46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1184 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1184  adenine-specific DNA methylase  100 
 
 		 610 aa  1260    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1772  adenine-specific DNA methylase  22.71 
 
 		 916 aa  143  9e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0382  protein of unknown function DUF1156  23.13 
 
 		 894 aa  137  5e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.41417  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3347  adenine-specific DNA methylase  23.82 
 
 		 878 aa  137  6.0000000000000005e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3097  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  23.85 
 
 		 737 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.622238  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2279  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  26.23 
 
 		 651 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.132856  hitchhiker  0.000043664 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2281  adenine-specific DNA methylase  22.04 
 
 		 751 aa  123  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0186187  hitchhiker  0.00483181 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2196  adenine-specific DNA methylase  22.45 
 
 		 747 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1791  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  26.98 
 
 		 703 aa  107  9e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2761  adenine-specific DNA methylase  22.46 
 
 		 892 aa  93.6  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3988  hypothetical protein  24.2 
 
 		 982 aa  92.8  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.172712 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3987  hypothetical protein  26.92 
 
 		 967 aa  85.5  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.375617 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4236  hypothetical protein  31.85 
 
 		 934 aa  79  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3117  hypothetical protein  31.21 
 
 		 936 aa  76.6  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1948  hypothetical protein  30.91 
 
 		 731 aa  75.5  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3100  hypothetical protein  24.94 
 
 		 1070 aa  72.8  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1367  hypothetical protein  28.22 
 
 		 746 aa  72  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2684  hypothetical protein  24.52 
 
 		 1045 aa  71.6  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0099  hypothetical protein  26.98 
 
 		 1071 aa  71.6  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.658498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3275  adenine-specific DNA methylase  28.74 
 
 		 596 aa  67.4  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.762851  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1177  hypothetical protein  23.34 
 
 		 920 aa  66.6  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0642948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3558  hypothetical protein  23.34 
 
 		 920 aa  66.6  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1119  hypothetical protein  26.49 
 
 		 1030 aa  65.9  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000327751 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1386  adenine-specific DNA methylase  30.28 
 
 		 540 aa  65.9  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0156455 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0310  DNA methylase N-4/N-6  29.01 
 
 		 599 aa  65.9  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0506  hypothetical protein  24.13 
 
 		 1003 aa  63.5  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.967914  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2132  hypothetical protein  22.88 
 
 		 1118 aa  63.2  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2190  hypothetical protein  22.6 
 
 		 792 aa  62.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1494  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.36 
 
 		 1068 aa  61.2  0.00000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1608  hypothetical protein  25.56 
 
 		 1279 aa  60.1  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5892  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  28.64 
 
 		 911 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5492  adenine-specific DNA methylase  28.64 
 
 		 911 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.219644  normal  0.117593 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0639  DNA methylase N-4/N-6  26.06 
 
 		 852 aa  58.9  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.028356 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2009  hypothetical protein  24.52 
 
 		 996 aa  58.2  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.785597  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0239  hypothetical protein  28.76 
 
 		 1106 aa  57.4  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00821808 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0546  DNA methylase containing a Zn-ribbon  24.83 
 
 		 1003 aa  56.6  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0814  hypothetical protein  27.61 
 
 		 992 aa  55.1  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0772637 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1600  protein of unknown function DUF1156  29.85 
 
 		 964 aa  55.1  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000970911  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4967  protein of unknown function DUF1156  24.8 
 
 		 745 aa  55.1  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.241084 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0059  hypothetical protein  23.81 
 
 		 947 aa  53.9  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2145  protein of unknown function DUF1156  20.72 
 
 		 937 aa  50.1  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000164543  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1353  putative DNA methylase containing a Zn-ribbon  20.51 
 
 		 995 aa  49.7  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1594  hypothetical protein  19.97 
 
 		 920 aa  47.8  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4275  hypothetical protein  20.21 
 
 		 1001 aa  46.2  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.196704 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3603  adenine-specific DNA methylase  28.04 
 
 		 453 aa  44.7  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3617  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.26 
 
 		 296 aa  44.3  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0379764  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>