21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_46959 on replicon NC_011680
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011680  PHATRDRAFT_46959  predicted protein  100 
 
 
460 aa  947    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.897224  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45681  predicted protein  28.16 
 
 
591 aa  65.1  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1154  putative RNA methylase  28.14 
 
 
364 aa  62.8  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0555  putative RNA methylase  25.74 
 
 
336 aa  54.3  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0801  putative RNA methylase  25.94 
 
 
351 aa  53.9  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1330  N2-methylguanosine tRNA methyltransferase  24.4 
 
 
355 aa  53.5  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.315731  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0987  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.67 
 
 
285 aa  50.4  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1526  putative RNA methylase  26.11 
 
 
350 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37849  predicted protein  24.02 
 
 
469 aa  49.3  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00619482  hitchhiker  0.00164206 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1623  putative RNA methylase  23.68 
 
 
344 aa  48.9  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.236365  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1149  putative RNA methylase  25.21 
 
 
350 aa  48.9  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0482589  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2448  modification methylase, HemK family  27.85 
 
 
361 aa  47  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10450  RNA methylase family UPF0020 protein (AFU_orthologue; AFUA_4G12140)  23.14 
 
 
499 aa  47  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2015  putative RNA methylase  24.33 
 
 
314 aa  46.2  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.128985  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0218  putative RNA methylase  29.67 
 
 
348 aa  45.8  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000547055 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2920  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.95 
 
 
309 aa  45.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1249  putative RNA methylase  28.03 
 
 
343 aa  44.7  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0667  putative RNA methylase  26.4 
 
 
367 aa  44.3  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.107618  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0420  hypothetical protein  26.87 
 
 
317 aa  44.7  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0587292 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0103  putative RNA methylase  23.6 
 
 
310 aa  44.3  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.802972  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0610  restriction modification system DNA specificity subunit  28.57 
 
 
730 aa  43.5  0.009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>