221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_4151 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_4151  putative RNA methylase  100 
 
 		 398 aa  820    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.949301  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2429  putative RNA methylase  53.54 
 
 		 384 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.365067  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3242  putative RNA methylase  52.36 
 
 		 382 aa  424  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000019855  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0028  hypothetical protein  52.91 
 
 		 400 aa  425  1e-118  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138235  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08600  putative RNA methylase  52.25 
 
 		 379 aa  422  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2939  putative RNA methylase  50.67 
 
 		 390 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000322588  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0971  putative RNA methylase  51.06 
 
 		 384 aa  414  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.143771  normal  0.522905 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1904  putative RNA methylase  53.4 
 
 		 384 aa  412  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0293  putative RNA methylase  48.94 
 
 		 377 aa  402  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.107871  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2381  putative RNA methylase  51.59 
 
 		 380 aa  392  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1282  putative RNA methylase  48.55 
 
 		 379 aa  390  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000499107  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1484  putative RNA methylase  48.28 
 
 		 379 aa  387  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0140153  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1468  hypothetical protein  48.55 
 
 		 379 aa  382  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1440  methyltransferase  48.55 
 
 		 379 aa  382  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1441  methyltransferase  48.55 
 
 		 379 aa  382  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00219601  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1584  hypothetical protein  48.55 
 
 		 379 aa  382  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1729  hypothetical protein  48.55 
 
 		 379 aa  382  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188996  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3727  hypothetical protein  48.68 
 
 		 379 aa  384  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00339425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0287  putative RNA methylase  48.55 
 
 		 379 aa  384  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1654  hypothetical protein  48.55 
 
 		 379 aa  382  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0207358 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1617  hypothetical protein  48.41 
 
 		 379 aa  383  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.595181  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1690  hypothetical protein  48.28 
 
 		 381 aa  381  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3084  putative RNA methylase  46.7 
 
 		 378 aa  378  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2102  putative methyltransferase  46.2 
 
 		 375 aa  351  2e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486637  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1816  methyltransferase, putative  46.2 
 
 		 375 aa  350  2e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.961633  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0366  putative RNA methylase  44.33 
 
 		 380 aa  348  8e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000203497  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1504  hypothetical protein  45.45 
 
 		 381 aa  345  8e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1533  hypothetical protein  45.45 
 
 		 381 aa  345  8e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1015  hypothetical protein  46.26 
 
 		 378 aa  345  8.999999999999999e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.842194  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0925  putative RNA methylase  47.49 
 
 		 398 aa  342  5e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0282  hypothetical protein  45.09 
 
 		 388 aa  337  1.9999999999999998e-91  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.439028  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0303  hypothetical protein  43.49 
 
 		 384 aa  323  3e-87  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00482447  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1020  N6-adenine-specific DNA methylase  44.89 
 
 		 374 aa  318  2e-85  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1081  N6-adenine-specific DNA methylase  42.02 
 
 		 376 aa  305  9.000000000000001e-82  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.117372  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1816  N6-adenine-specific DNA methylase  40.31 
 
 		 384 aa  299  5e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0979861  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1421  putative RNA methylase  43.55 
 
 		 375 aa  298  8e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1378  N6-adenine-specific DNA methylase  42.32 
 
 		 377 aa  292  6e-78  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1763  putative RNA methylase  39.57 
 
 		 371 aa  270  2e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0398  putative RNA methylase:THUMP  36.49 
 
 		 389 aa  230  3e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0174402  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3086  hypothetical protein  36.04 
 
 		 391 aa  229  5e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3994  putative RNA methylase  35.58 
 
 		 375 aa  228  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000218402  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0938  hypothetical protein  35.29 
 
 		 403 aa  221  9.999999999999999e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.493272  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1292  putative RNA methylase  34.33 
 
 		 375 aa  219  6e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.963614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1261  putative RNA methylase  34.33 
 
 		 375 aa  219  6e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0477  putative RNA methylase  35.03 
 
 		 376 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0494  putative RNA methylase  35.03 
 
 		 376 aa  211  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00380676 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2355  putative RNA methylase  32.35 
 
 		 393 aa  210  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00636349  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2822  putative RNA methylase  31.08 
 
 		 393 aa  196  9e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1032  putative RNA methylase  32.16 
 
 		 399 aa  194  2e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2256  N6-adenine-specific DNA methylase  34.22 
 
 		 369 aa  192  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00159755  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1812  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.62 
 
 		 711 aa  191  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0884579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0249  putative RNA methylase  32.7 
 
 		 374 aa  190  2.9999999999999997e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0789594  normal  0.0276638 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1743  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  35.89 
 
 		 706 aa  189  5e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.171189  hitchhiker  0.000865534 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2570  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.47 
 
 		 709 aa  190  5e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0113028  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0429  putative RNA methylase  32.53 
 
 		 380 aa  189  5.999999999999999e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.000469504  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2610  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.47 
 
 		 709 aa  189  9e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000568014  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2685  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.47 
 
 		 709 aa  189  9e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.379022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1236  putative RNA methylase  31.25 
 
 		 385 aa  188  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.286379 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1774  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.47 
 
 		 709 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.828749  hitchhiker  0.000200873 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0889  putative RNA methylase  32.97 
 
 		 375 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1263  N6-adenine-specific DNA methylase-like  32.7 
 
 		 374 aa  185  1.0000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0245346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1632  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.02 
 
 		 709 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0586736  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4012  putative RNA methylase  32.73 
 
 		 387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.206929  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0180  putative RNA methylase  31.38 
 
 		 340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.504589  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2641  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.2 
 
 		 706 aa  184  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2470  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.23 
 
 		 711 aa  184  3e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000238626  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1987  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.2 
 
 		 706 aa  184  3e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2552  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.92 
 
 		 706 aa  184  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1851  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.2 
 
 		 711 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2283  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.03 
 
 		 749 aa  183  4.0000000000000006e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.402285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2473  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.87 
 
 		 711 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00287682 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1540  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.2 
 
 		 713 aa  181  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3705  putative RNA methylase  32.6 
 
 		 387 aa  181  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2072  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.37 
 
 		 713 aa  181  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1607  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.2 
 
 		 713 aa  181  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00710463  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1601  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.2 
 
 		 713 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0419159  normal  0.867514 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1946  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.35 
 
 		 711 aa  178  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478167  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1791  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.68 
 
 		 705 aa  178  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2064  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.42 
 
 		 705 aa  177  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2369  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.16 
 
 		 702 aa  177  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0183103  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1095  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.75 
 
 		 708 aa  177  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0184189  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1112  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.89 
 
 		 702 aa  177  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000933928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2143  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.73 
 
 		 711 aa  176  4e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2424  N6-adenine-specific DNA methylase  32.61 
 
 		 398 aa  177  4e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00952  predicted methyltransferase  32.89 
 
 		 702 aa  176  5e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000729792  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2695  putative RNA methylase  32.89 
 
 		 702 aa  176  5e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0489936  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2171  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.89 
 
 		 702 aa  176  5e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000766949  normal  0.466381 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00959  hypothetical protein  32.89 
 
 		 702 aa  176  5e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000774517  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1057  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.89 
 
 		 702 aa  176  5e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000581203  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2648  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.89 
 
 		 702 aa  176  5e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0833868  hitchhiker  0.000556962 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1063  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.89 
 
 		 702 aa  176  5e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000372198  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0712  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.56 
 
 		 738 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2250  putative RNA methylase  31.37 
 
 		 380 aa  175  9.999999999999999e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.959304  normal  0.130722 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2661  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.87 
 
 		 712 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1680  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.29 
 
 		 707 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.719337  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00591  RNA methylase family protein  29.03 
 
 		 374 aa  173  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.950833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4154  putative RNA methylase  31.87 
 
 		 387 aa  173  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1739  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.32 
 
 		 721 aa  172  6.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.876202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4128  putative RNA methylase  31.61 
 
 		 387 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1018  putative RNA methylase  29.97 
 
 		 377 aa  170  3e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>