34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3423 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3423  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  535  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1791  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  44.08 
 
 		 703 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2279  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  40.2 
 
 		 651 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.132856  hitchhiker  0.000043664 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3347  adenine-specific DNA methylase  29.57 
 
 		 878 aa  108  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2281  adenine-specific DNA methylase  29.9 
 
 		 751 aa  105  7e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0186187  hitchhiker  0.00483181 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2761  adenine-specific DNA methylase  29.48 
 
 		 892 aa  103  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2196  adenine-specific DNA methylase  29.84 
 
 		 747 aa  102  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1367  hypothetical protein  27.94 
 
 		 746 aa  98.2  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0382  protein of unknown function DUF1156  29.75 
 
 		 894 aa  95.9  6e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.41417  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3097  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  26.24 
 
 		 737 aa  87.8  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.622238  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1948  hypothetical protein  32.11 
 
 		 731 aa  84.3  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3100  hypothetical protein  36.89 
 
 		 1070 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0099  hypothetical protein  36.89 
 
 		 1071 aa  72  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.658498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1772  adenine-specific DNA methylase  23.11 
 
 		 916 aa  70.5  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2132  hypothetical protein  35.25 
 
 		 1118 aa  67  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2684  hypothetical protein  32.79 
 
 		 1045 aa  65.5  0.0000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1386  adenine-specific DNA methylase  24.35 
 
 		 540 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0156455 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1071  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  40.98 
 
 		 391 aa  47.4  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6814  hypothetical protein  47.83 
 
 		 433 aa  45.8  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.823873  normal  0.941535 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4009  hypothetical protein  30.63 
 
 		 512 aa  45.8  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000517991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4236  hypothetical protein  22.31 
 
 		 934 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0506  hypothetical protein  21.95 
 
 		 1003 aa  44.3  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.967914  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0684  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.19 
 
 		 528 aa  43.9  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3799  putative RNA methylase  30.23 
 
 		 393 aa  44.3  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4038  putative RNA methylase  33.8 
 
 		 483 aa  43.5  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00846703 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0332  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  30.95 
 
 		 530 aa  43.9  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00994221  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1717  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  44.44 
 
 		 739 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000410476  hitchhiker  0.00177802 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1303  adenine-specific DNA methylase  41.07 
 
 		 418 aa  43.5  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404813  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3275  adenine-specific DNA methylase  36.73 
 
 		 596 aa  43.1  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.762851  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0460  putative RNA methylase  38.1 
 
 		 259 aa  43.1  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.258821  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3117  hypothetical protein  24.58 
 
 		 936 aa  42.4  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0068  hypothetical protein  46 
 
 		 464 aa  42.7  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00010049  hitchhiker  0.00158155 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40 
 
 		 947 aa  42  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0306  putative RNA methylase  31.65 
 
 		 259 aa  42  0.01  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0220171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>