92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2321 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2321  putative RNA methylase  100 
 
 		 318 aa  645    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.334147  normal  0.512947 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1059  putative RNA methylase  56.96 
 
 		 317 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000310515  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0420  hypothetical protein  50.95 
 
 		 317 aa  312  5.999999999999999e-84  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0587292 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1210  putative RNA methylase  51.55 
 
 		 322 aa  308  9e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00394731 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0125  putative RNA methylase  46.52 
 
 		 317 aa  290  2e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1006  putative RNA methylase  39.09 
 
 		 346 aa  204  2e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1330  N2-methylguanosine tRNA methyltransferase  39.26 
 
 		 355 aa  203  3e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.315731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1623  putative RNA methylase  35.48 
 
 		 344 aa  188  1e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.236365  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1249  putative RNA methylase  37.01 
 
 		 343 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0722  putative RNA methylase  37.37 
 
 		 334 aa  149  6e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0132  putative RNA methylase  32.97 
 
 		 371 aa  141  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1154  putative RNA methylase  32.29 
 
 		 364 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2630  putative RNA methylase  35.42 
 
 		 356 aa  135  8e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0801  putative RNA methylase  31.64 
 
 		 351 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1149  putative RNA methylase  30.81 
 
 		 350 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0482589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1864  putative RNA methylase  31.67 
 
 		 365 aa  125  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.382861  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1526  putative RNA methylase  30.53 
 
 		 350 aa  124  1e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0667  putative RNA methylase  27.78 
 
 		 367 aa  107  2e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.107618  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0103  putative RNA methylase  31.22 
 
 		 310 aa  106  5e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.802972  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0700  putative RNA methylase  30.8 
 
 		 374 aa  89.4  7e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.46275  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1775  putative RNA methylase  29.26 
 
 		 315 aa  87.4  3e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2015  putative RNA methylase  31.61 
 
 		 314 aa  86.3  6e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.128985  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1789  putative RNA methylase  35.06 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3585  putative RNA methylase  28.94 
 
 		 352 aa  68.9  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.626531  hitchhiker  0.0000715951 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37849  predicted protein  29.8 
 
 		 469 aa  67  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00619482  hitchhiker  0.00164206 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0987  hypothetical protein  25.35 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.86692e-62 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0801  methyltransferase  25.78 
 
 		 317 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0020  putative RNA methylase  32.35 
 
 		 359 aa  64.7  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0899  hypothetical protein  25.35 
 
 		 284 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000386994  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0852  hypothetical protein  25.78 
 
 		 317 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4390  hypothetical protein  26.04 
 
 		 317 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.043324  unclonable  2.45562e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0941  hypothetical protein  25.78 
 
 		 317 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258982  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1080  hypothetical protein  26.06 
 
 		 317 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.118177  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1026  putative RNA methylase  33.33 
 
 		 379 aa  60.5  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  34.06 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0793  putative RNA methylase  25.35 
 
 		 317 aa  59.7  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.314828  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0555  putative RNA methylase  30.61 
 
 		 336 aa  59.7  0.00000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2993  putative RNA methylase  28.4 
 
 		 350 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.021793 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0797  methyltransferase  26.64 
 
 		 317 aa  58.9  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.212906  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2276  putative RNA methylase  28.12 
 
 		 349 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0592  putative RNA methylase  40 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0985  hypothetical protein  26.05 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0179865  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3569  putative RNA methylase  29.61 
 
 		 430 aa  55.8  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  43.33 
 
 		 947 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0253  putative RNA methylase  25.22 
 
 		 360 aa  54.3  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1659  putative RNA methylase  35.29 
 
 		 224 aa  53.1  0.000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.69991  hitchhiker  0.00475931 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0467  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.37 
 
 		 231 aa  52.4  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.197938  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.06 
 
 		 252 aa  51.6  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0686  putative RNA methylase  36.47 
 
 		 224 aa  51.6  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.502689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  34.58 
 
 		 238 aa  50.1  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0537  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.71 
 
 		 235 aa  50.1  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.383652 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.94 
 
 		 235 aa  48.5  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.61 
 
 		 230 aa  48.9  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1303  adenine-specific DNA methylase  42.31 
 
 		 418 aa  48.5  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404813  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00740  hypothetical protein  27.15 
 
 		 475 aa  48.5  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.635907  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6722  putative RNA methylase  30 
 
 		 292 aa  47.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.121582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07360  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  30.71 
 
 		 231 aa  47  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.065272 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2801  putative RNA methylase  28.57 
 
 		 368 aa  47  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  25 
 
 		 504 aa  47.4  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  33.59 
 
 		 276 aa  46.6  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  26.7 
 
 		 505 aa  46.2  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 225 aa  46.2  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0931  adenine-specific DNA methylase  39.66 
 
 		 412 aa  45.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.316794  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0422  HemK family modification methylase  35.92 
 
 		 299 aa  45.8  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5606  modification methylase, putative  35.48 
 
 		 438 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166814  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10450  RNA methylase family UPF0020 protein (AFU_orthologue; AFUA_4G12140)  26.96 
 
 		 499 aa  44.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3232  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.47 
 
 		 240 aa  44.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.0251873 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  35 
 
 		 305 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0286  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  36.76 
 
 		 271 aa  44.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.684049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1099  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.9 
 
 		 233 aa  44.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.729785  normal  0.0384798 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0763  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.16 
 
 		 230 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  35.92 
 
 		 364 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0777  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.16 
 
 		 230 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.974721 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1456  putative RNA methylase  30.17 
 
 		 463 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0757  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.16 
 
 		 230 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50882  predicted protein  33.33 
 
 		 437 aa  44.3  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.933008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1068  methyltransferase type 11  31.45 
 
 		 417 aa  44.3  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0306  putative RNA methylase  26 
 
 		 259 aa  44.3  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0220171  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2582  putative RNA methylase  27.22 
 
 		 362 aa  44.3  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1582  putative RNA methylase  31.54 
 
 		 357 aa  43.5  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4560  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30 
 
 		 258 aa  43.5  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3051  methyltransferase DNA modification enzyme  47.83 
 
 		 421 aa  43.5  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3798  putative RNA methylase  34.62 
 
 		 495 aa  43.1  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07146  sterol 24-c-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03630)  27.74 
 
 		 377 aa  43.1  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0655  D-alanine--D-alanine ligase  30.18 
 
 		 663 aa  42.7  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24382  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2731  methyltransferase DNA modification enzyme  41.82 
 
 		 410 aa  42.7  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0938  putative RNA methylase  36.54 
 
 		 461 aa  42.7  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000152524  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1638  Methyltransferase type 11  31.53 
 
 		 269 aa  42.7  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal  0.179609 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  28 
 
 		 263 aa  42.7  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0218  putative RNA methylase  26.8 
 
 		 348 aa  42.7  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000547055 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  28.87 
 
 		 208 aa  42.4  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3603  adenine-specific DNA methylase  37.04 
 
 		 453 aa  42.4  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>