73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0931 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0931  adenine-specific DNA methylase  100 
 
 		 412 aa  857    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.316794  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1303  adenine-specific DNA methylase  44.66 
 
 		 418 aa  329  7e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404813  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1658  adenine-specific DNA methylase  38.3 
 
 		 416 aa  268  2e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000448906  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0843  Site-specific DNA-methyltransferase (cytosine- N(4)-specific)  38.19 
 
 		 412 aa  253  5.000000000000001e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140978  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3603  adenine-specific DNA methylase  31.4 
 
 		 453 aa  200  5e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1242  modification methylase  27.96 
 
 		 441 aa  156  7e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00503065  hitchhiker  0.00000000592753 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5606  modification methylase, putative  28.5 
 
 		 438 aa  145  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166814  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0329  hypothetical protein  28.84 
 
 		 417 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4038  putative RNA methylase  23.3 
 
 		 483 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00846703 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3799  putative RNA methylase  24.54 
 
 		 393 aa  100  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  22.82 
 
 		 947 aa  99.8  8e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1918  putative modification methylase  23.01 
 
 		 353 aa  93.6  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00266275  hitchhiker  0.00000000000360377 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1456  putative RNA methylase  22.84 
 
 		 463 aa  93.2  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2226  hypothetical protein  26.52 
 
 		 467 aa  92.8  9e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2251  hypothetical protein  23.83 
 
 		 393 aa  87.4  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3922  hypothetical protein  23.73 
 
 		 439 aa  79.7  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0070396  normal  0.271721 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3873  hypothetical protein  23.73 
 
 		 439 aa  79.7  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3798  putative RNA methylase  27.3 
 
 		 495 aa  75.9  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5607  modification methylase, putative  23.84 
 
 		 430 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0295584  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4787  hypothetical protein  20.94 
 
 		 441 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1833  hypothetical protein  22.49 
 
 		 444 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0068  hypothetical protein  23.34 
 
 		 464 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00010049  hitchhiker  0.00158155 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6814  hypothetical protein  25.89 
 
 		 433 aa  67  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.823873  normal  0.941535 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1917  putative modification methylase  22.61 
 
 		 482 aa  66.2  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0419467  hitchhiker  0.0000000000400101 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1725  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  21.21 
 
 		 524 aa  65.9  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110429  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0374  hypothetical protein  38.71 
 
 		 146 aa  66.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000208638  normal  0.261256 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0325  hypothetical protein  23.26 
 
 		 431 aa  63.9  0.000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.103576  hitchhiker  0.00000188519 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1426  hypothetical protein  22.52 
 
 		 432 aa  63.2  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1122  DNA methyltransferase  21.58 
 
 		 416 aa  62.4  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.909173  normal  0.0173084 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0328  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.45 
 
 		 383 aa  61.6  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0909  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  33.68 
 
 		 535 aa  62  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.90275  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0684  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  22.26 
 
 		 528 aa  62  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0332  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  21.23 
 
 		 530 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00994221  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0938  putative RNA methylase  26.56 
 
 		 461 aa  61.6  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000152524  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0958  hypothetical protein  22.69 
 
 		 408 aa  60.1  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00607753 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0894  hypothetical protein  20.32 
 
 		 445 aa  57.8  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.118931  hitchhiker  0.00000342492 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4077  hypothetical protein  23.37 
 
 		 614 aa  57  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.180847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4009  hypothetical protein  25 
 
 		 512 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000517991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0306  putative RNA methylase  30.41 
 
 		 259 aa  55.1  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0220171  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3275  adenine-specific DNA methylase  34 
 
 		 596 aa  53.1  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.762851  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1000  DNA methyltransferase  21.16 
 
 		 472 aa  53.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2284  hypothetical protein  35.29 
 
 		 450 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00410  adenine-specific DNA modification methyltransferase  21.26 
 
 		 412 aa  50.8  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2206  methyltransferase DNA modification enzyme  24.32 
 
 		 414 aa  50.1  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.612218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1753  hypothetical protein  42.31 
 
 		 960 aa  50.1  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5156  hypothetical protein  33.33 
 
 		 393 aa  49.7  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000726262 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0103  putative RNA methylase  39.62 
 
 		 310 aa  49.3  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.802972  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0737  hypothetical protein  24.81 
 
 		 407 aa  49.3  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00870561  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6722  putative RNA methylase  34.21 
 
 		 292 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.121582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3691  hypothetical protein  22.56 
 
 		 313 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.454673  normal  0.0109558 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1681  cyclase family protein  33.85 
 
 		 366 aa  47.4  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.259173  hitchhiker  0.0000210949 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3593  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.91 
 
 		 372 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.316349  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00415  adenine-specific DNA modification methyltransferase  28.95 
 
 		 374 aa  47  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.530575  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1872  hypothetical protein  30.43 
 
 		 433 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.682405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26692  predicted protein  32.18 
 
 		 411 aa  46.6  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0281046  decreased coverage  0.00284905 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0642  hypothetical protein  24.49 
 
 		 435 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2184  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40.38 
 
 		 371 aa  45.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0490664  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4397  hypothetical protein  33.82 
 
 		 475 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.050702 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2321  putative RNA methylase  39.66 
 
 		 318 aa  45.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.334147  normal  0.512947 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0227  adenine-specific DNA modification methyltransferase  29.41 
 
 		 877 aa  45.1  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0765559  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3012  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  21.8 
 
 		 477 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3987  hypothetical protein  38.98 
 
 		 967 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.375617 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1233  hypothetical protein  20.66 
 
 		 438 aa  44.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241867  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0407  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  21.94 
 
 		 476 aa  44.3  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.144423 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4087  putative RNA methylase  42 
 
 		 329 aa  44.3  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134174  normal  0.0349253 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1210  putative RNA methylase  28.57 
 
 		 322 aa  43.9  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00394731 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1059  putative RNA methylase  35.85 
 
 		 317 aa  43.9  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000310515  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3926  putative DNA modification methylase  37.5 
 
 		 345 aa  43.5  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1775  putative RNA methylase  37.25 
 
 		 315 aa  43.1  0.008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0151  putative RNA methylase  38.33 
 
 		 356 aa  43.1  0.008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6843  putative RNA methylase  48.72 
 
 		 305 aa  43.1  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0223663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0953  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.43 
 
 		 372 aa  43.1  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.752338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1395  hypothetical protein  37.5 
 
 		 194 aa  42.7  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>