226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0282 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0282  putative RNA methylase:THUMP  100 
 
 		 380 aa  786    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377639  normal  0.859939 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1236  putative RNA methylase  58.36 
 
 		 385 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.286379 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3705  putative RNA methylase  58.24 
 
 		 387 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1032  putative RNA methylase  51.72 
 
 		 399 aa  409  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2424  N6-adenine-specific DNA methylase  50.4 
 
 		 398 aa  369  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0623  putative RNA methylase  46.39 
 
 		 432 aa  345  6e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0224  putative RNA methylase  46.62 
 
 		 434 aa  342  9e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.219183  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0708  putative RNA methylase  46.62 
 
 		 434 aa  342  9e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0675  putative RNA methylase  46.62 
 
 		 434 aa  342  9e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.936037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0598  putative RNA methylase  45.91 
 
 		 432 aa  341  1e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116947  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2537  putative RNA methylase  45.91 
 
 		 425 aa  340  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4003  hypothetical protein  47 
 
 		 430 aa  332  5e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.656935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0696  putative RNA methylase  46.9 
 
 		 433 aa  331  1e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.273634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2677  putative RNA methylase  45.78 
 
 		 432 aa  330  3e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3795  putative RNA methylase  44.95 
 
 		 433 aa  328  9e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.405369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1265  THUMP domain-containing protein  46.14 
 
 		 430 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3344  THUMP domain-containing protein  46.02 
 
 		 430 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615958  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2374  THUMP domain-containing protein  46.02 
 
 		 430 aa  327  3e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3387  N6-adenine-specific DNA methylase  46.02 
 
 		 430 aa  327  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0288  THUMP domain-containing protein  46.02 
 
 		 430 aa  327  3e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1150  THUMP domain-containing protein  46.02 
 
 		 430 aa  327  3e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2557  THUMP domain-containing protein  46.02 
 
 		 430 aa  327  3e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3378  THUMP domain-containing protein  46.02 
 
 		 430 aa  327  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.270297  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2828  putative RNA methylase:THUMP  43.87 
 
 		 417 aa  325  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712566  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2967  putative RNA methylase  43.55 
 
 		 419 aa  322  7e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2739  hypothetical protein  40.18 
 
 		 471 aa  298  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.895962  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2568  putative RNA methylase  39.29 
 
 		 472 aa  292  9e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.509771 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0473  putative RNA methylase  40.93 
 
 		 413 aa  290  3e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2978  putative RNA methylase  39.15 
 
 		 472 aa  290  3e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0683  putative RNA methylase  39.36 
 
 		 426 aa  290  4e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2822  putative RNA methylase  39.84 
 
 		 393 aa  286  5e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0237  putative RNA methylase  37.21 
 
 		 485 aa  282  6.000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.601089  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3994  putative RNA methylase  40.6 
 
 		 375 aa  282  6.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000218402  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0422  putative RNA methylase  38.14 
 
 		 441 aa  282  7.000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.472219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0339  putative RNA methylase  38.97 
 
 		 437 aa  282  8.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.179905  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2355  putative RNA methylase  39.95 
 
 		 393 aa  281  1e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00636349  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0350  putative RNA methylase  38.97 
 
 		 440 aa  281  1e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0259  putative RNA methylase  37.47 
 
 		 480 aa  280  3e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0494  putative RNA methylase  38.27 
 
 		 376 aa  276  4e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00380676 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0477  putative RNA methylase  38.71 
 
 		 376 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4180  putative RNA methylase  38.16 
 
 		 440 aa  272  9e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0579  putative RNA methylase  36.86 
 
 		 430 aa  266  5e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2072  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  40.9 
 
 		 713 aa  264  2e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0398  putative RNA methylase:THUMP  38.38 
 
 		 389 aa  264  2e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0174402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1632  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  38.44 
 
 		 709 aa  259  4e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0586736  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3086  hypothetical protein  38.77 
 
 		 391 aa  257  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1540  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.5 
 
 		 713 aa  257  2e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2661  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  36.72 
 
 		 712 aa  257  2e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2570  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  38.18 
 
 		 709 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0113028  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1851  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.92 
 
 		 711 aa  257  3e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1607  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.5 
 
 		 713 aa  256  3e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00710463  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2685  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  38.18 
 
 		 709 aa  256  4e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.379022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2610  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  38.18 
 
 		 709 aa  256  4e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000568014  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1774  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  38.18 
 
 		 709 aa  256  4e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.828749  hitchhiker  0.000200873 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1601  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.5 
 
 		 713 aa  256  4e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0419159  normal  0.867514 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1812  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.82 
 
 		 711 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0884579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2283  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.73 
 
 		 749 aa  252  8.000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.402285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2470  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  36.46 
 
 		 711 aa  249  4e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000238626  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0779  putative RNA methylase  36.54 
 
 		 428 aa  249  8e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0712  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  38.77 
 
 		 738 aa  248  1e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1263  N6-adenine-specific DNA methylase-like  38.5 
 
 		 374 aa  245  9.999999999999999e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0245346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2552  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  38.87 
 
 		 706 aa  243  3.9999999999999997e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1600  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  35.68 
 
 		 708 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1987  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  38.87 
 
 		 706 aa  243  3.9999999999999997e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2641  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  38.87 
 
 		 706 aa  243  3.9999999999999997e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1791  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.68 
 
 		 705 aa  241  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1420  putative RNA methylase  37.33 
 
 		 388 aa  241  2e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00712049  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1739  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.04 
 
 		 721 aa  240  2.9999999999999997e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.876202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2090  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  38.48 
 
 		 725 aa  240  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1261  putative RNA methylase  35.14 
 
 		 375 aa  240  4e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1292  putative RNA methylase  35.14 
 
 		 375 aa  240  4e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.963614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1020  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  36.46 
 
 		 718 aa  240  4e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.164858  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3711  putative RNA methylase  40.89 
 
 		 471 aa  240  4e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.770893  normal  0.0760034 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0889  putative RNA methylase  35.48 
 
 		 375 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2495  putative RNA methylase  35.47 
 
 		 387 aa  237  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256792  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4484  putative RNA methylase  40.38 
 
 		 468 aa  238  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.322135 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1460  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  38.44 
 
 		 702 aa  237  2e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.372421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3009  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  38.68 
 
 		 725 aa  237  3e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.30746  hitchhiker  0.0000000000188031 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2064  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  38.87 
 
 		 705 aa  237  3e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1649  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.41 
 
 		 705 aa  237  3e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4012  putative RNA methylase  35.75 
 
 		 387 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.206929  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1608  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.47 
 
 		 730 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00591  RNA methylase family protein  35.52 
 
 		 374 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.950833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1946  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  36.2 
 
 		 711 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478167  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2096  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.2 
 
 		 730 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.110427 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3643  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.2 
 
 		 730 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.698608 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0499  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  36.36 
 
 		 734 aa  233  5e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.639423  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1551  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  36.46 
 
 		 718 aa  232  7.000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.728211  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1615  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  35.96 
 
 		 730 aa  232  9e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000568261 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2108  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.43 
 
 		 750 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.949067  decreased coverage  0.00266929 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0249  putative RNA methylase  34.85 
 
 		 374 aa  231  1e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0789594  normal  0.0276638 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1743  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  38.87 
 
 		 706 aa  232  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.171189  hitchhiker  0.000865534 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2311  methylase, putative  36.84 
 
 		 762 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.9895  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00952  predicted methyltransferase  37.8 
 
 		 702 aa  230  3e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000729792  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2695  putative RNA methylase  37.8 
 
 		 702 aa  230  3e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0489936  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2648  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.8 
 
 		 702 aa  230  3e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0833868  hitchhiker  0.000556962 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00959  hypothetical protein  37.8 
 
 		 702 aa  230  3e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000774517  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1063  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.8 
 
 		 702 aa  230  3e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000372198  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1057  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.8 
 
 		 702 aa  230  3e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000581203  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1112  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.8 
 
 		 702 aa  230  3e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000933928  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>