79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0684 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1725  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  57.28 
 
 
524 aa  639    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110429  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0909  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  61.83 
 
 
535 aa  706    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.90275  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0332  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  67.05 
 
 
530 aa  749    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00994221  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0684  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  100 
 
 
528 aa  1097    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3603  adenine-specific DNA methylase  30.95 
 
 
453 aa  74.3  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0938  putative RNA methylase  32.33 
 
 
461 aa  67.4  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000152524  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4077  hypothetical protein  36.89 
 
 
614 aa  64.3  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.180847  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1658  adenine-specific DNA methylase  35.79 
 
 
416 aa  62.4  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000448906  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0931  adenine-specific DNA methylase  22.26 
 
 
412 aa  62  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.316794  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4038  putative RNA methylase  34.26 
 
 
483 aa  61.6  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00846703 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1303  adenine-specific DNA methylase  27.27 
 
 
418 aa  61.6  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404813  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1122  DNA methyltransferase  29.84 
 
 
416 aa  60.5  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.909173  normal  0.0173084 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2450  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  40.54 
 
 
368 aa  59.7  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0737  hypothetical protein  31.34 
 
 
407 aa  60.1  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00870561  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  33.08 
 
 
947 aa  58.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1456  putative RNA methylase  28.79 
 
 
463 aa  56.6  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3799  putative RNA methylase  28.21 
 
 
393 aa  55.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3798  putative RNA methylase  39.02 
 
 
495 aa  54.7  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1917  putative modification methylase  40 
 
 
482 aa  54.7  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0419467  hitchhiker  0.0000000000400101 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4787  hypothetical protein  25.36 
 
 
441 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1620  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.81 
 
 
414 aa  53.5  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0953  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.91 
 
 
372 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.752338  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1055  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  45.59 
 
 
849 aa  52.8  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000157491  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6814  hypothetical protein  23.2 
 
 
433 aa  51.6  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.823873  normal  0.941535 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3593  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34.04 
 
 
372 aa  51.6  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.316349  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5607  modification methylase, putative  25.97 
 
 
430 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0295584  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1386  adenine-specific DNA methylase  21.75 
 
 
540 aa  51.2  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0156455 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0328  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.63 
 
 
383 aa  51.2  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1000  DNA methyltransferase  45.83 
 
 
472 aa  50.1  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1246  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  48.94 
 
 
293 aa  50.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0940338  hitchhiker  0.00345461 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2184  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.7 
 
 
371 aa  50.1  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0490664  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3922  hypothetical protein  29.9 
 
 
439 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0070396  normal  0.271721 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4009  hypothetical protein  29.51 
 
 
512 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000517991  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3873  hypothetical protein  29.9 
 
 
439 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1833  hypothetical protein  27.55 
 
 
444 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3012  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  37.35 
 
 
477 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4974  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  55.56 
 
 
597 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6933  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  55.26 
 
 
327 aa  48.5  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0266817  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0374  hypothetical protein  32.1 
 
 
146 aa  48.5  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000208638  normal  0.261256 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5156  hypothetical protein  24.29 
 
 
393 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000726262 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0068  hypothetical protein  26.79 
 
 
464 aa  47.8  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00010049  hitchhiker  0.00158155 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32.91 
 
 
308 aa  47.4  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000183696  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2226  hypothetical protein  30.12 
 
 
467 aa  47.4  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0591  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32.91 
 
 
308 aa  47.4  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000342774  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4359  hypothetical protein  29.06 
 
 
425 aa  47.4  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000708265  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0114  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  35.59 
 
 
353 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1775  putative RNA methylase  46.34 
 
 
315 aa  46.6  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1670  DNA methyltransferase  58.06 
 
 
380 aa  46.6  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5606  modification methylase, putative  26.17 
 
 
438 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166814  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0627  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  46 
 
 
274 aa  46.6  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1426  hypothetical protein  43.48 
 
 
432 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0041  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  38.46 
 
 
441 aa  45.8  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0021  DNA modification methylase-like protein  29.84 
 
 
481 aa  46.2  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3926  putative DNA modification methylase  34.72 
 
 
345 aa  45.8  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0038  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  42.37 
 
 
257 aa  45.4  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1717  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  32.22 
 
 
739 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000410476  hitchhiker  0.00177802 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1939  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  37.29 
 
 
375 aa  45.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000888828  hitchhiker  0.0000001156 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2731  methyltransferase DNA modification enzyme  33.33 
 
 
410 aa  45.4  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6722  putative RNA methylase  32 
 
 
292 aa  45.4  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.121582  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0286  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  59.38 
 
 
271 aa  44.7  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.684049  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2104  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  57.14 
 
 
269 aa  44.7  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.636734  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0884  DNA methylase N-4/N-6  39.39 
 
 
451 aa  45.1  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.946324  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1791  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  32.5 
 
 
703 aa  44.7  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0833  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  58.06 
 
 
302 aa  44.7  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2284  hypothetical protein  20.48 
 
 
450 aa  44.3  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4183  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  58.62 
 
 
370 aa  44.3  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  hitchhiker  0.00000333681 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1578  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  43.4 
 
 
483 aa  44.3  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2784  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  35.29 
 
 
282 aa  44.3  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0534146  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2206  methyltransferase DNA modification enzyme  24.81 
 
 
414 aa  43.9  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.612218  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3423  hypothetical protein  26.19 
 
 
256 aa  43.9  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0829  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  32.93 
 
 
246 aa  43.9  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0469  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.51 
 
 
256 aa  43.9  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.321742  normal  0.0206265 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0283  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  51.35 
 
 
292 aa  43.5  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26692  predicted protein  52.94 
 
 
411 aa  43.5  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0281046  decreased coverage  0.00284905 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1948  hypothetical protein  47.37 
 
 
731 aa  43.5  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156697  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1518  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  46.81 
 
 
284 aa  43.5  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2337  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  51.43 
 
 
334 aa  43.5  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.628508 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05110  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  36.54 
 
 
386 aa  43.5  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0407  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  34.94 
 
 
476 aa  43.5  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.144423 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>