74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6814 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6814  hypothetical protein  100 
 
 		 433 aa  849    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.823873  normal  0.941535 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32.08 
 
 		 947 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3799  putative RNA methylase  26.33 
 
 		 393 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0328  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.7 
 
 		 383 aa  98.2  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1303  adenine-specific DNA methylase  25.89 
 
 		 418 aa  95.5  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404813  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2226  hypothetical protein  25.18 
 
 		 467 aa  86.7  8e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2251  hypothetical protein  27.37 
 
 		 393 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3798  putative RNA methylase  28.72 
 
 		 495 aa  76.6  0.0000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0894  hypothetical protein  27.67 
 
 		 445 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.118931  hitchhiker  0.00000342492 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1658  adenine-specific DNA methylase  25.24 
 
 		 416 aa  76.3  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000448906  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1725  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  21.46 
 
 		 524 aa  74.3  0.000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110429  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4397  hypothetical protein  23.34 
 
 		 475 aa  73.9  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.050702 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4038  putative RNA methylase  23.53 
 
 		 483 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00846703 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1456  putative RNA methylase  24.11 
 
 		 463 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3603  adenine-specific DNA methylase  27.68 
 
 		 453 aa  70.5  0.00000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5606  modification methylase, putative  24.54 
 
 		 438 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166814  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0068  hypothetical protein  27.09 
 
 		 464 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00010049  hitchhiker  0.00158155 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0931  adenine-specific DNA methylase  26.86 
 
 		 412 aa  68.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.316794  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0938  putative RNA methylase  25.21 
 
 		 461 aa  68.2  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000152524  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0909  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  21.55 
 
 		 535 aa  63.5  0.000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.90275  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1872  hypothetical protein  27.52 
 
 		 433 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.682405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0737  hypothetical protein  29.77 
 
 		 407 aa  60.5  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00870561  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1918  putative modification methylase  25.16 
 
 		 353 aa  58.9  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00266275  hitchhiker  0.00000000000360377 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0684  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  22.84 
 
 		 528 aa  58.5  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3939  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.35 
 
 		 633 aa  58.2  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0374  hypothetical protein  36.84 
 
 		 146 aa  57.4  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000208638  normal  0.261256 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1426  hypothetical protein  22.89 
 
 		 432 aa  57.4  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5607  modification methylase, putative  23.53 
 
 		 430 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0295584  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0325  hypothetical protein  21.53 
 
 		 431 aa  56.2  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.103576  hitchhiker  0.00000188519 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3926  putative DNA modification methylase  26.29 
 
 		 345 aa  54.7  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2284  hypothetical protein  51.16 
 
 		 450 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1242  modification methylase  27.88 
 
 		 441 aa  54.3  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00503065  hitchhiker  0.00000000592753 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2389  putative DNA modification methylase  25.5 
 
 		 369 aa  54.3  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.198556  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0329  hypothetical protein  24.28 
 
 		 417 aa  53.9  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2731  methyltransferase DNA modification enzyme  26.96 
 
 		 410 aa  53.5  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0843  Site-specific DNA-methyltransferase (cytosine- N(4)-specific)  17.75 
 
 		 412 aa  53.9  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140978  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4009  hypothetical protein  28.75 
 
 		 512 aa  53.1  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000517991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26692  predicted protein  26.67 
 
 		 411 aa  50.8  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0281046  decreased coverage  0.00284905 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0332  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  20.82 
 
 		 530 aa  50.8  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00994221  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2145  protein of unknown function DUF1156  48.94 
 
 		 937 aa  50.1  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000164543  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3181  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  22.26 
 
 		 482 aa  49.7  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1791  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  53.66 
 
 		 703 aa  49.3  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1717  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  20.41 
 
 		 739 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000410476  hitchhiker  0.00177802 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2190  hypothetical protein  54.05 
 
 		 792 aa  47.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0950  hypothetical protein  18.18 
 
 		 501 aa  47.8  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0387274 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5156  hypothetical protein  21.43 
 
 		 393 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000726262 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3423  hypothetical protein  38.55 
 
 		 256 aa  47  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3051  methyltransferase DNA modification enzyme  24.68 
 
 		 421 aa  46.6  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3593  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  56.76 
 
 		 372 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.316349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3347  adenine-specific DNA methylase  47.5 
 
 		 878 aa  46.6  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1122  DNA methyltransferase  24.22 
 
 		 416 aa  46.2  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.909173  normal  0.0173084 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1848  hypothetical protein  40 
 
 		 968 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1948  hypothetical protein  40 
 
 		 731 aa  45.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2761  adenine-specific DNA methylase  47.5 
 
 		 892 aa  45.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0682  hypothetical protein  40.74 
 
 		 848 aa  45.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2196  adenine-specific DNA methylase  45 
 
 		 747 aa  45.1  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0382  protein of unknown function DUF1156  47.5 
 
 		 894 aa  44.7  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.41417  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2279  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  34.94 
 
 		 651 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.132856  hitchhiker  0.000043664 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6722  putative RNA methylase  36.08 
 
 		 292 aa  44.3  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.121582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1753  hypothetical protein  48.65 
 
 		 960 aa  44.3  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2991  hypothetical protein  40.74 
 
 		 933 aa  44.3  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0317555  normal  0.296182 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2206  methyltransferase DNA modification enzyme  24.09 
 
 		 414 aa  44.7  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.612218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1233  hypothetical protein  43.75 
 
 		 438 aa  44.3  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241867  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3012  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  22.05 
 
 		 477 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2281  adenine-specific DNA methylase  55.56 
 
 		 751 aa  43.9  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0186187  hitchhiker  0.00483181 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3873  hypothetical protein  22.36 
 
 		 439 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3922  hypothetical protein  22.36 
 
 		 439 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0070396  normal  0.271721 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4077  hypothetical protein  30 
 
 		 614 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.180847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1080  hypothetical protein  32.95 
 
 		 317 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.118177  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1395  hypothetical protein  51.43 
 
 		 194 aa  43.1  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0407  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  24.5 
 
 		 476 aa  43.5  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.144423 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0198  hypothetical protein  44.44 
 
 		 933 aa  43.5  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.213354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2184  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  58.62 
 
 		 371 aa  43.1  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0490664  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0953  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  46.51 
 
 		 372 aa  43.1  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.752338  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>