95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2582 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2582  putative RNA methylase  100 
 
 		 362 aa  715    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2801  putative RNA methylase  86.89 
 
 		 368 aa  569  1e-161  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0020  putative RNA methylase  36.49 
 
 		 359 aa  226  6e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1026  putative RNA methylase  39.5 
 
 		 379 aa  224  1e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3569  putative RNA methylase  34.9 
 
 		 430 aa  183  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0253  putative RNA methylase  28.87 
 
 		 360 aa  116  5e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1582  putative RNA methylase  30.5 
 
 		 357 aa  112  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2993  putative RNA methylase  29.64 
 
 		 350 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.021793 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2276  putative RNA methylase  39.38 
 
 		 349 aa  107  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3585  putative RNA methylase  38.41 
 
 		 352 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.626531  hitchhiker  0.0000715951 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6055  Methyltransferase type 11  30.67 
 
 		 360 aa  89.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0420  hypothetical protein  28.17 
 
 		 317 aa  75.1  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0587292 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1330  N2-methylguanosine tRNA methyltransferase  35.25 
 
 		 355 aa  68.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.315731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1302  putative RNA methylase  26.85 
 
 		 510 aa  63.9  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0555  putative RNA methylase  29.09 
 
 		 336 aa  63.5  0.000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0293  putative RNA methylase  25.36 
 
 		 377 aa  62  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.107871  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1081  N6-adenine-specific DNA methylase  24.1 
 
 		 376 aa  60.8  0.00000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.117372  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1059  putative RNA methylase  29.76 
 
 		 317 aa  58.5  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000310515  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1210  putative RNA methylase  32.59 
 
 		 322 aa  57  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00394731 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1154  putative RNA methylase  30.19 
 
 		 364 aa  57  0.0000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15560  predicted N6-adenine-specific DNA methylase  29.41 
 
 		 339 aa  57  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1249  putative RNA methylase  27.52 
 
 		 343 aa  56.6  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1816  methyltransferase, putative  26.14 
 
 		 375 aa  55.5  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.961633  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0125  putative RNA methylase  30.08 
 
 		 317 aa  55.1  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2321  putative RNA methylase  27.22 
 
 		 318 aa  55.1  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.334147  normal  0.512947 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2102  putative methyltransferase  26.14 
 
 		 375 aa  54.3  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486637  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2015  putative RNA methylase  26.45 
 
 		 314 aa  53.5  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.128985  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1720  putative RNA methylase  25.74 
 
 		 333 aa  51.6  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0118315  decreased coverage  0.000010347 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0667  putative RNA methylase  27.22 
 
 		 367 aa  51.6  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.107618  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1149  putative RNA methylase  28.47 
 
 		 350 aa  51.2  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0482589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0722  putative RNA methylase  30.58 
 
 		 334 aa  50.8  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1526  putative RNA methylase  28.47 
 
 		 350 aa  51.2  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0801  putative RNA methylase  34.52 
 
 		 351 aa  50.4  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1658  adenine-specific DNA methylase  33.33 
 
 		 416 aa  50.1  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000448906  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1623  putative RNA methylase  28.87 
 
 		 344 aa  50.1  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.236365  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1378  N6-adenine-specific DNA methylase  26.82 
 
 		 377 aa  49.3  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0747  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.04 
 
 		 236 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1789  putative RNA methylase  33.33 
 
 		 304 aa  48.1  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2381  putative RNA methylase  27.17 
 
 		 380 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1006  putative RNA methylase  32.84 
 
 		 346 aa  48.5  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1282  putative RNA methylase  40 
 
 		 379 aa  47.8  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000499107  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3705  putative RNA methylase  29.74 
 
 		 387 aa  47.4  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1484  putative RNA methylase  40 
 
 		 379 aa  47.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0140153  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1729  hypothetical protein  40 
 
 		 379 aa  47  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188996  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1584  hypothetical protein  40 
 
 		 379 aa  47  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1654  hypothetical protein  40 
 
 		 379 aa  47  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0207358 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1440  methyltransferase  40 
 
 		 379 aa  47  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1468  hypothetical protein  40 
 
 		 379 aa  47  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1690  hypothetical protein  40 
 
 		 381 aa  47  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1441  methyltransferase  40 
 
 		 379 aa  47  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00219601  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1533  hypothetical protein  25.86 
 
 		 381 aa  47  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1504  hypothetical protein  25.86 
 
 		 381 aa  47  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2470  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  25.53 
 
 		 711 aa  46.6  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000238626  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1904  putative RNA methylase  39.47 
 
 		 384 aa  46.2  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0103  putative RNA methylase  30.19 
 
 		 310 aa  46.2  0.0008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.802972  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0306  putative RNA methylase  27.01 
 
 		 259 aa  46.2  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0220171  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0529  methyltransferase small  35.25 
 
 		 211 aa  45.8  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3727  hypothetical protein  38.46 
 
 		 379 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00339425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0971  putative RNA methylase  22.84 
 
 		 384 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.143771  normal  0.522905 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3086  hypothetical protein  27.16 
 
 		 391 aa  45.4  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1617  hypothetical protein  38.46 
 
 		 379 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.595181  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4087  putative RNA methylase  36.36 
 
 		 329 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134174  normal  0.0349253 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1015  hypothetical protein  21.61 
 
 		 378 aa  45.4  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.842194  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1421  putative RNA methylase  40 
 
 		 375 aa  45.1  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1864  putative RNA methylase  31.25 
 
 		 365 aa  45.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.382861  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01614  S-adenosyl-methionine-sterol-C-methyltransferas (AFU_orthologue; AFUA_4G09190)  31.3 
 
 		 387 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.787149  normal  0.132042 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1100  putative RNA methylase  25.6 
 
 		 329 aa  45.4  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6722  putative RNA methylase  34.38 
 
 		 292 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.121582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5232  methyltransferase type 11  37.9 
 
 		 352 aa  44.3  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1254  putative RNA methylase  23.63 
 
 		 330 aa  44.3  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.00904523  normal  0.667506 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1113  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 319 aa  44.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0629842  normal  0.748747 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4111  putative RNA methylase  30.9 
 
 		 317 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  31.86 
 
 		 209 aa  44.3  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1456  putative RNA methylase  40.91 
 
 		 463 aa  43.9  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  38.6 
 
 		 295 aa  44.3  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4748  hypothetical protein  33.09 
 
 		 273 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000104492 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08600  putative RNA methylase  30.48 
 
 		 379 aa  43.9  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1020  N6-adenine-specific DNA methylase  27.44 
 
 		 374 aa  44.3  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3798  putative RNA methylase  33.73 
 
 		 495 aa  43.5  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0408  putative RNA methylase  23.99 
 
 		 334 aa  43.5  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1551  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.57 
 
 		 718 aa  43.5  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.728211  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40 
 
 		 947 aa  43.5  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0925  putative RNA methylase  30.26 
 
 		 398 aa  43.5  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1362  hypothetical protein  26.86 
 
 		 484 aa  43.5  0.006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3643  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.73 
 
 		 730 aa  43.1  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.698608 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2096  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.73 
 
 		 730 aa  43.1  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.110427 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1608  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.73 
 
 		 730 aa  43.1  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1087  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.08 
 
 		 248 aa  43.1  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0234174  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0700  putative RNA methylase  30.32 
 
 		 374 aa  43.1  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.46275  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2355  putative RNA methylase  27.98 
 
 		 393 aa  43.1  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00636349  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2785  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.26 
 
 		 226 aa  42.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.846293 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3610  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.4 
 
 		 236 aa  42.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0152496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3009  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.15 
 
 		 725 aa  42.7  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.30746  hitchhiker  0.0000000000188031 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  38.39 
 
 		 295 aa  42.7  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2072  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  25 
 
 		 713 aa  42.7  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>