More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1071 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_1071  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  100 
 
 
391 aa  791    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1471  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  39.26 
 
 
276 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2518  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34.27 
 
 
464 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1826  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34.31 
 
 
460 aa  166  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.478282 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0318  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  33.82 
 
 
282 aa  162  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2495  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  33.89 
 
 
601 aa  159  6e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5892  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  32.11 
 
 
319 aa  156  5.0000000000000005e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.720658  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6680  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  33.54 
 
 
644 aa  156  7e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000759129  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1355  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  34.43 
 
 
378 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0685753  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0708  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.73 
 
 
545 aa  150  4e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5436  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  32.98 
 
 
707 aa  150  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.81891 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3766  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.66 
 
 
599 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0871751  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3628  DNA methylase N-4/N-6  25.66 
 
 
599 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0838  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  35.58 
 
 
459 aa  147  3e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1513  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.21 
 
 
286 aa  144  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.634742  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0197  hypothetical protein  29.79 
 
 
646 aa  143  7e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0355  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  32.76 
 
 
289 aa  140  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4152  DNA methylase N-4/N-6  29.89 
 
 
544 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1080  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  32.87 
 
 
305 aa  134  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1840  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.58 
 
 
284 aa  129  6e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291507  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4064  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  31.14 
 
 
281 aa  129  7.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.461209  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2179  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  27.12 
 
 
673 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.199223  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24470  adinene-specific DNA-methyltransferase  32.61 
 
 
677 aa  127  5e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0124  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  29.45 
 
 
303 aa  124  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2786  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  28.67 
 
 
290 aa  121  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269604  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1319  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32.97 
 
 
258 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000125948 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2793  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.18 
 
 
751 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1491  adenine specific DNA-methyltransferase  28.98 
 
 
779 aa  119  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00364069  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3192  type III restriction-modification system, Mod subunit  30.18 
 
 
751 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.854684  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2506  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.47 
 
 
290 aa  116  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000291701 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2238  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.68 
 
 
304 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000832138  hitchhiker  0.0000505476 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3693  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.66 
 
 
332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00816735  hitchhiker  0.000000112456 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4450  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.82 
 
 
283 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0108  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.11 
 
 
287 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.251085 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1043  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.76 
 
 
733 aa  107  3e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0655  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.01 
 
 
442 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000525307  normal  0.106062 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2136  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.99 
 
 
273 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113526  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0676  DNA methylase N-4/N-6  24.44 
 
 
520 aa  106  7e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.635951 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1982  DNA-methyltransferase (DNA-modification methylase) protein  28.1 
 
 
270 aa  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0159066 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1812  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.73 
 
 
273 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500335  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0941  DNA methylase  31.49 
 
 
309 aa  105  1e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3051  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  32.83 
 
 
305 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.766 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2010  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.86 
 
 
370 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1085  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.01 
 
 
540 aa  102  9e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1213  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  29.11 
 
 
470 aa  102  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1840  DNA methylase N-4/N-6  28.33 
 
 
380 aa  102  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0373756  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0305  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28 
 
 
510 aa  99.8  8e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4576  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.5 
 
 
382 aa  98.2  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6841  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.68 
 
 
301 aa  97.8  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.463976 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0375  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.96 
 
 
373 aa  97.1  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.984822  hitchhiker  0.00505908 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2880  putative modification methylase  27.31 
 
 
301 aa  97.1  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150564  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4375  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.68 
 
 
305 aa  96.7  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3573  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.17 
 
 
306 aa  96.3  8e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.116756  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1720  N-6 adenine-specific DNA methylase  27.37 
 
 
282 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0768  DNA methylase  27.37 
 
 
258 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2306  DNA modification methylase RsrI  27.37 
 
 
282 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.436701  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0530  DNA modification methylase RsrI  27.37 
 
 
282 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.675032  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0203  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.44 
 
 
319 aa  95.5  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2444  DNA modification methylase RsrI  27.37 
 
 
282 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.462592  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4621  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.21 
 
 
283 aa  95.9  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0315645  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1650  N-6 adenine-specific DNA methylase  27.37 
 
 
282 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1859  N-6 adenine-specific DNA methylase  27.37 
 
 
282 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.229539  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4286  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.18 
 
 
447 aa  95.1  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2193  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.37 
 
 
359 aa  95.1  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03120  predicted methyltransferase  30.29 
 
 
294 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.753742  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2124  DNA methylase N-4/N-6  26.84 
 
 
283 aa  94.4  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.775437  normal  0.0115493 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03071  hypothetical protein  30.29 
 
 
294 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3210  DNA methylase N-4/N-6  26.03 
 
 
367 aa  94.4  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0680  N-6 adenine-specific DNA methylase  27.01 
 
 
259 aa  94.4  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846805  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0444  putative methyltransferase  30.29 
 
 
294 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0634628  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0547  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.55 
 
 
752 aa  94.4  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.392041  normal  0.581045 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4579  putative methyltransferase  30.37 
 
 
294 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026019  normal  0.14101 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3455  putative methyltransferase  30.29 
 
 
294 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000495763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0444  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.37 
 
 
294 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00573028  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0869  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  22.41 
 
 
505 aa  94  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3557  putative methyltransferase  30 
 
 
294 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00430538  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0828  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.97 
 
 
323 aa  93.6  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3854  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.47 
 
 
283 aa  93.2  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3349  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.47 
 
 
283 aa  92.8  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.206831  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6856  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.85 
 
 
313 aa  92.8  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0555121 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3747  putative methyltransferase  29.5 
 
 
294 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000140856  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1468  site-specific DNA-methyltransferase  25.26 
 
 
372 aa  92.8  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.661815  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3803  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  23.73 
 
 
566 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2466  DNA methylase N-4/N-6  26.18 
 
 
311 aa  92.4  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3645  putative methyltransferase  30.37 
 
 
294 aa  92.8  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000318659  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0119  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.26 
 
 
372 aa  92.8  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.222875  normal  0.070794 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2649  DNA methylase N-4/N-6  25.26 
 
 
389 aa  91.7  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0965  DNA methylase N-4/N-6  24.41 
 
 
379 aa  92  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1962  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.3 
 
 
259 aa  91.7  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0088  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  26.77 
 
 
369 aa  91.3  3e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3569  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.37 
 
 
283 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.570267  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4408  DNA methylase N-4/N-6  26.37 
 
 
283 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0066  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.56 
 
 
372 aa  90.1  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.711822  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3959  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.37 
 
 
283 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135356  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0951  DNA methylase  27.96 
 
 
250 aa  90.1  6e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000000248697  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2101  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.26 
 
 
376 aa  90.1  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.528087 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2305  DNA methylase N-4/N-6  26.69 
 
 
304 aa  89.7  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2706  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.2 
 
 
438 aa  89.7  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3838  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.22 
 
 
311 aa  89.7  9e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2784  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.24 
 
 
282 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0534146  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>