More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0318 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0318  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  100 
 
 
282 aa  582  1.0000000000000001e-165  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1471  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  49.61 
 
 
276 aa  273  3e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5892  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  45.62 
 
 
319 aa  203  3e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.720658  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1513  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40.14 
 
 
286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.634742  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0355  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  38.97 
 
 
289 aa  194  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0838  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  40.99 
 
 
459 aa  186  4e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4064  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  37.19 
 
 
281 aa  180  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.461209  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1840  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  36.58 
 
 
284 aa  179  4.999999999999999e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291507  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5436  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  37.69 
 
 
707 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.81891 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1826  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  39.51 
 
 
460 aa  175  6e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.478282 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2506  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  37.72 
 
 
290 aa  175  7e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000291701 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1355  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  38.76 
 
 
378 aa  175  8e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0685753  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0124  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  39.02 
 
 
303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2786  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  36.97 
 
 
290 aa  172  6.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269604  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3192  type III restriction-modification system, Mod subunit  34.85 
 
 
751 aa  166  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.854684  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2793  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  34.85 
 
 
751 aa  166  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2518  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.66 
 
 
464 aa  165  8e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1080  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  36.52 
 
 
305 aa  163  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1071  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  33.82 
 
 
391 aa  162  7e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0108  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35.38 
 
 
287 aa  162  8.000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.251085 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1491  adenine specific DNA-methyltransferase  29.71 
 
 
779 aa  154  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00364069  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2495  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  32.47 
 
 
601 aa  152  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0708  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.75 
 
 
545 aa  144  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6680  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.56 
 
 
644 aa  144  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000759129  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3766  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.91 
 
 
599 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0871751  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3628  DNA methylase N-4/N-6  31.17 
 
 
599 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1043  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  35.43 
 
 
733 aa  141  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2179  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  34.38 
 
 
673 aa  138  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.199223  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4152  DNA methylase N-4/N-6  31.28 
 
 
544 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24470  adinene-specific DNA-methyltransferase  32.47 
 
 
677 aa  132  9e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0655  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.85 
 
 
442 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000525307  normal  0.106062 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0197  hypothetical protein  29.5 
 
 
646 aa  127  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1213  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  30.91 
 
 
470 aa  126  5e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4450  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.89 
 
 
283 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2706  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.35 
 
 
438 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1812  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  33.46 
 
 
273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500335  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1466  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.14 
 
 
906 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3645  putative methyltransferase  28.4 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000318659  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3557  putative methyltransferase  28.4 
 
 
294 aa  113  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00430538  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3684  putative methyltransferase  28.12 
 
 
294 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220289  normal  0.0704128 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3747  putative methyltransferase  28.12 
 
 
294 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00189132  normal  0.187537 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3577  putative methyltransferase  28.12 
 
 
294 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00742062  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3531  putative methyltransferase  30.68 
 
 
283 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.158156 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3650  putative methyltransferase  28.12 
 
 
294 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000365024  hitchhiker  0.00241657 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3578  putative methyltransferase  28.12 
 
 
294 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0177776  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2136  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  32.57 
 
 
273 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113526  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0444  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.02 
 
 
294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00573028  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4579  putative methyltransferase  27.63 
 
 
294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026019  normal  0.14101 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03120  predicted methyltransferase  27.63 
 
 
294 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.753742  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0547  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.57 
 
 
752 aa  110  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.392041  normal  0.581045 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3455  putative methyltransferase  27.63 
 
 
294 aa  110  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000495763  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0444  putative methyltransferase  27.63 
 
 
294 aa  110  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0634628  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03071  hypothetical protein  27.63 
 
 
294 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1982  DNA-methyltransferase (DNA-modification methylase) protein  31.8 
 
 
270 aa  109  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0159066 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3747  putative methyltransferase  27.24 
 
 
294 aa  109  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000140856  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6856  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.8 
 
 
313 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0555121 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2466  DNA methylase N-4/N-6  30.48 
 
 
311 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2238  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.85 
 
 
304 aa  103  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000832138  hitchhiker  0.0000505476 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3693  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.48 
 
 
332 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00816735  hitchhiker  0.000000112456 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1392  putative type II DNA modification enzyme (methyltransferase)  25.67 
 
 
351 aa  100  3e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0204297  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2193  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.47 
 
 
359 aa  100  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3051  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.18 
 
 
305 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.766 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1962  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.04 
 
 
259 aa  99.4  5e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3210  DNA methylase N-4/N-6  27.57 
 
 
367 aa  99.4  6e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0828  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.95 
 
 
323 aa  99.4  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0750  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.46 
 
 
395 aa  99  8e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.296291  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2398  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.36 
 
 
313 aa  99  8e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0375  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.31 
 
 
373 aa  98.2  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.984822  hitchhiker  0.00505908 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1218  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.82 
 
 
376 aa  97.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1367  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.52 
 
 
360 aa  96.7  4e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1840  DNA methylase N-4/N-6  28.68 
 
 
380 aa  96.3  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0373756  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0763  DNA adenine methylase CcrM  28.02 
 
 
372 aa  96.7  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0702  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.67 
 
 
367 aa  95.5  9e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0606262  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0203  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.12 
 
 
319 aa  95.5  9e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2305  DNA methylase N-4/N-6  30.64 
 
 
304 aa  95.1  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6841  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.73 
 
 
301 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.463976 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3043  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.61 
 
 
375 aa  95.1  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00264807  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1810  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.79 
 
 
329 aa  94.7  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.729703  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1084  cell cycle regulated site-specific DNA-methyltransferase protein  27.44 
 
 
377 aa  94.4  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2880  putative modification methylase  29.41 
 
 
301 aa  94.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150564  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3573  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.75 
 
 
306 aa  94.7  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.116756  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2010  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.74 
 
 
370 aa  94  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0768  DNA methylase  29.62 
 
 
258 aa  93.2  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1720  N-6 adenine-specific DNA methylase  29.62 
 
 
282 aa  92.8  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1073  DNA methylase N-4/N-6  28.08 
 
 
377 aa  92.8  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.981822  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1173  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.3 
 
 
389 aa  92.8  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3349  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.92 
 
 
283 aa  93.2  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.206831  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3838  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.56 
 
 
311 aa  92.8  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1650  N-6 adenine-specific DNA methylase  29.62 
 
 
282 aa  92.8  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1859  N-6 adenine-specific DNA methylase  29.62 
 
 
282 aa  92.8  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.229539  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2444  DNA modification methylase RsrI  29.62 
 
 
282 aa  92.8  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.462592  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2306  DNA modification methylase RsrI  29.62 
 
 
282 aa  92.8  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.436701  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0530  DNA modification methylase RsrI  29.62 
 
 
282 aa  92.8  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.675032  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4366  DNA methylase N-4/N-6  27.76 
 
 
377 aa  92.8  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.436205  normal  0.0199247 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0024  adenine-specific methyltransferase  26.84 
 
 
368 aa  92.8  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.109862  normal  0.210092 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0680  N-6 adenine-specific DNA methylase  29.62 
 
 
259 aa  92.4  8e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846805  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2124  DNA methylase N-4/N-6  30.04 
 
 
283 aa  92  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.775437  normal  0.0115493 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0392  DNA methylase N-4/N-6  26.47 
 
 
367 aa  92  9e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.723409 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2231  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.71 
 
 
369 aa  92  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0921492  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3854  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.51 
 
 
283 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>