218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1018 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1018  putative RNA methylase  100 
 
 		 377 aa  761    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0180  putative RNA methylase  44.35 
 
 		 340 aa  268  1e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.504589  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3084  putative RNA methylase  35.01 
 
 		 378 aa  210  3e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0366  putative RNA methylase  34.75 
 
 		 380 aa  204  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000203497  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0971  putative RNA methylase  34.39 
 
 		 384 aa  203  4e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.143771  normal  0.522905 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08600  putative RNA methylase  35.62 
 
 		 379 aa  202  6e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2102  putative methyltransferase  35.12 
 
 		 375 aa  202  8e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486637  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0028  hypothetical protein  32.98 
 
 		 400 aa  202  9e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138235  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1816  methyltransferase, putative  35.12 
 
 		 375 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.961633  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2939  putative RNA methylase  33.78 
 
 		 390 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000322588  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0293  putative RNA methylase  33.69 
 
 		 377 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.107871  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0287  putative RNA methylase  33.07 
 
 		 379 aa  194  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1904  putative RNA methylase  33.07 
 
 		 384 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1763  putative RNA methylase  35.62 
 
 		 371 aa  189  5e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1484  putative RNA methylase  32.28 
 
 		 379 aa  188  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0140153  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1282  putative RNA methylase  32.47 
 
 		 379 aa  188  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000499107  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1015  hypothetical protein  33.42 
 
 		 378 aa  187  3e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.842194  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1504  hypothetical protein  33.16 
 
 		 381 aa  187  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1533  hypothetical protein  33.16 
 
 		 381 aa  187  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0938  hypothetical protein  33.08 
 
 		 403 aa  186  7e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.493272  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1020  N6-adenine-specific DNA methylase  35.09 
 
 		 374 aa  184  3e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0925  putative RNA methylase  31.28 
 
 		 398 aa  182  7e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1468  hypothetical protein  31.48 
 
 		 379 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1440  methyltransferase  31.48 
 
 		 379 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1441  methyltransferase  31.48 
 
 		 379 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00219601  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1584  hypothetical protein  31.48 
 
 		 379 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1654  hypothetical protein  31.48 
 
 		 379 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0207358 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1729  hypothetical protein  31.48 
 
 		 379 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188996  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1617  hypothetical protein  31.48 
 
 		 379 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.595181  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1690  hypothetical protein  31.61 
 
 		 381 aa  182  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3727  hypothetical protein  31.22 
 
 		 379 aa  181  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00339425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2381  putative RNA methylase  30.5 
 
 		 380 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2429  putative RNA methylase  29.44 
 
 		 384 aa  172  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.365067  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4151  putative RNA methylase  32.18 
 
 		 398 aa  168  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.949301  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0282  hypothetical protein  31.38 
 
 		 388 aa  168  2e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.439028  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1816  N6-adenine-specific DNA methylase  31.23 
 
 		 384 aa  162  7e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0979861  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3242  putative RNA methylase  31.17 
 
 		 382 aa  161  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000019855  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1081  N6-adenine-specific DNA methylase  29.24 
 
 		 376 aa  159  9e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.117372  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0303  hypothetical protein  31.03 
 
 		 384 aa  155  8e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00482447  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3994  putative RNA methylase  30.21 
 
 		 375 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000218402  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0398  putative RNA methylase:THUMP  29.25 
 
 		 389 aa  143  6e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0174402  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3086  hypothetical protein  28.3 
 
 		 391 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1421  putative RNA methylase  30.99 
 
 		 375 aa  139  6e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2355  putative RNA methylase  27.87 
 
 		 393 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00636349  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1378  N6-adenine-specific DNA methylase  26.81 
 
 		 377 aa  136  7.000000000000001e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2256  N6-adenine-specific DNA methylase  26.73 
 
 		 369 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00159755  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2828  putative RNA methylase:THUMP  27.49 
 
 		 417 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712566  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0477  putative RNA methylase  26.65 
 
 		 376 aa  125  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0494  putative RNA methylase  27.18 
 
 		 376 aa  124  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00380676 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2967  putative RNA methylase  24.78 
 
 		 419 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1699  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  26.23 
 
 		 722 aa  119  6e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2005  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  27.08 
 
 		 701 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.391349  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1292  putative RNA methylase  26.61 
 
 		 375 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.963614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1261  putative RNA methylase  26.61 
 
 		 375 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0339  putative RNA methylase  25.47 
 
 		 437 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.179905  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0350  putative RNA methylase  25.47 
 
 		 440 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1739  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.25 
 
 		 721 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.876202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0429  putative RNA methylase  26.01 
 
 		 380 aa  114  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.000469504  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1095  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.66 
 
 		 708 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0184189  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2685  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.27 
 
 		 709 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.379022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0683  putative RNA methylase  26.5 
 
 		 426 aa  113  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2610  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  27.98 
 
 		 709 aa  112  9e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000568014  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1362  hypothetical protein  26.77 
 
 		 484 aa  112  1.0000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1032  putative RNA methylase  27.11 
 
 		 399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1551  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  26.61 
 
 		 718 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.728211  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1774  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  27.68 
 
 		 709 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.828749  hitchhiker  0.000200873 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3279  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  25.19 
 
 		 715 aa  111  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4484  putative RNA methylase  25.8 
 
 		 468 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.322135 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0422  putative RNA methylase  25.31 
 
 		 441 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.472219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03361  RNA methylase family protein  24.52 
 
 		 374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2570  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  27.98 
 
 		 709 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0113028  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01161  RNA methylase family protein  28.23 
 
 		 374 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1764  putative RNA methylase  27.3 
 
 		 411 aa  110  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0623  putative RNA methylase  28.27 
 
 		 432 aa  110  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1415  putative RNA methylase  28.23 
 
 		 374 aa  109  6e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.941781  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1649  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.41 
 
 		 705 aa  110  6e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4180  putative RNA methylase  28.09 
 
 		 440 aa  109  7.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4012  putative RNA methylase  25.08 
 
 		 387 aa  109  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.206929  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1112  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.32 
 
 		 702 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000933928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2415  putative RNA methylase  27.39 
 
 		 373 aa  109  9.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0460836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1460  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.11 
 
 		 702 aa  108  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.372421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1791  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.33 
 
 		 705 aa  108  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3009  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  26.71 
 
 		 725 aa  108  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.30746  hitchhiker  0.0000000000188031 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2369  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.94 
 
 		 702 aa  108  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0183103  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1540  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  26.72 
 
 		 713 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2661  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  26.79 
 
 		 712 aa  107  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1601  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  26.72 
 
 		 713 aa  108  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0419159  normal  0.867514 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1607  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  26.72 
 
 		 713 aa  107  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00710463  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2171  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.94 
 
 		 702 aa  107  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000766949  normal  0.466381 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00952  predicted methyltransferase  30.94 
 
 		 702 aa  106  5e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000729792  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2695  putative RNA methylase  30.6 
 
 		 702 aa  106  5e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0489936  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1057  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.6 
 
 		 702 aa  106  5e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000581203  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00959  hypothetical protein  30.94 
 
 		 702 aa  106  5e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000774517  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2072  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  25.65 
 
 		 713 aa  107  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0779  putative RNA methylase  28.62 
 
 		 428 aa  107  5e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2648  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.6 
 
 		 702 aa  106  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0833868  hitchhiker  0.000556962 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2470  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  25.87 
 
 		 711 aa  106  5e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000238626  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2822  putative RNA methylase  23.24 
 
 		 393 aa  107  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1063  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.6 
 
 		 702 aa  107  5e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000372198  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00510  predicted N6-adenine-specific DNA methylase  25.51 
 
 		 729 aa  107  5e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.563195  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>