34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1659 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1659  putative RNA methylase  100 
 
 
224 aa  454  1e-127  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.69991  hitchhiker  0.00475931 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0686  putative RNA methylase  65.92 
 
 
224 aa  317  1e-85  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.502689  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1984  putative RNA methylase  66.37 
 
 
227 aa  293  2e-78  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0592  putative RNA methylase  61.64 
 
 
225 aa  285  4e-76  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2015  putative RNA methylase  27.23 
 
 
314 aa  74.7  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.128985  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1154  putative RNA methylase  31.01 
 
 
364 aa  68.9  0.00000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0103  putative RNA methylase  40.86 
 
 
310 aa  67.8  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.802972  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1149  putative RNA methylase  29.88 
 
 
350 aa  67  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0482589  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1526  putative RNA methylase  29.01 
 
 
350 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1789  putative RNA methylase  31.53 
 
 
304 aa  67.4  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0667  putative RNA methylase  27.95 
 
 
367 aa  66.6  0.0000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.107618  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0801  putative RNA methylase  28.05 
 
 
351 aa  66.2  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1775  putative RNA methylase  28.03 
 
 
315 aa  63.9  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0722  putative RNA methylase  33.09 
 
 
334 aa  60.1  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00740  hypothetical protein  35 
 
 
475 aa  58.9  0.00000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.635907  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1006  putative RNA methylase  39.08 
 
 
346 aa  56.6  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1059  putative RNA methylase  37.65 
 
 
317 aa  56.2  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000310515  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0420  hypothetical protein  35 
 
 
317 aa  56.2  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0587292 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1330  N2-methylguanosine tRNA methyltransferase  35.96 
 
 
355 aa  54.7  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.315731  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0700  putative RNA methylase  31.94 
 
 
374 aa  53.9  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.46275  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1623  putative RNA methylase  33.65 
 
 
344 aa  53.9  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.236365  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2321  putative RNA methylase  35.29 
 
 
318 aa  53.1  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.334147  normal  0.512947 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45681  predicted protein  32.43 
 
 
591 aa  52.4  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1210  putative RNA methylase  36.47 
 
 
322 aa  52.4  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00394731 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10450  RNA methylase family UPF0020 protein (AFU_orthologue; AFUA_4G12140)  27.81 
 
 
499 aa  48.1  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0615  putative RNA methylase  25.39 
 
 
247 aa  47.4  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1249  putative RNA methylase  34.34 
 
 
343 aa  47.4  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1864  putative RNA methylase  32.8 
 
 
365 aa  47  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.382861  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50882  predicted protein  29.81 
 
 
437 aa  45.1  0.0008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.933008  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2630  putative RNA methylase  34.34 
 
 
356 aa  43.9  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0744  methyltransferase  32.58 
 
 
288 aa  43.9  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.274994  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0125  putative RNA methylase  26.44 
 
 
317 aa  43.1  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2108  precorrin-6B methylase 2-like protein  39.66 
 
 
181 aa  42.7  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.538853  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0020  putative RNA methylase  31.73 
 
 
359 aa  42.7  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>