222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1816 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1816  N6-adenine-specific DNA methylase  100 
 
 		 384 aa  793    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0979861  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0303  hypothetical protein  61.46 
 
 		 384 aa  514  1e-144  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00482447  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0282  hypothetical protein  60.94 
 
 		 388 aa  499  1e-140  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.439028  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0925  putative RNA methylase  50.39 
 
 		 398 aa  399  9.999999999999999e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1378  N6-adenine-specific DNA methylase  51.82 
 
 		 377 aa  394  1e-108  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2381  putative RNA methylase  51.85 
 
 		 380 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1081  N6-adenine-specific DNA methylase  51.17 
 
 		 376 aa  389  1e-107  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.117372  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1282  putative RNA methylase  54.09 
 
 		 379 aa  385  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000499107  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1904  putative RNA methylase  51.86 
 
 		 384 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1690  hypothetical protein  52.24 
 
 		 381 aa  372  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1468  hypothetical protein  52.51 
 
 		 379 aa  373  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1440  methyltransferase  52.51 
 
 		 379 aa  373  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1441  methyltransferase  52.51 
 
 		 379 aa  373  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00219601  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1584  hypothetical protein  52.51 
 
 		 379 aa  373  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1484  putative RNA methylase  52.48 
 
 		 379 aa  372  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0140153  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1617  hypothetical protein  52.51 
 
 		 379 aa  374  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.595181  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1729  hypothetical protein  52.51 
 
 		 379 aa  373  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188996  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3727  hypothetical protein  52.24 
 
 		 379 aa  373  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00339425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1654  hypothetical protein  52.51 
 
 		 379 aa  373  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0207358 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1020  N6-adenine-specific DNA methylase  50.26 
 
 		 374 aa  360  2e-98  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08600  putative RNA methylase  45.38 
 
 		 379 aa  346  5e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3084  putative RNA methylase  45.43 
 
 		 378 aa  342  7e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0287  putative RNA methylase  46.58 
 
 		 379 aa  340  2.9999999999999998e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2429  putative RNA methylase  45.36 
 
 		 384 aa  336  5e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.365067  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0971  putative RNA methylase  44.74 
 
 		 384 aa  332  6e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.143771  normal  0.522905 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0028  hypothetical protein  44.74 
 
 		 400 aa  326  4.0000000000000003e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138235  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0293  putative RNA methylase  43.27 
 
 		 377 aa  324  2e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.107871  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1504  hypothetical protein  46.84 
 
 		 381 aa  322  8e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1533  hypothetical protein  46.84 
 
 		 381 aa  322  8e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2939  putative RNA methylase  42.93 
 
 		 390 aa  319  3.9999999999999996e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000322588  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1816  methyltransferase, putative  44.74 
 
 		 375 aa  316  4e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.961633  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2102  putative methyltransferase  44.74 
 
 		 375 aa  316  5e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486637  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0366  putative RNA methylase  41.75 
 
 		 380 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000203497  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1015  hypothetical protein  45.62 
 
 		 378 aa  307  2.0000000000000002e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.842194  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3242  putative RNA methylase  43.16 
 
 		 382 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000019855  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4151  putative RNA methylase  40.1 
 
 		 398 aa  285  1.0000000000000001e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.949301  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1421  putative RNA methylase  42.11 
 
 		 375 aa  277  2e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1763  putative RNA methylase  40.59 
 
 		 371 aa  262  8e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2355  putative RNA methylase  35.19 
 
 		 393 aa  228  9e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00636349  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0398  putative RNA methylase:THUMP  34.76 
 
 		 389 aa  219  8.999999999999998e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0174402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0477  putative RNA methylase  33.95 
 
 		 376 aa  212  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3994  putative RNA methylase  33.33 
 
 		 375 aa  209  5e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000218402  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0494  putative RNA methylase  33.68 
 
 		 376 aa  206  6e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00380676 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3086  hypothetical protein  32.38 
 
 		 391 aa  206  8e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1261  putative RNA methylase  33.24 
 
 		 375 aa  203  4e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1292  putative RNA methylase  33.24 
 
 		 375 aa  203  4e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.963614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2072  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.68 
 
 		 713 aa  199  7e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0938  hypothetical protein  33.5 
 
 		 403 aa  198  2.0000000000000003e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.493272  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2822  putative RNA methylase  33.33 
 
 		 393 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2256  N6-adenine-specific DNA methylase  32.36 
 
 		 369 aa  190  4e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00159755  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0712  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.28 
 
 		 738 aa  188  1e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1039  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.45 
 
 		 725 aa  187  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.525642  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1236  putative RNA methylase  32.28 
 
 		 385 aa  187  3e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.286379 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3705  putative RNA methylase  33.07 
 
 		 387 aa  187  3e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0180  putative RNA methylase  33.86 
 
 		 340 aa  186  6e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.504589  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1739  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.29 
 
 		 721 aa  181  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.876202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0889  putative RNA methylase  32.17 
 
 		 375 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1600  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.79 
 
 		 708 aa  179  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1032  putative RNA methylase  31.82 
 
 		 399 aa  177  3e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2685  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.23 
 
 		 709 aa  176  9e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.379022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3009  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.13 
 
 		 725 aa  175  9e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.30746  hitchhiker  0.0000000000188031 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2610  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.23 
 
 		 709 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000568014  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1420  putative RNA methylase  32.47 
 
 		 388 aa  175  9.999999999999999e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00712049  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3279  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.94 
 
 		 715 aa  174  2.9999999999999996e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0499  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.73 
 
 		 734 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.639423  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1774  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.97 
 
 		 709 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.828749  hitchhiker  0.000200873 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2283  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.51 
 
 		 749 aa  173  5e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.402285  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0022  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.05 
 
 		 707 aa  173  5.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2570  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.71 
 
 		 709 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0113028  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00591  RNA methylase family protein  32.1 
 
 		 374 aa  172  9e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.950833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1632  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.18 
 
 		 709 aa  172  9e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0586736  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2096  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.43 
 
 		 730 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.110427 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2311  methylase, putative  31.82 
 
 		 762 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.9895  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3643  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.43 
 
 		 730 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.698608 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1615  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.69 
 
 		 730 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000568261 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2661  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.7 
 
 		 712 aa  171  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1263  N6-adenine-specific DNA methylase-like  30.67 
 
 		 374 aa  170  3e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0245346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2473  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.91 
 
 		 711 aa  171  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00287682 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1608  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.43 
 
 		 730 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0023  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.26 
 
 		 707 aa  169  7e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2108  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.89 
 
 		 750 aa  169  8e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.949067  decreased coverage  0.00266929 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2090  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.43 
 
 		 725 aa  169  8e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1601  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.55 
 
 		 713 aa  169  9e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0419159  normal  0.867514 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0282  putative RNA methylase:THUMP  32.28 
 
 		 380 aa  169  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377639  normal  0.859939 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1788  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.88 
 
 		 756 aa  168  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1540  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.55 
 
 		 713 aa  168  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1607  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.55 
 
 		 713 aa  168  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00710463  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2369  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.58 
 
 		 702 aa  168  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0183103  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00952  predicted methyltransferase  31.78 
 
 		 702 aa  167  4e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000729792  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2695  putative RNA methylase  31.78 
 
 		 702 aa  167  4e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0489936  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1057  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.78 
 
 		 702 aa  167  4e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000581203  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00959  hypothetical protein  31.78 
 
 		 702 aa  167  4e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000774517  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1063  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.78 
 
 		 702 aa  167  4e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000372198  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0249  putative RNA methylase  29.84 
 
 		 374 aa  166  4e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0789594  normal  0.0276638 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2648  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.78 
 
 		 702 aa  167  4e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0833868  hitchhiker  0.000556962 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2064  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.75 
 
 		 705 aa  166  5e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1112  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.78 
 
 		 702 aa  166  5e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000933928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1812  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.81 
 
 		 711 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0884579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18930  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.11 
 
 		 738 aa  166  6.9999999999999995e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2424  N6-adenine-specific DNA methylase  34.2 
 
 		 398 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>