41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3012 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3012  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  100 
 
 		 477 aa  985    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0407  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  70.38 
 
 		 476 aa  701    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.144423 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3181  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  56.96 
 
 		 482 aa  523  1e-147  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5607  modification methylase, putative  26.52 
 
 		 430 aa  131  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0295584  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00410  adenine-specific DNA modification methyltransferase  25.17 
 
 		 412 aa  104  4e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1917  putative modification methylase  24.03 
 
 		 482 aa  103  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0419467  hitchhiker  0.0000000000400101 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1833  hypothetical protein  24.84 
 
 		 444 aa  96.7  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0325  hypothetical protein  24.56 
 
 		 431 aa  95.5  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.103576  hitchhiker  0.00000188519 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0227  adenine-specific DNA modification methyltransferase  23.81 
 
 		 877 aa  86.3  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0765559  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5606  modification methylase, putative  22.78 
 
 		 438 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166814  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4397  hypothetical protein  23.67 
 
 		 475 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.050702 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3873  hypothetical protein  24.41 
 
 		 439 aa  77.4  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3922  hypothetical protein  24.41 
 
 		 439 aa  77.4  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0070396  normal  0.271721 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4787  hypothetical protein  22.82 
 
 		 441 aa  76.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0068  hypothetical protein  22.25 
 
 		 464 aa  70.9  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00010049  hitchhiker  0.00158155 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1233  hypothetical protein  22.22 
 
 		 438 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241867  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1872  hypothetical protein  29.14 
 
 		 433 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.682405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2284  hypothetical protein  28.92 
 
 		 450 aa  60.5  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0958  hypothetical protein  21.48 
 
 		 408 aa  60.5  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00607753 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4359  hypothetical protein  21.57 
 
 		 425 aa  59.7  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000708265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4038  putative RNA methylase  26.26 
 
 		 483 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00846703 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2828  hypothetical protein  28.74 
 
 		 474 aa  55.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2251  hypothetical protein  22.55 
 
 		 393 aa  53.5  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1918  putative modification methylase  23.16 
 
 		 353 aa  52.8  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00266275  hitchhiker  0.00000000000360377 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4009  hypothetical protein  39.13 
 
 		 512 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000517991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3691  hypothetical protein  21.88 
 
 		 313 aa  50.4  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.454673  normal  0.0109558 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0909  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  34.52 
 
 		 535 aa  50.1  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.90275  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1725  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  33.64 
 
 		 524 aa  50.1  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110429  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0684  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  37.35 
 
 		 528 aa  49.3  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0642  hypothetical protein  47.92 
 
 		 435 aa  47.4  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1426  hypothetical protein  31.11 
 
 		 432 aa  47.4  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1122  DNA methyltransferase  21.21 
 
 		 416 aa  46.6  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.909173  normal  0.0173084 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5156  hypothetical protein  42.31 
 
 		 393 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000726262 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1658  adenine-specific DNA methylase  36.54 
 
 		 416 aa  45.1  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000448906  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0931  adenine-specific DNA methylase  21.8 
 
 		 412 aa  45.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.316794  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0894  hypothetical protein  31.34 
 
 		 445 aa  45.1  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.118931  hitchhiker  0.00000342492 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0332  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  34.72 
 
 		 530 aa  44.7  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00994221  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2404  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.37 
 
 		 305 aa  44.7  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3798  putative RNA methylase  23.4 
 
 		 495 aa  44.3  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6814  hypothetical protein  22.05 
 
 		 433 aa  43.9  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.823873  normal  0.941535 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0938  putative RNA methylase  22.41 
 
 		 461 aa  43.1  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000152524  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>