More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1319 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1319  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  100 
 
 
258 aa  524  1e-148  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000125948 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0505  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  51.82 
 
 
239 aa  245  6e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2937  DNA methylase N-4/N-6  45.45 
 
 
329 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000000597198  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0518  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  43.28 
 
 
326 aa  204  9e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0925  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  45.41 
 
 
294 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.171639 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2193  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30 
 
 
359 aa  125  5e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2649  DNA methylase N-4/N-6  27.84 
 
 
389 aa  125  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1071  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  32.97 
 
 
391 aa  120  3e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0392  DNA methylase N-4/N-6  27.73 
 
 
367 aa  117  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.723409 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3573  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.93 
 
 
306 aa  116  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.116756  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3210  DNA methylase N-4/N-6  27.91 
 
 
367 aa  117  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1468  site-specific DNA-methyltransferase  25.48 
 
 
372 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.661815  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0009  putative methylase  28.87 
 
 
227 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0119  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.48 
 
 
372 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.222875  normal  0.070794 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0043  putative methylase  28.45 
 
 
227 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.181539  normal  0.0471117 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0024  adenine-specific methyltransferase  25.27 
 
 
368 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.109862  normal  0.210092 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0066  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.87 
 
 
372 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.711822  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1840  DNA methylase N-4/N-6  28.12 
 
 
380 aa  114  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0373756  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4576  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.2 
 
 
382 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1474  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.82 
 
 
368 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0413  modification methylase CcrMI  27.71 
 
 
378 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1367  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.92 
 
 
360 aa  112  6e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0702  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.38 
 
 
367 aa  111  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0606262  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4450  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.73 
 
 
283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3557  putative methyltransferase  30.11 
 
 
294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00430538  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0375  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.44 
 
 
373 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.984822  hitchhiker  0.00505908 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2101  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.49 
 
 
376 aa  110  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.528087 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0132  putative methylase  26.02 
 
 
225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000100441 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2231  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.13 
 
 
369 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0921492  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0050  putative methylase  26.02 
 
 
227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000518664  normal  0.980078 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1982  DNA-methyltransferase (DNA-modification methylase) protein  29.39 
 
 
270 aa  109  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0159066 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1812  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.12 
 
 
273 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500335  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3747  putative methyltransferase  30.11 
 
 
294 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000140856  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3645  putative methyltransferase  30.47 
 
 
294 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000318659  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0444  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.11 
 
 
294 aa  109  5e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00573028  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0965  DNA methylase N-4/N-6  27.52 
 
 
379 aa  109  5e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.79 
 
 
377 aa  108  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.220402  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4367  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.27 
 
 
358 aa  109  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.721631 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3343  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.1 
 
 
369 aa  108  9.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  hitchhiker  0.00000416126 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0013  putative methylase  26.36 
 
 
227 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03120  predicted methyltransferase  29.75 
 
 
294 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.753742  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0444  putative methyltransferase  29.75 
 
 
294 aa  107  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0634628  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3455  putative methyltransferase  29.75 
 
 
294 aa  107  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000495763  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03071  hypothetical protein  29.75 
 
 
294 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3008  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.33 
 
 
370 aa  107  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.367581 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2136  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.63 
 
 
273 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113526  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2010  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.67 
 
 
370 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0495  modification methylase BabI  25.4 
 
 
386 aa  107  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1218  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.85 
 
 
376 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0491  modification methylase BabI  25.4 
 
 
377 aa  107  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.598468  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1073  DNA methylase N-4/N-6  27.16 
 
 
377 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.981822  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0541  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.84 
 
 
398 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0336098  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4579  putative methyltransferase  29.39 
 
 
294 aa  106  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026019  normal  0.14101 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2603  DNA methylase N-4/N-6  26.23 
 
 
376 aa  106  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.592749  normal  0.243263 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0710  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.71 
 
 
396 aa  105  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.256759 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3043  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.44 
 
 
375 aa  105  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00264807  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1200  DNA methylase N-4/N-6  27.02 
 
 
377 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0704  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.19 
 
 
379 aa  105  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1084  cell cycle regulated site-specific DNA-methyltransferase protein  23.13 
 
 
377 aa  105  7e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0649  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.09 
 
 
380 aa  105  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4366  DNA methylase N-4/N-6  26.61 
 
 
377 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.436205  normal  0.0199247 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3225  DNA methylase N-4/N-6  25.31 
 
 
376 aa  104  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2332  DNA adenine methylase CcrM  27.59 
 
 
344 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.160434  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0763  DNA adenine methylase CcrM  24.9 
 
 
372 aa  103  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1597  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.05 
 
 
379 aa  100  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.111041 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2784  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.88 
 
 
282 aa  99.8  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0534146  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2466  DNA methylase N-4/N-6  27.24 
 
 
311 aa  99.8  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1962  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.02 
 
 
259 aa  99.8  4e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3181  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.67 
 
 
398 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3505  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.67 
 
 
398 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.602417 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0750  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.36 
 
 
395 aa  99.4  6e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.296291  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3376  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.29 
 
 
370 aa  98.6  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0203  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.31 
 
 
319 aa  97.8  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1173  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.03 
 
 
389 aa  97.4  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0534  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  28.63 
 
 
239 aa  96.7  3e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000146587 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3164  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.3 
 
 
225 aa  96.3  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0356148  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2855  DNA methylase N-4/N-6  26.44 
 
 
285 aa  95.9  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0194641  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6933  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.67 
 
 
327 aa  95.5  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0266817  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2305  DNA methylase N-4/N-6  27.09 
 
 
304 aa  94.7  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1611  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.24 
 
 
226 aa  94.7  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.932  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3051  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.46 
 
 
305 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.766 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2942  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.05 
 
 
286 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.361147  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6841  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.63 
 
 
301 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.463976 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3036  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.05 
 
 
286 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0660763  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3650  putative methyltransferase  26.79 
 
 
294 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000365024  hitchhiker  0.00241657 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3577  putative methyltransferase  26.79 
 
 
294 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00742062  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3578  putative methyltransferase  26.79 
 
 
294 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0177776  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3684  putative methyltransferase  26.79 
 
 
294 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220289  normal  0.0704128 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3747  putative methyltransferase  26.79 
 
 
294 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00189132  normal  0.187537 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2880  putative modification methylase  27.24 
 
 
301 aa  92.8  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150564  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4375  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.84 
 
 
305 aa  92.8  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1449  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  21.54 
 
 
360 aa  92.8  5e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.103238  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0719  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.9 
 
 
368 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0569  DNA methylase N-4/N-6  24.07 
 
 
215 aa  92.4  6e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.908936  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0988  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.65 
 
 
225 aa  92.4  6e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0151076  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2124  DNA methylase N-4/N-6  27.52 
 
 
283 aa  92.4  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.775437  normal  0.0115493 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3854  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.52 
 
 
283 aa  91.7  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4621  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.02 
 
 
283 aa  92  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0315645  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0120  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.02 
 
 
225 aa  92  9e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0225106 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2608  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.37 
 
 
265 aa  91.7  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000327193 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>