45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0325 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0325  hypothetical protein  100 
 
 
431 aa  896    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.103576  hitchhiker  0.00000188519 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2828  hypothetical protein  31.98 
 
 
474 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5607  modification methylase, putative  31.57 
 
 
430 aa  152  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0295584  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1917  putative modification methylase  26.56 
 
 
482 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0419467  hitchhiker  0.0000000000400101 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00410  adenine-specific DNA modification methyltransferase  27.81 
 
 
412 aa  134  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1233  hypothetical protein  26.91 
 
 
438 aa  123  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241867  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1833  hypothetical protein  25 
 
 
444 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0068  hypothetical protein  24.23 
 
 
464 aa  98.2  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00010049  hitchhiker  0.00158155 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0407  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  25 
 
 
476 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.144423 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3181  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  24.52 
 
 
482 aa  95.9  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0227  adenine-specific DNA modification methyltransferase  25.42 
 
 
877 aa  95.1  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0765559  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3012  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  24.56 
 
 
477 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1000  DNA methyltransferase  25.92 
 
 
472 aa  90.9  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1122  DNA methyltransferase  22.44 
 
 
416 aa  90.5  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.909173  normal  0.0173084 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1872  hypothetical protein  21.68 
 
 
433 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.682405  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0958  hypothetical protein  24.61 
 
 
408 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00607753 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1918  putative modification methylase  24.73 
 
 
353 aa  84.7  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00266275  hitchhiker  0.00000000000360377 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3873  hypothetical protein  24.62 
 
 
439 aa  83.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3922  hypothetical protein  24.62 
 
 
439 aa  83.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0070396  normal  0.271721 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4009  hypothetical protein  27.7 
 
 
512 aa  82.4  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000517991  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4397  hypothetical protein  22.48 
 
 
475 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.050702 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4787  hypothetical protein  21.8 
 
 
441 aa  79.7  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2284  hypothetical protein  21.81 
 
 
450 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1658  adenine-specific DNA methylase  24.44 
 
 
416 aa  72.4  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000448906  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1303  adenine-specific DNA methylase  21.74 
 
 
418 aa  70.9  0.00000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404813  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4359  hypothetical protein  23.15 
 
 
425 aa  70.1  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000708265  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3603  adenine-specific DNA methylase  24.18 
 
 
453 aa  68.2  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3799  putative RNA methylase  25.6 
 
 
393 aa  65.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0931  adenine-specific DNA methylase  23.26 
 
 
412 aa  63.9  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.316794  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1306  hypothetical protein  21.96 
 
 
414 aa  62  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000125163  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0894  hypothetical protein  20.29 
 
 
445 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.118931  hitchhiker  0.00000342492 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5606  modification methylase, putative  24.33 
 
 
438 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166814  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3691  hypothetical protein  22.76 
 
 
313 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.454673  normal  0.0109558 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6814  hypothetical protein  24.12 
 
 
433 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.823873  normal  0.941535 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3798  putative RNA methylase  24.6 
 
 
495 aa  54.7  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1426  hypothetical protein  21.25 
 
 
432 aa  54.7  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0642  hypothetical protein  20.51 
 
 
435 aa  52.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4038  putative RNA methylase  21.35 
 
 
483 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00846703 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.95 
 
 
947 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1725  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  32.69 
 
 
524 aa  51.6  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110429  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2389  putative DNA modification methylase  21.37 
 
 
369 aa  46.6  0.0009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.198556  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2251  hypothetical protein  20.77 
 
 
393 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1456  putative RNA methylase  25.56 
 
 
463 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1246  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  51.52 
 
 
293 aa  43.9  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0940338  hitchhiker  0.00345461 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1518  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  54.55 
 
 
284 aa  43.1  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>