37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1177 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0059  hypothetical protein  47.25 
 
 		 947 aa  855    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3558  hypothetical protein  100 
 
 		 920 aa  1922    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1177  hypothetical protein  100 
 
 		 920 aa  1922    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0642948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1494  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  44.23 
 
 		 1068 aa  830    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1119  hypothetical protein  44.92 
 
 		 1030 aa  815    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000327751 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0814  hypothetical protein  52.13 
 
 		 992 aa  1020    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0772637 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0639  DNA methylase N-4/N-6  38.97 
 
 		 852 aa  571  1e-161  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.028356 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0310  DNA methylase N-4/N-6  30.22 
 
 		 599 aa  267  8e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1386  adenine-specific DNA methylase  24.11 
 
 		 540 aa  101  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0156455 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3275  adenine-specific DNA methylase  24.91 
 
 		 596 aa  101  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.762851  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1717  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.27 
 
 		 739 aa  83.2  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000410476  hitchhiker  0.00177802 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2281  adenine-specific DNA methylase  21.98 
 
 		 751 aa  69.7  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0186187  hitchhiker  0.00483181 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0099  hypothetical protein  32.8 
 
 		 1071 aa  68.2  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.658498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3100  hypothetical protein  32.82 
 
 		 1070 aa  67.8  0.0000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1772  adenine-specific DNA methylase  23.53 
 
 		 916 aa  67.8  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2684  hypothetical protein  32.8 
 
 		 1045 aa  67.4  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2132  hypothetical protein  34.11 
 
 		 1118 aa  67  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1184  adenine-specific DNA methylase  23.34 
 
 		 610 aa  66.6  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3988  hypothetical protein  20.34 
 
 		 982 aa  60.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.172712 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3117  hypothetical protein  29.45 
 
 		 936 aa  58.5  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1948  hypothetical protein  28.37 
 
 		 731 aa  56.6  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3097  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  20.36 
 
 		 737 aa  56.6  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.622238  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4236  hypothetical protein  27.78 
 
 		 934 aa  55.8  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3347  adenine-specific DNA methylase  27.21 
 
 		 878 aa  55.1  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1367  hypothetical protein  24.79 
 
 		 746 aa  53.1  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0382  protein of unknown function DUF1156  26.45 
 
 		 894 aa  52.4  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.41417  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3987  hypothetical protein  23.81 
 
 		 967 aa  52.4  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.375617 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2009  hypothetical protein  28.12 
 
 		 996 aa  51.6  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.785597  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5892  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  28.03 
 
 		 911 aa  51.2  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5492  adenine-specific DNA methylase  28.03 
 
 		 911 aa  51.2  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.219644  normal  0.117593 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2761  adenine-specific DNA methylase  26.42 
 
 		 892 aa  50.4  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1608  hypothetical protein  25.36 
 
 		 1279 aa  49.7  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0239  hypothetical protein  28.15 
 
 		 1106 aa  49.7  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00821808 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2196  adenine-specific DNA methylase  21.43 
 
 		 747 aa  47.8  0.0009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2279  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  24.86 
 
 		 651 aa  46.6  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.132856  hitchhiker  0.000043664 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0328  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.11 
 
 		 383 aa  46.2  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0506  hypothetical protein  21.36 
 
 		 1003 aa  45.4  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.967914  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>