More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1840 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1840  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  100 
 
 
284 aa  585  1e-166  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291507  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1513  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  70.44 
 
 
286 aa  424  1e-118  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.634742  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4064  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  64.47 
 
 
281 aa  381  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.461209  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1080  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  61.51 
 
 
305 aa  354  8.999999999999999e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0355  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  57.88 
 
 
289 aa  343  1e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0124  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  59.47 
 
 
303 aa  336  2.9999999999999997e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0108  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  56.18 
 
 
287 aa  325  5e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.251085 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2506  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  58.27 
 
 
290 aa  322  3e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000291701 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2786  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  55.56 
 
 
290 aa  318  5e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269604  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5892  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  39.34 
 
 
319 aa  199  6e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.720658  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1471  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  42.5 
 
 
276 aa  192  5e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0318  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  36.86 
 
 
282 aa  183  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1826  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  39.93 
 
 
460 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.478282 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0838  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  36.97 
 
 
459 aa  160  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2518  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  39.16 
 
 
464 aa  160  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1355  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  33.67 
 
 
378 aa  144  2e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0685753  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2793  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.96 
 
 
751 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1071  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.94 
 
 
391 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3192  type III restriction-modification system, Mod subunit  30.96 
 
 
751 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.854684  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2179  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  31.27 
 
 
673 aa  130  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.199223  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2495  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.5 
 
 
601 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24470  adinene-specific DNA-methyltransferase  32.17 
 
 
677 aa  122  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5436  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  30.43 
 
 
707 aa  118  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.81891 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3684  putative methyltransferase  31.54 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220289  normal  0.0704128 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3747  putative methyltransferase  31.54 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00189132  normal  0.187537 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3577  putative methyltransferase  31.54 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00742062  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3578  putative methyltransferase  31.54 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0177776  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3650  putative methyltransferase  31.54 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000365024  hitchhiker  0.00241657 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1213  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  32.19 
 
 
470 aa  110  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4450  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  32.89 
 
 
283 aa  109  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3645  putative methyltransferase  29.54 
 
 
294 aa  105  6e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000318659  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03120  predicted methyltransferase  29.54 
 
 
294 aa  104  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.753742  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0444  putative methyltransferase  29.54 
 
 
294 aa  104  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0634628  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3455  putative methyltransferase  29.54 
 
 
294 aa  104  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000495763  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03071  hypothetical protein  29.54 
 
 
294 aa  104  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3557  putative methyltransferase  29.18 
 
 
294 aa  105  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00430538  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4579  putative methyltransferase  29.54 
 
 
294 aa  105  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026019  normal  0.14101 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3747  putative methyltransferase  29.18 
 
 
294 aa  103  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000140856  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0444  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.18 
 
 
294 aa  103  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00573028  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1982  DNA-methyltransferase (DNA-modification methylase) protein  30.11 
 
 
270 aa  103  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0159066 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3838  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.88 
 
 
311 aa  102  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1392  putative type II DNA modification enzyme (methyltransferase)  28.81 
 
 
351 aa  101  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0204297  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2466  DNA methylase N-4/N-6  27.86 
 
 
311 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4152  DNA methylase N-4/N-6  27.06 
 
 
544 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2398  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.48 
 
 
313 aa  99  8e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0750  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.26 
 
 
395 aa  98.6  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.296291  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2136  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.83 
 
 
273 aa  97.4  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113526  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0541  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.45 
 
 
398 aa  96.3  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0336098  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1474  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.62 
 
 
368 aa  95.9  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4576  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.78 
 
 
382 aa  95.1  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1812  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.5 
 
 
273 aa  94.7  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500335  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0828  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.62 
 
 
323 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3573  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.24 
 
 
306 aa  93.2  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.116756  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2193  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.18 
 
 
359 aa  93.2  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1084  cell cycle regulated site-specific DNA-methyltransferase protein  28.9 
 
 
377 aa  93.2  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0965  DNA methylase N-4/N-6  26.76 
 
 
379 aa  92.8  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1112  type III restriction-modification system, methylase subunit  26.44 
 
 
587 aa  92.4  7e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.350936  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2305  DNA methylase N-4/N-6  28.91 
 
 
304 aa  92.4  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2300  DNA methylase N-4/N-6  27.86 
 
 
287 aa  92.4  7e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.599897  normal  0.437406 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1367  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.37 
 
 
360 aa  91.7  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1840  DNA methylase N-4/N-6  26.22 
 
 
380 aa  91.7  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0373756  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1173  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.96 
 
 
389 aa  92  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1468  site-specific DNA-methyltransferase  25.96 
 
 
372 aa  90.9  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.661815  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2124  DNA methylase N-4/N-6  29.2 
 
 
283 aa  90.9  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.775437  normal  0.0115493 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.51 
 
 
377 aa  90.9  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.220402  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0119  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.96 
 
 
372 aa  90.9  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.222875  normal  0.070794 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0649  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.51 
 
 
380 aa  90.1  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0704  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.17 
 
 
379 aa  90.1  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4408  DNA methylase N-4/N-6  28.99 
 
 
283 aa  89.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3569  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.99 
 
 
283 aa  89.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.570267  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3959  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.99 
 
 
283 aa  89.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135356  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0066  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.61 
 
 
372 aa  89.7  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.711822  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3343  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.92 
 
 
369 aa  89.7  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  hitchhiker  0.00000416126 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2231  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.92 
 
 
369 aa  89.4  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0921492  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3349  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.01 
 
 
283 aa  89  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.206831  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3854  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.01 
 
 
283 aa  89  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0495  modification methylase BabI  29.17 
 
 
386 aa  88.2  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1449  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.06 
 
 
360 aa  88.2  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.103238  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0491  modification methylase BabI  29.17 
 
 
377 aa  88.2  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.598468  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3210  DNA methylase N-4/N-6  26.67 
 
 
367 aa  87.8  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2649  DNA methylase N-4/N-6  25.53 
 
 
389 aa  87.4  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0941  DNA methylase  27.62 
 
 
309 aa  87.4  2e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4375  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.7 
 
 
305 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4367  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.22 
 
 
358 aa  87  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.721631 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0763  DNA adenine methylase CcrM  27.84 
 
 
372 aa  86.7  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0710  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.41 
 
 
396 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.256759 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3008  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.92 
 
 
370 aa  86.3  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.367581 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1597  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.88 
 
 
379 aa  85.9  6e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.111041 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4621  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.24 
 
 
283 aa  86.3  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0315645  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6841  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.04 
 
 
301 aa  86.3  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.463976 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3043  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.03 
 
 
375 aa  85.9  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00264807  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1720  N-6 adenine-specific DNA methylase  28.79 
 
 
282 aa  85.9  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0530  DNA modification methylase RsrI  28.79 
 
 
282 aa  85.9  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.675032  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0768  DNA methylase  28.79 
 
 
258 aa  85.9  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2306  DNA modification methylase RsrI  28.79 
 
 
282 aa  85.9  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.436701  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2444  DNA modification methylase RsrI  28.79 
 
 
282 aa  85.9  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.462592  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1650  N-6 adenine-specific DNA methylase  28.79 
 
 
282 aa  85.9  7e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1859  N-6 adenine-specific DNA methylase  28.79 
 
 
282 aa  85.9  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.229539  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0203  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.69 
 
 
319 aa  85.5  8e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0392  DNA methylase N-4/N-6  25.27 
 
 
367 aa  85.1  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.723409 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>