230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1816 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2102  putative methyltransferase  99.73 
 
 
375 aa  773    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486637  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1816  methyltransferase, putative  100 
 
 
375 aa  775    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.961633  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0971  putative RNA methylase  56.95 
 
 
384 aa  434  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.143771  normal  0.522905 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2429  putative RNA methylase  56.68 
 
 
384 aa  427  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.365067  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0293  putative RNA methylase  56.71 
 
 
377 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.107871  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2381  putative RNA methylase  53.8 
 
 
380 aa  408  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2939  putative RNA methylase  55.34 
 
 
390 aa  410  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000322588  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3242  putative RNA methylase  54.1 
 
 
382 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000019855  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1904  putative RNA methylase  53.28 
 
 
384 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08600  putative RNA methylase  54.92 
 
 
379 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0028  hypothetical protein  53.68 
 
 
400 aa  402  1e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138235  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0287  putative RNA methylase  53.21 
 
 
379 aa  398  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1484  putative RNA methylase  52.99 
 
 
379 aa  398  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0140153  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1282  putative RNA methylase  52.86 
 
 
379 aa  395  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000499107  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1690  hypothetical protein  52.45 
 
 
381 aa  391  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1468  hypothetical protein  52.72 
 
 
379 aa  393  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1440  methyltransferase  52.72 
 
 
379 aa  393  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1441  methyltransferase  52.72 
 
 
379 aa  393  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00219601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1654  hypothetical protein  52.72 
 
 
379 aa  393  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0207358 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1584  hypothetical protein  52.72 
 
 
379 aa  393  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1729  hypothetical protein  52.72 
 
 
379 aa  393  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188996  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3727  hypothetical protein  52.17 
 
 
379 aa  389  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00339425  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1617  hypothetical protein  52.45 
 
 
379 aa  390  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.595181  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3084  putative RNA methylase  52.19 
 
 
378 aa  379  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0366  putative RNA methylase  48.92 
 
 
380 aa  358  9.999999999999999e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000203497  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0925  putative RNA methylase  49.86 
 
 
398 aa  350  2e-95  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1533  hypothetical protein  47.57 
 
 
381 aa  338  9.999999999999999e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1504  hypothetical protein  47.57 
 
 
381 aa  338  9.999999999999999e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1015  hypothetical protein  47.71 
 
 
378 aa  333  2e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.842194  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4151  putative RNA methylase  46.2 
 
 
398 aa  333  2e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.949301  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1378  N6-adenine-specific DNA methylase  47.55 
 
 
377 aa  328  1.0000000000000001e-88  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0282  hypothetical protein  46.56 
 
 
388 aa  323  3e-87  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.439028  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0303  hypothetical protein  45.77 
 
 
384 aa  321  9.999999999999999e-87  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00482447  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1081  N6-adenine-specific DNA methylase  46.47 
 
 
376 aa  320  3.9999999999999996e-86  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.117372  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1816  N6-adenine-specific DNA methylase  44.74 
 
 
384 aa  316  4e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0979861  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1020  N6-adenine-specific DNA methylase  44.47 
 
 
374 aa  311  9e-84  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1763  putative RNA methylase  41.14 
 
 
371 aa  289  5.0000000000000004e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1421  putative RNA methylase  43.51 
 
 
375 aa  273  5.000000000000001e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0398  putative RNA methylase:THUMP  35.85 
 
 
389 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0174402  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3086  hypothetical protein  33.96 
 
 
391 aa  227  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2355  putative RNA methylase  34.15 
 
 
393 aa  222  7e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00636349  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1261  putative RNA methylase  34.41 
 
 
375 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1292  putative RNA methylase  34.41 
 
 
375 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.963614  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0477  putative RNA methylase  33.97 
 
 
376 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0180  putative RNA methylase  35.79 
 
 
340 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.504589  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0494  putative RNA methylase  34.51 
 
 
376 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00380676 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3994  putative RNA methylase  34.41 
 
 
375 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000218402  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3705  putative RNA methylase  33.42 
 
 
387 aa  212  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0712  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.42 
 
 
738 aa  210  4e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08561  putative N6-adenine-specific DNA methylase  34.77 
 
 
381 aa  207  3e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2552  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.67 
 
 
706 aa  206  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2072  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.95 
 
 
713 aa  206  4e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1987  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.67 
 
 
706 aa  207  4e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2641  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.67 
 
 
706 aa  207  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0938  hypothetical protein  35.22 
 
 
403 aa  206  5e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.493272  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0889  putative RNA methylase  33.6 
 
 
375 aa  206  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1743  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.29 
 
 
706 aa  205  8e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.171189  hitchhiker  0.000865534 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1739  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.16 
 
 
721 aa  204  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.876202  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2495  putative RNA methylase  35.11 
 
 
387 aa  203  4e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256792  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1791  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.76 
 
 
705 aa  202  6e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1649  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.75 
 
 
705 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1018  putative RNA methylase  35.12 
 
 
377 aa  201  1.9999999999999998e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1540  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.42 
 
 
713 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1607  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.42 
 
 
713 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00710463  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1601  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.42 
 
 
713 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0419159  normal  0.867514 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1851  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.16 
 
 
711 aa  200  3e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1032  putative RNA methylase  32.61 
 
 
399 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1112  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.07 
 
 
702 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000933928  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1095  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.68 
 
 
708 aa  200  3.9999999999999996e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0184189  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1600  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.6 
 
 
708 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2369  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.07 
 
 
702 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0183103  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00952  predicted methyltransferase  33.07 
 
 
702 aa  199  6e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000729792  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2695  putative RNA methylase  33.07 
 
 
702 aa  199  6e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0489936  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2171  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.07 
 
 
702 aa  199  6e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000766949  normal  0.466381 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1420  putative RNA methylase  31.82 
 
 
388 aa  199  6e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00712049  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00959  hypothetical protein  33.07 
 
 
702 aa  199  6e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000774517  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1057  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.07 
 
 
702 aa  199  6e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000581203  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2648  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.07 
 
 
702 aa  199  6e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0833868  hitchhiker  0.000556962 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2064  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.86 
 
 
705 aa  199  7e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1063  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.07 
 
 
702 aa  199  7e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000372198  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1632  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.64 
 
 
709 aa  199  7e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0586736  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2685  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.54 
 
 
709 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.379022  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1019  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.87 
 
 
702 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000163679  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1136  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.87 
 
 
702 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.237115  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1102  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.87 
 
 
702 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.907291  normal  0.597986 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1170  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.87 
 
 
702 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.988002  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1123  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.87 
 
 
702 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.482785  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1774  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.54 
 
 
709 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.828749  hitchhiker  0.000200873 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01161  RNA methylase family protein  32.44 
 
 
374 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2470  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.33 
 
 
711 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000238626  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2661  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.51 
 
 
712 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2610  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.54 
 
 
709 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000568014  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2570  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.54 
 
 
709 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0113028  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1415  putative RNA methylase  32.79 
 
 
374 aa  197  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.941781  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1039  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.32 
 
 
725 aa  196  6e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.525642  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1608  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.73 
 
 
730 aa  195  9e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00591  RNA methylase family protein  33.78 
 
 
374 aa  195  9e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.950833  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1680  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.69 
 
 
707 aa  194  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.719337  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2256  N6-adenine-specific DNA methylase  29.77 
 
 
369 aa  195  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00159755  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1263  N6-adenine-specific DNA methylase-like  32.43 
 
 
374 aa  195  1e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0245346  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>