80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0555 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0555  putative RNA methylase  100 
 
 		 336 aa  677    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1254  putative RNA methylase  30.97 
 
 		 330 aa  108  1e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.00904523  normal  0.667506 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0408  putative RNA methylase  30.03 
 
 		 334 aa  105  8e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1720  putative RNA methylase  29.03 
 
 		 333 aa  100  5e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0118315  decreased coverage  0.000010347 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1100  putative RNA methylase  29.77 
 
 		 329 aa  94.7  2e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0020  putative RNA methylase  36.05 
 
 		 359 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1059  putative RNA methylase  31.93 
 
 		 317 aa  77.8  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000310515  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1330  N2-methylguanosine tRNA methyltransferase  29.86 
 
 		 355 aa  76.6  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.315731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0151  putative RNA methylase  23.84 
 
 		 356 aa  75.9  0.0000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0253  putative RNA methylase  30.65 
 
 		 360 aa  70.1  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0667  putative RNA methylase  23.69 
 
 		 367 aa  69.3  0.00000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.107618  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1623  putative RNA methylase  26.75 
 
 		 344 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.236365  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0420  hypothetical protein  28.99 
 
 		 317 aa  67  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0587292 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1149  putative RNA methylase  25.45 
 
 		 350 aa  66.2  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0482589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0125  putative RNA methylase  27.95 
 
 		 317 aa  65.9  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1582  putative RNA methylase  32.89 
 
 		 357 aa  65.5  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0801  putative RNA methylase  24.14 
 
 		 351 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2015  putative RNA methylase  28.31 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.128985  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1210  putative RNA methylase  30.23 
 
 		 322 aa  62.8  0.000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00394731 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1006  putative RNA methylase  35.44 
 
 		 346 aa  62  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1154  putative RNA methylase  23.11 
 
 		 364 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3585  putative RNA methylase  28.93 
 
 		 352 aa  62  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.626531  hitchhiker  0.0000715951 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2993  putative RNA methylase  25.91 
 
 		 350 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.021793 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2582  putative RNA methylase  30.23 
 
 		 362 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2321  putative RNA methylase  30.61 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.334147  normal  0.512947 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2801  putative RNA methylase  32.71 
 
 		 368 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1526  putative RNA methylase  23.63 
 
 		 350 aa  57  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0722  putative RNA methylase  28.89 
 
 		 334 aa  57  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0218  putative RNA methylase  29.89 
 
 		 348 aa  56.2  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000547055 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3569  putative RNA methylase  30.19 
 
 		 430 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08600  putative RNA methylase  24.58 
 
 		 379 aa  55.1  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46959  predicted protein  25.74 
 
 		 460 aa  54.3  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.897224  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1775  putative RNA methylase  23.6 
 
 		 315 aa  52  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6055  Methyltransferase type 11  35.4 
 
 		 360 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1249  putative RNA methylase  32.35 
 
 		 343 aa  52.4  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0103  putative RNA methylase  24.5 
 
 		 310 aa  52  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.802972  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  29.03 
 
 		 286 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  29.03 
 
 		 286 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2276  putative RNA methylase  30.57 
 
 		 349 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1026  putative RNA methylase  26.45 
 
 		 379 aa  48.9  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2593  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.08 
 
 		 250 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00547032  decreased coverage  0.0000000226487 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15560  predicted N6-adenine-specific DNA methylase  29.24 
 
 		 339 aa  48.5  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1338  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  35.04 
 
 		 250 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0007  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  35.04 
 
 		 250 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0615  putative RNA methylase  29.08 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1763  putative RNA methylase  22.77 
 
 		 371 aa  48.1  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0365  HemK family modification methylase  27.78 
 
 		 286 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0366  putative RNA methylase  25.91 
 
 		 380 aa  47.4  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000203497  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3665  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  34.91 
 
 		 331 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2630  putative RNA methylase  25.54 
 
 		 356 aa  47  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1789  putative RNA methylase  27.94 
 
 		 304 aa  46.6  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0700  putative RNA methylase  26.3 
 
 		 374 aa  46.2  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.46275  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2359  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.36 
 
 		 237 aa  46.2  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1864  putative RNA methylase  26.28 
 
 		 365 aa  45.4  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.382861  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1165  methyltransferase small  28.45 
 
 		 210 aa  45.8  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0025369  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2939  putative RNA methylase  22.8 
 
 		 390 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000322588  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41240  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  33.64 
 
 		 333 aa  44.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0354958  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2005  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  22.16 
 
 		 701 aa  44.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.391349  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0058  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  28.49 
 
 		 239 aa  44.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  33.01 
 
 		 267 aa  44.3  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0711  ribosomal RNA small subunit methyltransferase D  26.05 
 
 		 392 aa  44.3  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.850348  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1127  methyltransferase small  28.45 
 
 		 210 aa  44.3  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000198355  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1816  N6-adenine-specific DNA methylase  23.51 
 
 		 384 aa  44.3  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0979861  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0180  putative RNA methylase  23.04 
 
 		 340 aa  44.3  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.504589  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0023  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.86 
 
 		 707 aa  44.7  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0287  putative RNA methylase  24.58 
 
 		 379 aa  43.9  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00740  hypothetical protein  30.61 
 
 		 475 aa  43.9  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.635907  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2102  putative methyltransferase  26.69 
 
 		 375 aa  43.5  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486637  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1816  methyltransferase, putative  26.69 
 
 		 375 aa  43.5  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.961633  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0520  methyltransferase small  33.33 
 
 		 210 aa  43.5  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1081  N6-adenine-specific DNA methylase  20.91 
 
 		 376 aa  43.1  0.006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.117372  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3084  putative RNA methylase  21.88 
 
 		 378 aa  43.1  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2473  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  25.3 
 
 		 711 aa  43.1  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00287682 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0592  putative RNA methylase  31.03 
 
 		 225 aa  43.1  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0022  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  26.91 
 
 		 707 aa  43.1  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2429  putative RNA methylase  25.23 
 
 		 384 aa  42.7  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.365067  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1421  putative RNA methylase  23.6 
 
 		 375 aa  42.7  0.009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0811  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 		 258 aa  42.7  0.009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.350613  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1451  hypothetical protein  24.28 
 
 		 413 aa  42.7  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1460  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  23.18 
 
 		 702 aa  42.4  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.372421  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>