More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1826 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2518  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  75.39 
 
 
464 aa  689    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1826  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  100 
 
 
460 aa  931    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.478282 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6680  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  37.33 
 
 
644 aa  234  3e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000759129  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2495  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  37.43 
 
 
601 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3192  type III restriction-modification system, Mod subunit  37.47 
 
 
751 aa  218  2.9999999999999998e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.854684  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2793  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  37.47 
 
 
751 aa  218  2.9999999999999998e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1355  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  36.68 
 
 
378 aa  194  3e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0685753  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2179  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  34.52 
 
 
673 aa  194  4e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.199223  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0838  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  37.54 
 
 
459 aa  186  5e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1471  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  41.01 
 
 
276 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5436  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  38.85 
 
 
707 aa  182  8.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.81891 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0197  hypothetical protein  33.51 
 
 
646 aa  177  4e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0318  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  39.51 
 
 
282 aa  175  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1491  adenine specific DNA-methyltransferase  34.18 
 
 
779 aa  171  3e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00364069  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1043  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  35.43 
 
 
733 aa  169  7e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1071  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  34.31 
 
 
391 aa  166  9e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5892  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  36.18 
 
 
319 aa  166  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.720658  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0355  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  36 
 
 
289 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1080  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  38.6 
 
 
305 aa  165  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1840  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  38.57 
 
 
284 aa  163  7e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291507  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4064  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  37.07 
 
 
281 aa  157  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.461209  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0655  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  33.24 
 
 
442 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000525307  normal  0.106062 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1213  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  27.67 
 
 
470 aa  153  5e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0108  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  36.51 
 
 
287 aa  152  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.251085 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24470  adinene-specific DNA-methyltransferase  36.75 
 
 
677 aa  149  8e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3766  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  33.6 
 
 
599 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0871751  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3628  DNA methylase N-4/N-6  33.6 
 
 
599 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2786  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  34.67 
 
 
290 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269604  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1513  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  35.32 
 
 
286 aa  148  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.634742  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2506  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  34.45 
 
 
290 aa  148  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000291701 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0124  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  36.5 
 
 
303 aa  146  6e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0547  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.05 
 
 
752 aa  141  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.392041  normal  0.581045 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0708  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.79 
 
 
545 aa  141  3e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2706  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  32 
 
 
438 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4152  DNA methylase N-4/N-6  30.33 
 
 
544 aa  140  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4286  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.15 
 
 
447 aa  132  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1392  putative type II DNA modification enzyme (methyltransferase)  30 
 
 
351 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0204297  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0676  DNA methylase N-4/N-6  27.99 
 
 
520 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.635951 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1466  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.36 
 
 
906 aa  123  6e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0869  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.27 
 
 
505 aa  120  6e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52350  adenine specific DNA methylase N-4/N-6  25.93 
 
 
560 aa  118  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3323  DNA methylase  27.09 
 
 
542 aa  117  5e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.622136  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1112  type III restriction-modification system, methylase subunit  26.55 
 
 
587 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.350936  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1812  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  32.62 
 
 
273 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500335  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2276  adenine specific DNA methylase  29.36 
 
 
559 aa  109  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.403052  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2136  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  32.14 
 
 
273 aa  109  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113526  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1982  DNA-methyltransferase (DNA-modification methylase) protein  32.14 
 
 
270 aa  108  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0159066 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0436  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  37.1 
 
 
696 aa  108  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.231086  normal  0.907553 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0939  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.46 
 
 
884 aa  108  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0305  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25 
 
 
510 aa  106  9e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0567  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  26.97 
 
 
629 aa  106  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2305  DNA methylase N-4/N-6  33.07 
 
 
304 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2466  DNA methylase N-4/N-6  31.15 
 
 
311 aa  104  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3645  putative methyltransferase  28.27 
 
 
294 aa  103  5e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000318659  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1128  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  27.46 
 
 
643 aa  102  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2856  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.98 
 
 
938 aa  102  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0444  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.92 
 
 
294 aa  101  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00573028  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3693  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.68 
 
 
332 aa  100  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00816735  hitchhiker  0.000000112456 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3455  putative methyltransferase  27.92 
 
 
294 aa  100  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000495763  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3747  putative methyltransferase  27.92 
 
 
294 aa  100  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000140856  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03120  predicted methyltransferase  27.92 
 
 
294 aa  100  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.753742  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0444  putative methyltransferase  27.92 
 
 
294 aa  100  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0634628  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03071  hypothetical protein  27.92 
 
 
294 aa  100  6e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0088  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  22.94 
 
 
369 aa  100  8e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0580  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  26.4 
 
 
629 aa  100  8e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4579  putative methyltransferase  27.92 
 
 
294 aa  99  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026019  normal  0.14101 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3578  putative methyltransferase  28.27 
 
 
294 aa  98.6  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0177776  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3650  putative methyltransferase  28.27 
 
 
294 aa  98.6  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000365024  hitchhiker  0.00241657 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3684  putative methyltransferase  28.27 
 
 
294 aa  98.6  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220289  normal  0.0704128 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3577  putative methyltransferase  28.27 
 
 
294 aa  98.6  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00742062  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2238  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.24 
 
 
304 aa  98.6  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000832138  hitchhiker  0.0000505476 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4621  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.42 
 
 
283 aa  99  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0315645  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3747  putative methyltransferase  28.27 
 
 
294 aa  98.6  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00189132  normal  0.187537 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1828  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  30.6 
 
 
632 aa  97.8  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2124  DNA methylase N-4/N-6  28.95 
 
 
283 aa  97.8  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.775437  normal  0.0115493 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3557  putative methyltransferase  27.21 
 
 
294 aa  97.8  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00430538  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1946  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  30.67 
 
 
631 aa  96.7  8e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3854  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.04 
 
 
283 aa  95.5  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3349  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.04 
 
 
283 aa  95.5  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.206831  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1980  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  33.05 
 
 
547 aa  95.1  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.612228  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1548  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  29.46 
 
 
611 aa  94.7  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0237  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.37 
 
 
626 aa  94.7  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0500  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.25 
 
 
846 aa  94.7  3e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3569  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.96 
 
 
283 aa  94  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.570267  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4408  DNA methylase N-4/N-6  29.96 
 
 
283 aa  94  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3959  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.96 
 
 
283 aa  94  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135356  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1679  adenine-specific DNA methylase  25.83 
 
 
820 aa  93.2  9e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.140302  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2444  DNA modification methylase RsrI  29.89 
 
 
282 aa  92.8  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.462592  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2306  DNA modification methylase RsrI  29.89 
 
 
282 aa  92.8  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.436701  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1720  N-6 adenine-specific DNA methylase  29.89 
 
 
282 aa  92.8  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0768  DNA methylase  29.63 
 
 
258 aa  92.8  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0680  N-6 adenine-specific DNA methylase  30.26 
 
 
259 aa  92.8  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846805  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6856  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.43 
 
 
313 aa  92.8  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0555121 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0530  DNA modification methylase RsrI  29.89 
 
 
282 aa  92.8  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.675032  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1650  N-6 adenine-specific DNA methylase  29.89 
 
 
282 aa  92.8  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1859  N-6 adenine-specific DNA methylase  29.89 
 
 
282 aa  92.8  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.229539  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4169  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32.22 
 
 
553 aa  91.3  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4096  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.89 
 
 
545 aa  90.9  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.480555 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0041  type III DNA modification methyltransferase  33 
 
 
682 aa  89.7  9e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0203  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.99 
 
 
319 aa  89  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>