116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1720 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1720  putative RNA methylase  100 
 
 		 333 aa  683    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0118315  decreased coverage  0.000010347 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0408  putative RNA methylase  90.06 
 
 		 334 aa  619  1e-176  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1254  putative RNA methylase  73.94 
 
 		 330 aa  507  1e-143  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.00904523  normal  0.667506 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1100  putative RNA methylase  75.68 
 
 		 329 aa  491  9.999999999999999e-139  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0555  putative RNA methylase  29.03 
 
 		 336 aa  100  5e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0151  putative RNA methylase  27.79 
 
 		 356 aa  97.8  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1371  putative RNA methylase  36.32 
 
 		 408 aa  72  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0253  putative RNA methylase  27.21 
 
 		 360 aa  68.9  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2381  putative RNA methylase  26.7 
 
 		 380 aa  65.9  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1330  N2-methylguanosine tRNA methyltransferase  27.54 
 
 		 355 aa  63.9  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.315731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0971  putative RNA methylase  24.21 
 
 		 384 aa  64.3  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.143771  normal  0.522905 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0293  putative RNA methylase  24.6 
 
 		 377 aa  63.9  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.107871  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0801  putative RNA methylase  24.87 
 
 		 351 aa  62  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1149  putative RNA methylase  23.74 
 
 		 350 aa  60.5  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0482589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3994  putative RNA methylase  23.72 
 
 		 375 aa  60.1  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000218402  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1904  putative RNA methylase  25.14 
 
 		 384 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0287  putative RNA methylase  22.7 
 
 		 379 aa  57.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1261  putative RNA methylase  22.67 
 
 		 375 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1292  putative RNA methylase  22.67 
 
 		 375 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.963614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0020  putative RNA methylase  31.91 
 
 		 359 aa  56.6  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2102  putative methyltransferase  24.73 
 
 		 375 aa  56.2  0.0000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486637  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1026  putative RNA methylase  24.77 
 
 		 379 aa  56.2  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1816  methyltransferase, putative  24.73 
 
 		 375 aa  55.5  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.961633  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0028  hypothetical protein  24.01 
 
 		 400 aa  55.5  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138235  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1526  putative RNA methylase  23.56 
 
 		 350 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0494  putative RNA methylase  23.58 
 
 		 376 aa  55.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00380676 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0398  putative RNA methylase:THUMP  23.08 
 
 		 389 aa  54.3  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0174402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0249  putative RNA methylase  21.39 
 
 		 374 aa  54.3  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0789594  normal  0.0276638 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1154  putative RNA methylase  22.34 
 
 		 364 aa  54.3  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0667  putative RNA methylase  28.25 
 
 		 367 aa  54.3  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.107618  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1623  putative RNA methylase  26.09 
 
 		 344 aa  53.9  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.236365  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0722  putative RNA methylase  26.29 
 
 		 334 aa  53.9  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1504  hypothetical protein  22.22 
 
 		 381 aa  53.9  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1533  hypothetical protein  22.22 
 
 		 381 aa  53.9  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0477  putative RNA methylase  23.58 
 
 		 376 aa  53.9  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2630  putative RNA methylase  26.53 
 
 		 356 aa  53.9  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1015  hypothetical protein  21.43 
 
 		 378 aa  53.5  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.842194  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1864  putative RNA methylase  25.42 
 
 		 365 aa  53.1  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.382861  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1282  putative RNA methylase  22.81 
 
 		 379 aa  52.8  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000499107  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1690  hypothetical protein  22.36 
 
 		 381 aa  52  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0303  hypothetical protein  23.75 
 
 		 384 aa  52  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00482447  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1468  hypothetical protein  22.05 
 
 		 379 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1440  methyltransferase  22.05 
 
 		 379 aa  51.6  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1441  methyltransferase  22.05 
 
 		 379 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00219601  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1584  hypothetical protein  22.05 
 
 		 379 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2993  putative RNA methylase  23.4 
 
 		 350 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.021793 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1729  hypothetical protein  22.05 
 
 		 379 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188996  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1654  hypothetical protein  22.05 
 
 		 379 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0207358 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2429  putative RNA methylase  24.06 
 
 		 384 aa  52  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.365067  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2552  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  23.38 
 
 		 706 aa  50.8  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3569  putative RNA methylase  31.51 
 
 		 430 aa  50.8  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1987  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  23.38 
 
 		 706 aa  51.2  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2641  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  23.38 
 
 		 706 aa  51.2  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1617  hypothetical protein  22.05 
 
 		 379 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.595181  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3727  hypothetical protein  22.05 
 
 		 379 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00339425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0282  hypothetical protein  22.22 
 
 		 388 aa  50.4  0.00004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.439028  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1249  putative RNA methylase  23.95 
 
 		 343 aa  50.8  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3585  putative RNA methylase  28.07 
 
 		 352 aa  50.1  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.626531  hitchhiker  0.0000715951 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1006  putative RNA methylase  27.75 
 
 		 346 aa  49.7  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5876  putative RNA methylase  24.49 
 
 		 398 aa  49.3  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0137254  normal  0.681553 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0889  putative RNA methylase  24.87 
 
 		 375 aa  49.3  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3086  hypothetical protein  24.53 
 
 		 391 aa  48.9  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1378  N6-adenine-specific DNA methylase  24.87 
 
 		 377 aa  48.9  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0224  putative RNA methylase  27.61 
 
 		 434 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.219183  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0708  putative RNA methylase  27.61 
 
 		 434 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0675  putative RNA methylase  27.61 
 
 		 434 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.936037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3242  putative RNA methylase  23.22 
 
 		 382 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000019855  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2276  putative RNA methylase  28.1 
 
 		 349 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1743  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  22.39 
 
 		 706 aa  47.8  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.171189  hitchhiker  0.000865534 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0259  putative RNA methylase  31.17 
 
 		 480 aa  47.8  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6055  Methyltransferase type 11  29.69 
 
 		 360 aa  47.4  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1362  hypothetical protein  22.07 
 
 		 484 aa  47  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2374  THUMP domain-containing protein  32.93 
 
 		 430 aa  46.6  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3387  N6-adenine-specific DNA methylase  32.93 
 
 		 430 aa  46.6  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0288  THUMP domain-containing protein  32.93 
 
 		 430 aa  46.6  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1150  THUMP domain-containing protein  32.93 
 
 		 430 aa  46.6  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3344  THUMP domain-containing protein  32.93 
 
 		 430 aa  46.6  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615958  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3378  THUMP domain-containing protein  32.93 
 
 		 430 aa  46.6  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.270297  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2557  THUMP domain-containing protein  32.93 
 
 		 430 aa  46.6  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08600  putative RNA methylase  22.98 
 
 		 379 aa  46.2  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1265  THUMP domain-containing protein  31.71 
 
 		 430 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1059  putative RNA methylase  29.25 
 
 		 317 aa  45.4  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000310515  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1484  putative RNA methylase  21.35 
 
 		 379 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0140153  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2537  putative RNA methylase  24.7 
 
 		 425 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1763  putative RNA methylase  23.15 
 
 		 371 aa  45.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3795  putative RNA methylase  32.47 
 
 		 433 aa  44.3  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.405369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2614  methyltransferase small  30.43 
 
 		 202 aa  44.3  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1582  putative RNA methylase  27.15 
 
 		 357 aa  44.3  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0420  hypothetical protein  28.57 
 
 		 317 aa  43.9  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0587292 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1882  thiamine biosynthesis protein ThiI  50 
 
 		 474 aa  44.3  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.379133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0132  putative RNA methylase  24.33 
 
 		 371 aa  44.3  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0074  putative RNA methylase  21.7 
 
 		 376 aa  43.9  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0598  putative RNA methylase  32.47 
 
 		 432 aa  43.9  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116947  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0623  putative RNA methylase  32.47 
 
 		 432 aa  43.5  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4785  Methyltransferase type 11  32.56 
 
 		 267 aa  43.9  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2967  putative RNA methylase  32.94 
 
 		 419 aa  43.5  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1812  THUMP domain-containing protein  29.66 
 
 		 360 aa  43.5  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2939  putative RNA methylase  22.13 
 
 		 390 aa  43.5  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000322588  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2495  putative RNA methylase  24.35 
 
 		 387 aa  43.5  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256792  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2214  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.17 
 
 		 724 aa  43.5  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.301767  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>