227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0028 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0028  hypothetical protein  100 
 
 
400 aa  829    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138235  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0971  putative RNA methylase  65.7 
 
 
384 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.143771  normal  0.522905 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2429  putative RNA methylase  64.12 
 
 
384 aa  525  1e-148  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.365067  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2939  putative RNA methylase  63.49 
 
 
390 aa  519  1e-146  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000322588  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3242  putative RNA methylase  62.7 
 
 
382 aa  497  1e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000019855  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0293  putative RNA methylase  59.04 
 
 
377 aa  488  1e-137  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.107871  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1904  putative RNA methylase  59.9 
 
 
384 aa  479  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08600  putative RNA methylase  58.84 
 
 
379 aa  479  1e-134  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0287  putative RNA methylase  58.58 
 
 
379 aa  475  1e-133  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1282  putative RNA methylase  55.94 
 
 
379 aa  449  1e-125  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000499107  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2381  putative RNA methylase  57.41 
 
 
380 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3727  hypothetical protein  55.41 
 
 
379 aa  441  1e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00339425  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1690  hypothetical protein  55.15 
 
 
381 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1468  hypothetical protein  55.41 
 
 
379 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1440  methyltransferase  55.41 
 
 
379 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1441  methyltransferase  55.41 
 
 
379 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00219601  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1584  hypothetical protein  55.41 
 
 
379 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1729  hypothetical protein  55.41 
 
 
379 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188996  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1654  hypothetical protein  55.41 
 
 
379 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0207358 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1617  hypothetical protein  55.41 
 
 
379 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.595181  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1484  putative RNA methylase  55.15 
 
 
379 aa  437  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0140153  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3084  putative RNA methylase  54.52 
 
 
378 aa  436  1e-121  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2102  putative methyltransferase  53.68 
 
 
375 aa  402  1e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486637  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1816  methyltransferase, putative  53.68 
 
 
375 aa  402  1e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.961633  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0366  putative RNA methylase  49.61 
 
 
380 aa  404  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000203497  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4151  putative RNA methylase  52.91 
 
 
398 aa  402  1e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.949301  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0925  putative RNA methylase  50.13 
 
 
398 aa  377  1e-103  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1533  hypothetical protein  47.11 
 
 
381 aa  363  2e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1504  hypothetical protein  47.11 
 
 
381 aa  363  2e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1015  hypothetical protein  46.44 
 
 
378 aa  357  1.9999999999999998e-97  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.842194  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0282  hypothetical protein  46.15 
 
 
388 aa  348  1e-94  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.439028  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0303  hypothetical protein  45.55 
 
 
384 aa  341  2e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00482447  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1816  N6-adenine-specific DNA methylase  44.74 
 
 
384 aa  326  4.0000000000000003e-88  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0979861  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1378  N6-adenine-specific DNA methylase  45.28 
 
 
377 aa  322  5e-87  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1081  N6-adenine-specific DNA methylase  43.09 
 
 
376 aa  321  9.999999999999999e-87  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.117372  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1763  putative RNA methylase  41.35 
 
 
371 aa  312  4.999999999999999e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1421  putative RNA methylase  43.5 
 
 
375 aa  312  4.999999999999999e-84  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1020  N6-adenine-specific DNA methylase  42.02 
 
 
374 aa  296  5e-79  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3086  hypothetical protein  37.6 
 
 
391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0398  putative RNA methylase:THUMP  36.07 
 
 
389 aa  243  5e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0174402  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2355  putative RNA methylase  33.69 
 
 
393 aa  230  3e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00636349  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0477  putative RNA methylase  33.96 
 
 
376 aa  223  4e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3994  putative RNA methylase  33.15 
 
 
375 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000218402  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0494  putative RNA methylase  33.69 
 
 
376 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00380676 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1292  putative RNA methylase  33.06 
 
 
375 aa  210  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.963614  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1261  putative RNA methylase  33.06 
 
 
375 aa  210  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0938  hypothetical protein  32.82 
 
 
403 aa  203  5e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.493272  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1018  putative RNA methylase  32.98 
 
 
377 aa  202  9e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0249  putative RNA methylase  33.98 
 
 
374 aa  202  9e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0789594  normal  0.0276638 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2822  putative RNA methylase  31.35 
 
 
393 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2256  N6-adenine-specific DNA methylase  32.51 
 
 
369 aa  201  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00159755  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2072  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.08 
 
 
713 aa  197  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0180  putative RNA methylase  32.62 
 
 
340 aa  194  2e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.504589  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0889  putative RNA methylase  32.24 
 
 
375 aa  192  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1263  N6-adenine-specific DNA methylase-like  32.18 
 
 
374 aa  189  5e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0245346  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2283  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.03 
 
 
749 aa  187  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.402285  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0429  putative RNA methylase  31.37 
 
 
380 aa  186  8e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.000469504  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1743  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.88 
 
 
706 aa  186  8e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.171189  hitchhiker  0.000865534 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1032  putative RNA methylase  31.44 
 
 
399 aa  186  9e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3279  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.45 
 
 
715 aa  183  6e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1946  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.81 
 
 
711 aa  182  7e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478167  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01161  RNA methylase family protein  29.03 
 
 
374 aa  181  1e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0022  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.48 
 
 
707 aa  181  2e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1415  putative RNA methylase  29.3 
 
 
374 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.941781  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2641  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.34 
 
 
706 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1987  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.34 
 
 
706 aa  181  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2661  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.35 
 
 
712 aa  181  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2552  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.34 
 
 
706 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2473  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.94 
 
 
711 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00287682 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2470  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.54 
 
 
711 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000238626  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1112  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.52 
 
 
702 aa  178  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000933928  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1739  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.32 
 
 
721 aa  178  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.876202  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1600  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.27 
 
 
708 aa  178  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0023  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.48 
 
 
707 aa  177  2e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3705  putative RNA methylase  30.66 
 
 
387 aa  177  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1095  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.62 
 
 
708 aa  178  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0184189  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1551  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.09 
 
 
718 aa  178  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.728211  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1774  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.12 
 
 
709 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.828749  hitchhiker  0.000200873 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4012  putative RNA methylase  30.65 
 
 
387 aa  177  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.206929  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0712  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.01 
 
 
738 aa  176  6e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2369  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.17 
 
 
702 aa  176  6e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0183103  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2610  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.85 
 
 
709 aa  176  7e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000568014  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1063  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.17 
 
 
702 aa  176  7e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000372198  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00952  predicted methyltransferase  31.17 
 
 
702 aa  176  8e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000729792  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2695  putative RNA methylase  31.17 
 
 
702 aa  176  8e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0489936  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00959  hypothetical protein  31.17 
 
 
702 aa  176  8e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000774517  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1057  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.17 
 
 
702 aa  176  8e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000581203  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2648  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.17 
 
 
702 aa  176  8e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0833868  hitchhiker  0.000556962 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2685  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.4 
 
 
709 aa  176  9e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.379022  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0412  putative RNA methylase  31.59 
 
 
382 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.456044 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2171  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.17 
 
 
702 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000766949  normal  0.466381 
 
 
-
 
NC_002950  PG1362  hypothetical protein  32.09 
 
 
484 aa  174  2.9999999999999996e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1632  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.11 
 
 
709 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0586736  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2570  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.13 
 
 
709 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0113028  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1102  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.34 
 
 
702 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.907291  normal  0.597986 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1019  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.34 
 
 
702 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000163679  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1123  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.34 
 
 
702 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.482785  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1170  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.34 
 
 
702 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.988002  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1136  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.34 
 
 
702 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.237115  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03361  RNA methylase family protein  30.4 
 
 
374 aa  173  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.604179 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>