224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3086 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3086  hypothetical protein  100 
 
 		 391 aa  791    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0398  putative RNA methylase:THUMP  73.45 
 
 		 389 aa  593  1e-168  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0174402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3994  putative RNA methylase  66.85 
 
 		 375 aa  527  1e-148  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000218402  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0477  putative RNA methylase  62.03 
 
 		 376 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0494  putative RNA methylase  61.23 
 
 		 376 aa  488  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00380676 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2355  putative RNA methylase  57.22 
 
 		 393 aa  424  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00636349  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2822  putative RNA methylase  51.16 
 
 		 393 aa  394  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0889  putative RNA methylase  48.53 
 
 		 375 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1292  putative RNA methylase  44.2 
 
 		 375 aa  355  1e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.963614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1261  putative RNA methylase  44.2 
 
 		 375 aa  355  1e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0249  putative RNA methylase  45.04 
 
 		 374 aa  341  1e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0789594  normal  0.0276638 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1263  N6-adenine-specific DNA methylase-like  43.7 
 
 		 374 aa  319  6e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0245346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2072  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  43.42 
 
 		 713 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0712  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  45.21 
 
 		 738 aa  305  9.000000000000001e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1032  putative RNA methylase  42.47 
 
 		 399 aa  299  7e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4012  putative RNA methylase  44.3 
 
 		 387 aa  292  7e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.206929  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0429  putative RNA methylase  42.39 
 
 		 380 aa  291  2e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.000469504  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03361  RNA methylase family protein  40.92 
 
 		 374 aa  291  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2090  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  43.12 
 
 		 725 aa  290  3e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2064  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  43.94 
 
 		 705 aa  288  8e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1600  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  40.8 
 
 		 708 aa  287  2e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01161  RNA methylase family protein  38.65 
 
 		 374 aa  286  5e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1791  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  43.94 
 
 		 705 aa  286  5.999999999999999e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2661  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.2 
 
 		 712 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0074  putative RNA methylase  41.73 
 
 		 376 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2495  putative RNA methylase  39.62 
 
 		 387 aa  283  5.000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256792  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1420  putative RNA methylase  39.63 
 
 		 388 aa  282  9e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00712049  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1415  putative RNA methylase  38.65 
 
 		 374 aa  281  1e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.941781  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1615  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  40.93 
 
 		 730 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000568261 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2250  putative RNA methylase  43.24 
 
 		 380 aa  280  3e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.959304  normal  0.130722 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18930  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  42.19 
 
 		 738 aa  280  4e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1608  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  40.67 
 
 		 730 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4154  putative RNA methylase  42.89 
 
 		 387 aa  280  4e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1743  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  42.59 
 
 		 706 aa  280  5e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.171189  hitchhiker  0.000865534 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2096  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  40.67 
 
 		 730 aa  279  6e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.110427 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3643  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  40.67 
 
 		 730 aa  279  6e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.698608 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1987  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  42.86 
 
 		 706 aa  279  6e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2552  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  42.86 
 
 		 706 aa  279  6e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2641  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  42.86 
 
 		 706 aa  279  6e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1851  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  40.05 
 
 		 711 aa  279  7e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4128  putative RNA methylase  42.89 
 
 		 387 aa  279  7e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2610  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  40.05 
 
 		 709 aa  278  8e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000568014  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08561  putative N6-adenine-specific DNA methylase  40 
 
 		 381 aa  278  1e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1632  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.79 
 
 		 709 aa  278  2e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0586736  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2424  N6-adenine-specific DNA methylase  41.67 
 
 		 398 aa  277  2e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2685  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.79 
 
 		 709 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.379022  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1362  hypothetical protein  40.65 
 
 		 484 aa  277  3e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1774  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.79 
 
 		 709 aa  277  3e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.828749  hitchhiker  0.000200873 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1601  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.52 
 
 		 713 aa  276  3e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0419159  normal  0.867514 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2570  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.52 
 
 		 709 aa  276  4e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0113028  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3009  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  40.58 
 
 		 725 aa  276  5e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.30746  hitchhiker  0.0000000000188031 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1095  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  40.7 
 
 		 708 aa  276  6e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0184189  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2470  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.47 
 
 		 711 aa  275  7e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000238626  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1540  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.26 
 
 		 713 aa  275  7e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1607  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.26 
 
 		 713 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00710463  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2283  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.84 
 
 		 749 aa  275  1.0000000000000001e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.402285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1680  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  41.78 
 
 		 707 aa  273  3e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.719337  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1739  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  38.16 
 
 		 721 aa  273  3e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.876202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0412  putative RNA methylase  44.59 
 
 		 382 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.456044 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1649  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  43.4 
 
 		 705 aa  271  2e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1551  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  40.49 
 
 		 718 aa  270  2.9999999999999997e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.728211  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1460  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  42.05 
 
 		 702 aa  269  5e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.372421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1946  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.02 
 
 		 711 aa  270  5e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478167  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00591  RNA methylase family protein  38.38 
 
 		 374 aa  269  5e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.950833  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2311  methylase, putative  39.79 
 
 		 762 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.9895  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2108  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.79 
 
 		 750 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.949067  decreased coverage  0.00266929 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02337  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  38.99 
 
 		 707 aa  265  7e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0054  putative RNA methylase  36.41 
 
 		 374 aa  265  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2473  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.02 
 
 		 711 aa  264  2e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00287682 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1788  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.53 
 
 		 756 aa  264  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1236  putative RNA methylase  37.63 
 
 		 385 aa  264  2e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.286379 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2369  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  40.97 
 
 		 702 aa  263  3e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0183103  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00952  predicted methyltransferase  40.97 
 
 		 702 aa  263  4e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000729792  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2695  putative RNA methylase  40.97 
 
 		 702 aa  263  4e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0489936  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1063  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  40.97 
 
 		 702 aa  263  4e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000372198  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1102  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  40.16 
 
 		 702 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.907291  normal  0.597986 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00959  hypothetical protein  40.97 
 
 		 702 aa  263  4e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000774517  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2648  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  40.97 
 
 		 702 aa  263  4e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0833868  hitchhiker  0.000556962 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1170  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  40.16 
 
 		 702 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.988002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1057  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  40.97 
 
 		 702 aa  263  4e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000581203  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1019  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  40.16 
 
 		 702 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000163679  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1136  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  40.16 
 
 		 702 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.237115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1112  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  40.7 
 
 		 702 aa  263  4e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000933928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1123  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  40.16 
 
 		 702 aa  263  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.482785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3705  putative RNA methylase  38.98 
 
 		 387 aa  262  8e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00641  RNA methylase family protein  36.96 
 
 		 374 aa  262  8e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2171  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  40.7 
 
 		 702 aa  261  1e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000766949  normal  0.466381 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1812  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.67 
 
 		 711 aa  261  1e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0884579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1488  hypothetical protein  38.42 
 
 		 393 aa  261  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00216876  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00768  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  41.73 
 
 		 711 aa  260  3e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192916  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0196  putative RNA methylase  36.83 
 
 		 395 aa  259  4e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.289998 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00621  RNA methylase family protein  36.14 
 
 		 374 aa  260  4e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1699  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.05 
 
 		 722 aa  258  1e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003438  23S rRNA (guanine-N-2-) -methyltransferase RlmL  37.4 
 
 		 706 aa  258  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0023  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.9 
 
 		 707 aa  255  1.0000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2828  putative RNA methylase:THUMP  37.78 
 
 		 417 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712566  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1020  N6-adenine-specific DNA methylase  38.01 
 
 		 374 aa  254  1.0000000000000001e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00611  RNA methylase family protein  36.41 
 
 		 374 aa  255  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0028  hypothetical protein  37.6 
 
 		 400 aa  254  2.0000000000000002e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138235  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0022  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.63 
 
 		 707 aa  253  3e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>