25.84 
 
 		 937 aa  52.4  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000164543  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1119  hypothetical protein  25.98 
 
 		 1030 aa  52  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000327751 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0814  hypothetical protein  29.03 
 
 		 992 aa  52  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0772637 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2496  protein of unknown function DUF1156  21.29 
 
 		 962 aa  51.2  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1018  protein of unknown function DUF1156  24.03 
 
 		 968 aa  50.1  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1753  hypothetical protein  22.22 
 
 		 960 aa  48.9  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0950  hypothetical protein  19.63 
 
 		 501 aa  48.5  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0387274 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1603  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  38.71 
 
 		 251 aa  46.6  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.905646  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5606  modification methylase, putative  23.24 
 
 		 438 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166814  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1717  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.73 
 
 		 739 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000410476  hitchhiker  0.00177802 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4038  putative RNA methylase  46.81 
 
 		 483 aa  46.6  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00846703 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3558  hypothetical protein  24.86 
 
 		 920 aa  46.6  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1177  hypothetical protein  24.86 
 
 		 920 aa  46.6  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0642948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0059  hypothetical protein  24 
 
 		 947 aa  45.8  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2190  hypothetical protein  41.51 
 
 		 792 aa  46.2  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3562  adenine-specific DNA methylase  22.96 
 
 		 455 aa  45.4  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1658  adenine-specific DNA methylase  38.64 
 
 		 416 aa  45.4  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000448906  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1725  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  21.82 
 
 		 524 aa  45.4  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110429  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3799  putative RNA methylase  42.22 
 
 		 393 aa  44.3  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>