49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0332 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0909  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  64.19 
 
 
535 aa  720    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.90275  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1725  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  56.77 
 
 
524 aa  640    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110429  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0332  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  100 
 
 
530 aa  1105    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00994221  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0684  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  67.05 
 
 
528 aa  749    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3603  adenine-specific DNA methylase  28.21 
 
 
453 aa  70.5  0.00000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0938  putative RNA methylase  35.87 
 
 
461 aa  62.4  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000152524  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0931  adenine-specific DNA methylase  21.23 
 
 
412 aa  61.6  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.316794  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1303  adenine-specific DNA methylase  26.13 
 
 
418 aa  60.1  0.00000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404813  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4077  hypothetical protein  34.29 
 
 
614 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.180847  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1658  adenine-specific DNA methylase  35.24 
 
 
416 aa  56.2  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000448906  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1620  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.03 
 
 
414 aa  56.6  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1917  putative modification methylase  30.53 
 
 
482 aa  56.6  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0419467  hitchhiker  0.0000000000400101 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2450  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  37.84 
 
 
368 aa  55.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4038  putative RNA methylase  21.13 
 
 
483 aa  56.2  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00846703 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3799  putative RNA methylase  27.97 
 
 
393 aa  54.7  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1833  hypothetical protein  29.73 
 
 
444 aa  53.9  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1386  adenine-specific DNA methylase  23.22 
 
 
540 aa  52.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0156455 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3798  putative RNA methylase  35.23 
 
 
495 aa  52.8  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1122  DNA methyltransferase  33.33 
 
 
416 aa  51.6  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.909173  normal  0.0173084 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0374  hypothetical protein  28.97 
 
 
146 aa  51.2  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000208638  normal  0.261256 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2226  hypothetical protein  27.27 
 
 
467 aa  51.2  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5606  modification methylase, putative  28.04 
 
 
438 aa  51.2  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166814  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1717  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  42.11 
 
 
739 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000410476  hitchhiker  0.00177802 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.52 
 
 
947 aa  50.8  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5607  modification methylase, putative  32.22 
 
 
430 aa  50.4  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0295584  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0737  hypothetical protein  26.79 
 
 
407 aa  50.4  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00870561  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0953  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.17 
 
 
372 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.752338  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2184  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.1 
 
 
371 aa  49.3  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0490664  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4787  hypothetical protein  28.75 
 
 
441 aa  47.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3593  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.33 
 
 
372 aa  47  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.316349  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1791  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  32.76 
 
 
703 aa  47  0.0009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3873  hypothetical protein  27.19 
 
 
439 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5156  hypothetical protein  31.75 
 
 
393 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000726262 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3922  hypothetical protein  27.19 
 
 
439 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0070396  normal  0.271721 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0068  hypothetical protein  28.57 
 
 
464 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00010049  hitchhiker  0.00158155 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1456  putative RNA methylase  28.95 
 
 
463 aa  45.4  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0627  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  35.59 
 
 
274 aa  45.1  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1471  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  60.61 
 
 
276 aa  44.7  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3012  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  34.72 
 
 
477 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6814  hypothetical protein  20.84 
 
 
433 aa  44.7  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.823873  normal  0.941535 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0114  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  21.43 
 
 
353 aa  44.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1246  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.57 
 
 
293 aa  43.9  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0940338  hitchhiker  0.00345461 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2206  methyltransferase DNA modification enzyme  25.58 
 
 
414 aa  43.9  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.612218  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3423  hypothetical protein  30.95 
 
 
256 aa  43.9  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0591  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  47.37 
 
 
308 aa  43.9  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000342774  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  47.37 
 
 
308 aa  43.9  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000183696  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1000  DNA methyltransferase  33.33 
 
 
472 aa  43.9  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2281  adenine-specific DNA methylase  28.92 
 
 
751 aa  43.5  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0186187  hitchhiker  0.00483181 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0328  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.77 
 
 
383 aa  43.5  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>