131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1154 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_1154  putative RNA methylase  100 
 
 
364 aa  736    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0801  putative RNA methylase  69.14 
 
 
351 aa  502  1e-141  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1526  putative RNA methylase  68 
 
 
350 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1149  putative RNA methylase  66.86 
 
 
350 aa  486  1e-136  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0482589  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0667  putative RNA methylase  53.82 
 
 
367 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.107618  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1330  N2-methylguanosine tRNA methyltransferase  32.87 
 
 
355 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.315731  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0125  putative RNA methylase  30.75 
 
 
317 aa  158  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1623  putative RNA methylase  28.49 
 
 
344 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.236365  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1006  putative RNA methylase  31.84 
 
 
346 aa  153  4e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2321  putative RNA methylase  32.29 
 
 
318 aa  139  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.334147  normal  0.512947 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1210  putative RNA methylase  31.53 
 
 
322 aa  138  1e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00394731 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1059  putative RNA methylase  29.71 
 
 
317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000310515  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0420  hypothetical protein  29.34 
 
 
317 aa  133  6e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0587292 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0103  putative RNA methylase  34.4 
 
 
310 aa  124  2e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.802972  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1864  putative RNA methylase  27.34 
 
 
365 aa  110  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.382861  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0722  putative RNA methylase  26.64 
 
 
334 aa  107  3e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1249  putative RNA methylase  26.79 
 
 
343 aa  107  4e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0132  putative RNA methylase  28.04 
 
 
371 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2630  putative RNA methylase  25.45 
 
 
356 aa  98.6  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2015  putative RNA methylase  27.76 
 
 
314 aa  95.9  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.128985  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1775  putative RNA methylase  28.41 
 
 
315 aa  93.6  5e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0700  putative RNA methylase  29.36 
 
 
374 aa  89.4  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.46275  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1789  putative RNA methylase  30.13 
 
 
304 aa  85.1  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0686  putative RNA methylase  31.65 
 
 
224 aa  75.5  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.502689  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45681  predicted protein  31.11 
 
 
591 aa  70.5  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0020  putative RNA methylase  28.5 
 
 
359 aa  70.1  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1659  putative RNA methylase  31.01 
 
 
224 aa  68.9  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.69991  hitchhiker  0.00475931 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0592  putative RNA methylase  29.38 
 
 
225 aa  68.9  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37849  predicted protein  24.71 
 
 
469 aa  63.5  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00619482  hitchhiker  0.00164206 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46959  predicted protein  28.14 
 
 
460 aa  62.8  0.000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.897224  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0555  putative RNA methylase  23.11 
 
 
336 aa  62.4  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0151  putative RNA methylase  27.49 
 
 
356 aa  60.5  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1026  putative RNA methylase  27.89 
 
 
379 aa  59.7  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0801  methyltransferase  26.46 
 
 
317 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0985  hypothetical protein  27.22 
 
 
284 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0179865  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0852  hypothetical protein  26.46 
 
 
317 aa  57.4  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0987  hypothetical protein  26.46 
 
 
297 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.86692e-62 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0871  hypothetical protein  29.81 
 
 
281 aa  57  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50882  predicted protein  29.46 
 
 
437 aa  57  0.0000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.933008  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0899  hypothetical protein  26.46 
 
 
284 aa  56.6  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000386994  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0408  putative RNA methylase  22.84 
 
 
334 aa  56.2  0.0000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0941  hypothetical protein  25.93 
 
 
317 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258982  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4390  hypothetical protein  25.93 
 
 
317 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.043324  unclonable  2.45562e-26 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2429  putative RNA methylase  24.32 
 
 
384 aa  55.8  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.365067  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0971  putative RNA methylase  25.15 
 
 
384 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.143771  normal  0.522905 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0610  restriction modification system DNA specificity subunit  33.05 
 
 
730 aa  55.5  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1080  hypothetical protein  25.4 
 
 
317 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.118177  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2778  N-6 DNA methylase  27.86 
 
 
405 aa  55.1  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.63238e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0793  putative RNA methylase  25.4 
 
 
317 aa  54.7  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.314828  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1218  protein of unknown function Met10  33.88 
 
 
389 aa  54.7  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0747272  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0366  putative RNA methylase  26.74 
 
 
380 aa  54.3  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000203497  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1720  putative RNA methylase  22.34 
 
 
333 aa  54.3  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0118315  decreased coverage  0.000010347 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0028  hypothetical protein  21.63 
 
 
400 aa  53.9  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138235  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1984  putative RNA methylase  28.12 
 
 
227 aa  54.3  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0306  putative RNA methylase  32.35 
 
 
259 aa  53.9  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0220171  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0577  putative RNA methylase  30.26 
 
 
209 aa  53.9  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0475078  hitchhiker  0.00520466 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00740  hypothetical protein  24.09 
 
 
475 aa  53.9  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.635907  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2939  putative RNA methylase  22.63 
 
 
390 aa  53.1  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000322588  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1282  putative RNA methylase  24.47 
 
 
379 aa  53.5  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000499107  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0293  putative RNA methylase  27.04 
 
 
377 aa  53.1  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.107871  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0797  methyltransferase  26.63 
 
 
317 aa  53.1  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.212906  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0552  methyltransferase small  29.31 
 
 
380 aa  52.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2993  putative RNA methylase  30.19 
 
 
350 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.021793 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10450  RNA methylase family UPF0020 protein (AFU_orthologue; AFUA_4G12140)  27.5 
 
 
499 aa  51.6  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1015  hypothetical protein  24.55 
 
 
378 aa  51.6  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.842194  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1038  putative RNA methylase  34.62 
 
 
249 aa  52  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1600  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  23.67 
 
 
708 aa  50.4  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2035  putative RNA methylase  20.1 
 
 
395 aa  50.8  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000306959  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1367  protein of unknown function Met10  29.31 
 
 
380 aa  50.8  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1690  hypothetical protein  23.79 
 
 
381 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1468  hypothetical protein  23.79 
 
 
379 aa  50.1  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1440  methyltransferase  23.79 
 
 
379 aa  50.1  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1441  methyltransferase  23.79 
 
 
379 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00219601  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1584  hypothetical protein  23.79 
 
 
379 aa  50.1  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1654  hypothetical protein  23.79 
 
 
379 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0207358 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1729  hypothetical protein  23.79 
 
 
379 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188996  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1617  hypothetical protein  23.79 
 
 
379 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.595181  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3727  hypothetical protein  23.79 
 
 
379 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00339425  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2582  putative RNA methylase  31.52 
 
 
362 aa  50.1  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1484  putative RNA methylase  22.7 
 
 
379 aa  49.7  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0140153  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1254  putative RNA methylase  21.03 
 
 
330 aa  48.9  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.00904523  normal  0.667506 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1421  putative RNA methylase  26.42 
 
 
375 aa  49.3  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2801  putative RNA methylase  28.46 
 
 
368 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1032  putative RNA methylase  26.9 
 
 
399 aa  48.1  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1658  adenine-specific DNA methylase  37.5 
 
 
416 aa  48.1  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000448906  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0286  SAM-dependent methyltransferase  28.16 
 
 
380 aa  48.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2276  putative RNA methylase  27.36 
 
 
349 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6722  putative RNA methylase  26.36 
 
 
292 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.121582  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2995  N-6 DNA methylase  28.4 
 
 
707 aa  48.5  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00439445  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0303  hypothetical protein  22.77 
 
 
384 aa  47.4  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00482447  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.31 
 
 
947 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1725  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.27 
 
 
524 aa  47.4  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110429  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0006  methyltransferase small  23.81 
 
 
209 aa  47  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08600  putative RNA methylase  25 
 
 
379 aa  47  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1939  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.65 
 
 
375 aa  46.6  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000888828  hitchhiker  0.0000001156 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0282  hypothetical protein  26.15 
 
 
388 aa  46.2  0.0008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.439028  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1090  protein of unknown function Met10  31.5 
 
 
391 aa  46.6  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339583  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1236  putative RNA methylase  26.97 
 
 
385 aa  45.4  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.286379 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3084  putative RNA methylase  23.63 
 
 
378 aa  46.2  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0180  putative RNA methylase  27.32 
 
 
340 aa  45.8  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.504589  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>