247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0420 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0420  hypothetical protein  100 
 
 
317 aa  657    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0587292 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1059  putative RNA methylase  51.42 
 
 
317 aa  323  2e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000310515  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2321  putative RNA methylase  50.95 
 
 
318 aa  312  5.999999999999999e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.334147  normal  0.512947 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0125  putative RNA methylase  45.57 
 
 
317 aa  301  1e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1210  putative RNA methylase  47.66 
 
 
322 aa  300  2e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00394731 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1006  putative RNA methylase  40.43 
 
 
346 aa  192  6e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1330  N2-methylguanosine tRNA methyltransferase  35.14 
 
 
355 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.315731  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1623  putative RNA methylase  33.62 
 
 
344 aa  187  3e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.236365  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0132  putative RNA methylase  32.15 
 
 
371 aa  157  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0722  putative RNA methylase  33.33 
 
 
334 aa  153  4e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1249  putative RNA methylase  33.62 
 
 
343 aa  152  5e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1864  putative RNA methylase  31.52 
 
 
365 aa  147  3e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.382861  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1154  putative RNA methylase  29.34 
 
 
364 aa  133  5e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2630  putative RNA methylase  33.46 
 
 
356 aa  132  9e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1149  putative RNA methylase  35.18 
 
 
350 aa  125  7e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0482589  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0801  putative RNA methylase  29.8 
 
 
351 aa  125  1e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1526  putative RNA methylase  29.89 
 
 
350 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0103  putative RNA methylase  28.22 
 
 
310 aa  113  5e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.802972  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1775  putative RNA methylase  31.71 
 
 
315 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0667  putative RNA methylase  31.5 
 
 
367 aa  108  1e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.107618  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2015  putative RNA methylase  28.66 
 
 
314 aa  98.2  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.128985  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0700  putative RNA methylase  27.97 
 
 
374 aa  97.4  3e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.46275  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1789  putative RNA methylase  33.17 
 
 
304 aa  85.1  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1026  putative RNA methylase  37.4 
 
 
379 aa  74.3  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3585  putative RNA methylase  30.72 
 
 
352 aa  70.5  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.626531  hitchhiker  0.0000715951 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1080  hypothetical protein  27.27 
 
 
317 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.118177  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4390  hypothetical protein  27.73 
 
 
317 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.043324  unclonable  2.45562e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0941  hypothetical protein  27.73 
 
 
317 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258982  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0852  hypothetical protein  27.73 
 
 
317 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0899  hypothetical protein  27.73 
 
 
284 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000386994  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0987  hypothetical protein  26.3 
 
 
297 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.86692e-62 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0801  methyltransferase  26.82 
 
 
317 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0793  putative RNA methylase  26.82 
 
 
317 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.314828  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0797  methyltransferase  26.82 
 
 
317 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.212906  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0555  putative RNA methylase  28.99 
 
 
336 aa  67  0.0000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0985  hypothetical protein  24.57 
 
 
284 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0179865  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0020  putative RNA methylase  33.56 
 
 
359 aa  64.7  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2582  putative RNA methylase  28.17 
 
 
362 aa  63.9  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0686  putative RNA methylase  35.54 
 
 
224 aa  63.2  0.000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.502689  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37849  predicted protein  27.74 
 
 
469 aa  63.2  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00619482  hitchhiker  0.00164206 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45681  predicted protein  30.38 
 
 
591 aa  62.8  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0592  putative RNA methylase  32.28 
 
 
225 aa  62.4  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2993  putative RNA methylase  30.94 
 
 
350 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.021793 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1582  putative RNA methylase  29.71 
 
 
357 aa  60.8  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  26.86 
 
 
225 aa  59.7  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0537  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.03 
 
 
235 aa  58.9  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.383652 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0253  putative RNA methylase  30.56 
 
 
360 aa  58.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3232  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.63 
 
 
240 aa  58.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.0251873 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  30.61 
 
 
266 aa  57  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  36.99 
 
 
947 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1659  putative RNA methylase  35 
 
 
224 aa  56.2  0.0000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.69991  hitchhiker  0.00475931 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2460  methyltransferase type 11  30.28 
 
 
260 aa  54.7  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.930517  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8055  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.25 
 
 
231 aa  53.9  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1205  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  29.22 
 
 
249 aa  54.3  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.836419  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2276  putative RNA methylase  28.78 
 
 
349 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1087  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.21 
 
 
248 aa  53.5  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0234174  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.56 
 
 
252 aa  53.1  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  28.07 
 
 
251 aa  53.1  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3132  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  28.24 
 
 
258 aa  53.1  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0671  Methyltransferase type 11  28.36 
 
 
220 aa  52  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0467  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.91 
 
 
231 aa  52  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.197938  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0429  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.22 
 
 
249 aa  52.4  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.56 
 
 
235 aa  52.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6722  putative RNA methylase  30 
 
 
292 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.121582  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2801  putative RNA methylase  26.61 
 
 
368 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  30.65 
 
 
246 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  33.61 
 
 
237 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4421  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.85 
 
 
236 aa  51.6  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5925  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32 
 
 
248 aa  50.8  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0289  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  31.78 
 
 
261 aa  51.2  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0757  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.36 
 
 
230 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0466  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.78 
 
 
261 aa  51.2  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000612243 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2827  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.24 
 
 
258 aa  50.4  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0976107 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  28.67 
 
 
233 aa  50.4  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0698  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  28.14 
 
 
246 aa  50.4  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0519  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.81 
 
 
229 aa  50.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07360  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  29.31 
 
 
231 aa  50.1  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.065272 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0763  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.44 
 
 
230 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0732  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.93 
 
 
229 aa  50.1  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0360  methyltransferase type 11  31.15 
 
 
275 aa  49.7  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0777  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.44 
 
 
230 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.974721 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  30.25 
 
 
242 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3798  putative RNA methylase  35.85 
 
 
495 aa  49.7  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2017  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  31.08 
 
 
248 aa  49.3  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.95818  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2562  methyltransferase type 11  35.92 
 
 
227 aa  49.3  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000154268  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0485  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.57 
 
 
249 aa  49.3  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.693247  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5711  Methyltransferase type 11  29.81 
 
 
265 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0938  putative RNA methylase  34.55 
 
 
461 aa  49.3  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000152524  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4088  Methyltransferase type 11  29.75 
 
 
244 aa  49.3  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  30.28 
 
 
257 aa  49.3  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0972  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.33 
 
 
233 aa  48.9  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0673  methyltransferase type 11  31.67 
 
 
253 aa  48.5  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1099  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.59 
 
 
233 aa  48.9  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.729785  normal  0.0384798 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0058  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  31.85 
 
 
239 aa  49.3  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  26.26 
 
 
239 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  26.77 
 
 
265 aa  48.9  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  26.26 
 
 
239 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2013  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.85 
 
 
241 aa  48.9  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  27.05 
 
 
255 aa  48.5  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  26.26 
 
 
239 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>