277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0500 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1691  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  83.81 
 
 
846 aa  1464    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.849133  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0500  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  100 
 
 
846 aa  1709    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1294  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  41.24 
 
 
1015 aa  499  1e-140  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474007  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1679  adenine-specific DNA methylase  32.82 
 
 
820 aa  380  1e-104  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.140302  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1840  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.72 
 
 
1019 aa  219  1e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0062  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.72 
 
 
1019 aa  219  1e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.218127  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1480  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.18 
 
 
1055 aa  208  3e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2068  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.92 
 
 
999 aa  202  3e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0397  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.35 
 
 
1028 aa  192  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00293449 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1539  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.56 
 
 
1077 aa  182  2.9999999999999997e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.648492 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52350  adenine specific DNA methylase N-4/N-6  30.59 
 
 
560 aa  169  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4096  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.53 
 
 
545 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.480555 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0593  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.25 
 
 
1073 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0676  DNA methylase N-4/N-6  31.23 
 
 
520 aa  162  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.635951 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4904  N4/N6-methyltransferase family protein  25.91 
 
 
1040 aa  159  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.658462  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0959  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.77 
 
 
1039 aa  157  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.524193  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0869  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.27 
 
 
505 aa  154  8.999999999999999e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0826  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.39 
 
 
1050 aa  148  4.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.927537  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4169  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.01 
 
 
553 aa  146  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6680  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.21 
 
 
644 aa  144  7e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000759129  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3656  adenine specific DNA methylase Mod  29.5 
 
 
567 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000129355  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1980  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.97 
 
 
547 aa  140  7e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.612228  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0346  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.68 
 
 
636 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0305  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.04 
 
 
510 aa  135  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3803  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  26.97 
 
 
566 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0197  hypothetical protein  27.13 
 
 
646 aa  132  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3323  DNA methylase  28.44 
 
 
542 aa  131  6e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.622136  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0655  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.66 
 
 
442 aa  124  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000525307  normal  0.106062 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0708  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.27 
 
 
545 aa  124  8e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0936  adenine specific DNA methylase MOD  25.63 
 
 
577 aa  120  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000403504  normal  0.65434 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2706  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.86 
 
 
438 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3192  type III restriction-modification system, Mod subunit  29.43 
 
 
751 aa  118  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.854684  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2793  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.43 
 
 
751 aa  118  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1491  adenine specific DNA-methyltransferase  27.51 
 
 
779 aa  115  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00364069  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1085  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.65 
 
 
540 aa  113  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2179  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  26.65 
 
 
673 aa  111  5e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.199223  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5436  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  27.81 
 
 
707 aa  111  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.81891 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4286  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.61 
 
 
447 aa  111  7.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1580  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.6 
 
 
570 aa  110  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1392  putative type II DNA modification enzyme (methyltransferase)  26.11 
 
 
351 aa  108  3e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0204297  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0436  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.03 
 
 
696 aa  108  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.231086  normal  0.907553 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0547  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.76 
 
 
752 aa  107  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.392041  normal  0.581045 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3766  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.54 
 
 
599 aa  105  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0871751  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3628  DNA methylase N-4/N-6  24.54 
 
 
599 aa  105  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0088  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  26.09 
 
 
369 aa  103  1e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2276  adenine specific DNA methylase  24.81 
 
 
559 aa  102  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.403052  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4152  DNA methylase N-4/N-6  28.47 
 
 
544 aa  102  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1043  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.42 
 
 
733 aa  102  3e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1355  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  29.39 
 
 
378 aa  100  8e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0685753  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1826  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.55 
 
 
460 aa  99.4  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.478282 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1548  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  25.14 
 
 
611 aa  97.1  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0838  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  25.55 
 
 
459 aa  95.9  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0972  adenine specific DNA methylase  26.82 
 
 
531 aa  94.4  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.223028  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2495  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.35 
 
 
601 aa  92.8  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0731  type III restriction/modification enzyme, methylase subunit  37.18 
 
 
675 aa  90.9  1e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2574  adenine specific DNA methylase Mod  34.38 
 
 
692 aa  89  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03955  methyltransferase  26.14 
 
 
543 aa  89  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4593  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  22.77 
 
 
624 aa  87.4  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1071  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.4 
 
 
391 aa  87  0.000000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0342  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  46.74 
 
 
581 aa  86.3  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0318  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  25.78 
 
 
282 aa  84.7  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1946  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  24.19 
 
 
631 aa  84.7  0.000000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2518  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  22.13 
 
 
464 aa  84.3  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0882  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  25.08 
 
 
542 aa  84  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1466  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  21.99 
 
 
906 aa  82.8  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24470  adinene-specific DNA-methyltransferase  26.48 
 
 
677 aa  82  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4390  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  23.95 
 
 
531 aa  82  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1004  methyltransferase  24.58 
 
 
526 aa  82  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2740  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.51 
 
 
609 aa  82  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00029702  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0200  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  22.72 
 
 
896 aa  80.1  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1419  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  26.25 
 
 
528 aa  79.3  0.0000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1828  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  22.66 
 
 
632 aa  76.6  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3086  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  35.51 
 
 
571 aa  77  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0848  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  22.53 
 
 
658 aa  76.6  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0241  DNA methylase N-4/N-6  21.34 
 
 
939 aa  74.7  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5299  DNA methylase domain protein  24.72 
 
 
643 aa  74.7  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.389542  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3047  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  22.41 
 
 
660 aa  71.2  0.00000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0939  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  21.56 
 
 
884 aa  70.9  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0237  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  22.54 
 
 
626 aa  69.7  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0099  adenine-specific DNA modification methyltransferase  24.27 
 
 
428 aa  69.3  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.145446  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3821  DNA modification methylase-like protein  55.77 
 
 
227 aa  68.9  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1463  adenine specific DNA methylase Mod-like protein  29.41 
 
 
633 aa  68.2  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2856  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  20.54 
 
 
938 aa  67.8  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4410  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  40.66 
 
 
374 aa  67.8  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1213  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  54.9 
 
 
470 aa  66.6  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0787  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  23.77 
 
 
649 aa  65.9  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0759094 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0519  DNA methylase N-4/N-6  22.88 
 
 
610 aa  65.9  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1911  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.26 
 
 
322 aa  65.1  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0543  DNA methylase N-4/N-6  23.67 
 
 
657 aa  65.1  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0263725  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0567  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  21.75 
 
 
629 aa  65.1  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1468  site-specific DNA-methyltransferase  43.66 
 
 
372 aa  64.7  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.661815  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0024  adenine-specific methyltransferase  45.83 
 
 
368 aa  65.1  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.109862  normal  0.210092 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0119  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  43.66 
 
 
372 aa  64.7  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.222875  normal  0.070794 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2208  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  21.04 
 
 
477 aa  64.3  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4576  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34.62 
 
 
382 aa  63.5  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0392  DNA methylase N-4/N-6  43.06 
 
 
367 aa  63.5  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.723409 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1471  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  40.3 
 
 
276 aa  63.5  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0066  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  43.66 
 
 
372 aa  63.5  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.711822  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1840  DNA methylase N-4/N-6  43.06 
 
 
380 aa  63.2  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0373756  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3343  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  39.36 
 
 
369 aa  63.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  hitchhiker  0.00000416126 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>