50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4787 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4787  hypothetical protein  100 
 
 		 441 aa  906    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3873  hypothetical protein  69.09 
 
 		 439 aa  638    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3922  hypothetical protein  69.09 
 
 		 439 aa  638    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0070396  normal  0.271721 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0894  hypothetical protein  34.83 
 
 		 445 aa  232  1e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.118931  hitchhiker  0.00000342492 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1122  DNA methyltransferase  30.62 
 
 		 416 aa  186  6e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.909173  normal  0.0173084 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1306  hypothetical protein  31.04 
 
 		 414 aa  168  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000125163  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0958  hypothetical protein  29.51 
 
 		 408 aa  162  9e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00607753 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1000  DNA methyltransferase  26.11 
 
 		 472 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3691  hypothetical protein  29.57 
 
 		 313 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.454673  normal  0.0109558 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1833  hypothetical protein  27.05 
 
 		 444 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2284  hypothetical protein  24.12 
 
 		 450 aa  96.7  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1872  hypothetical protein  25.47 
 
 		 433 aa  96.3  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.682405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0068  hypothetical protein  22.97 
 
 		 464 aa  93.6  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00010049  hitchhiker  0.00158155 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4397  hypothetical protein  22.47 
 
 		 475 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.050702 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1658  adenine-specific DNA methylase  23.7 
 
 		 416 aa  82.4  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000448906  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0325  hypothetical protein  21.8 
 
 		 431 aa  79.7  0.00000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.103576  hitchhiker  0.00000188519 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3181  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  24.41 
 
 		 482 aa  79  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1233  hypothetical protein  24.05 
 
 		 438 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241867  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3012  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  22.82 
 
 		 477 aa  76.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0407  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  22.89 
 
 		 476 aa  74.3  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.144423 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5606  modification methylase, putative  21.24 
 
 		 438 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166814  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1917  putative modification methylase  23.35 
 
 		 482 aa  72  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0419467  hitchhiker  0.0000000000400101 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0931  adenine-specific DNA methylase  20.94 
 
 		 412 aa  71.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.316794  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1303  adenine-specific DNA methylase  22.91 
 
 		 418 aa  67  0.0000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404813  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2828  hypothetical protein  22.96 
 
 		 474 aa  65.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3603  adenine-specific DNA methylase  22.71 
 
 		 453 aa  65.9  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3799  putative RNA methylase  24.05 
 
 		 393 aa  65.5  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1456  putative RNA methylase  24.04 
 
 		 463 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00410  adenine-specific DNA modification methyltransferase  21.07 
 
 		 412 aa  61.6  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3798  putative RNA methylase  22.06 
 
 		 495 aa  61.6  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5607  modification methylase, putative  22.94 
 
 		 430 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0295584  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0227  adenine-specific DNA modification methyltransferase  23.57 
 
 		 877 aa  57  0.0000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0765559  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0642  hypothetical protein  22.72 
 
 		 435 aa  55.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0684  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.36 
 
 		 528 aa  54.3  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4359  hypothetical protein  22.49 
 
 		 425 aa  54.3  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000708265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1918  putative modification methylase  18.98 
 
 		 353 aa  53.5  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00266275  hitchhiker  0.00000000000360377 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0938  putative RNA methylase  21.47 
 
 		 461 aa  52.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000152524  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1426  hypothetical protein  22.47 
 
 		 432 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.17 
 
 		 947 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4009  hypothetical protein  30.12 
 
 		 512 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000517991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3926  putative DNA modification methylase  23.83 
 
 		 345 aa  48.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0328  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  22.43 
 
 		 383 aa  47.8  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0332  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  28.75 
 
 		 530 aa  47.8  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00994221  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3593  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.16 
 
 		 372 aa  47.4  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.316349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0803  DNA methylase N-4/N-6  35.16 
 
 		 436 aa  46.6  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0747571  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2187  hypothetical protein  29.58 
 
 		 110 aa  46.6  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2389  putative DNA modification methylase  31.75 
 
 		 369 aa  45.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.198556  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2206  methyltransferase DNA modification enzyme  38.16 
 
 		 414 aa  43.9  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.612218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1725  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  22.4 
 
 		 524 aa  43.5  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110429  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0953  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.49 
 
 		 372 aa  43.1  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.752338  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>