219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1764 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1764  putative RNA methylase  100 
 
 		 411 aa  837    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2355  putative RNA methylase  35.39 
 
 		 393 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00636349  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0398  putative RNA methylase:THUMP  36.62 
 
 		 389 aa  210  4e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0174402  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3086  hypothetical protein  35.46 
 
 		 391 aa  206  5e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2256  N6-adenine-specific DNA methylase  35.85 
 
 		 369 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00159755  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3994  putative RNA methylase  32.71 
 
 		 375 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000218402  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2072  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.37 
 
 		 713 aa  193  5e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0477  putative RNA methylase  32.11 
 
 		 376 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0494  putative RNA methylase  32.37 
 
 		 376 aa  189  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00380676 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2822  putative RNA methylase  31.88 
 
 		 393 aa  186  8e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0971  putative RNA methylase  28.88 
 
 		 384 aa  178  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.143771  normal  0.522905 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0889  putative RNA methylase  30 
 
 		 375 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2495  putative RNA methylase  32.18 
 
 		 387 aa  177  3e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256792  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1261  putative RNA methylase  29.02 
 
 		 375 aa  176  9e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1292  putative RNA methylase  29.02 
 
 		 375 aa  176  9e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.963614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0287  putative RNA methylase  30.29 
 
 		 379 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08600  putative RNA methylase  29.18 
 
 		 379 aa  172  6.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4012  putative RNA methylase  37.58 
 
 		 387 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.206929  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2102  putative methyltransferase  31.28 
 
 		 375 aa  171  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486637  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0293  putative RNA methylase  29.06 
 
 		 377 aa  170  4e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.107871  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1816  methyltransferase, putative  31.28 
 
 		 375 aa  170  5e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.961633  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1032  putative RNA methylase  31.65 
 
 		 399 aa  169  1e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3084  putative RNA methylase  28.86 
 
 		 378 aa  169  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4154  putative RNA methylase  35.07 
 
 		 387 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2378  putative RNA methylase  31.73 
 
 		 399 aa  168  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.74505  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2429  putative RNA methylase  30 
 
 		 384 aa  166  5e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.365067  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3242  putative RNA methylase  33.05 
 
 		 382 aa  166  5e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000019855  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08561  putative N6-adenine-specific DNA methylase  29.67 
 
 		 381 aa  166  1.0000000000000001e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0265  putative RNA methylase  32.24 
 
 		 375 aa  166  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2939  putative RNA methylase  30.35 
 
 		 390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000322588  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4128  putative RNA methylase  34.49 
 
 		 387 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2381  putative RNA methylase  31.16 
 
 		 380 aa  163  7e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1533  hypothetical protein  30.4 
 
 		 381 aa  162  8.000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1504  hypothetical protein  30.4 
 
 		 381 aa  162  8.000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2415  putative RNA methylase  31.32 
 
 		 373 aa  161  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0460836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1081  N6-adenine-specific DNA methylase  28.69 
 
 		 376 aa  160  4e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.117372  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0249  putative RNA methylase  30.22 
 
 		 374 aa  159  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0789594  normal  0.0276638 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2661  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.5 
 
 		 712 aa  157  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0282  hypothetical protein  29.19 
 
 		 388 aa  157  3e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.439028  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1739  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.85 
 
 		 721 aa  157  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.876202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0028  hypothetical protein  29.19 
 
 		 400 aa  156  5.0000000000000005e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138235  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1904  putative RNA methylase  31.44 
 
 		 384 aa  156  6e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1020  N6-adenine-specific DNA methylase  28.57 
 
 		 374 aa  156  8e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1015  hypothetical protein  29.18 
 
 		 378 aa  155  9e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.842194  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0712  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.55 
 
 		 738 aa  155  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00768  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.63 
 
 		 711 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192916  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4151  putative RNA methylase  29.97 
 
 		 398 aa  152  8e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.949301  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2577  putative RNA methylase  31.14 
 
 		 374 aa  152  8e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.274965  hitchhiker  0.00000225035 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0303  hypothetical protein  29.17 
 
 		 384 aa  152  8.999999999999999e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00482447  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0366  putative RNA methylase  27.44 
 
 		 380 aa  152  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000203497  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3279  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  27.36 
 
 		 715 aa  151  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0412  putative RNA methylase  36.14 
 
 		 382 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.456044 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1378  N6-adenine-specific DNA methylase  27.27 
 
 		 377 aa  150  4e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1236  putative RNA methylase  29.58 
 
 		 385 aa  150  6e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.286379 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1600  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  27.03 
 
 		 708 aa  149  6e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003438  23S rRNA (guanine-N-2-) -methyltransferase RlmL  30.1 
 
 		 706 aa  149  7e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1601  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.42 
 
 		 713 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0419159  normal  0.867514 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1420  putative RNA methylase  29.14 
 
 		 388 aa  148  1.0000000000000001e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00712049  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1488  hypothetical protein  32.1 
 
 		 393 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00216876  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02010  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.99 
 
 		 699 aa  148  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.347097  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1607  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.42 
 
 		 713 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00710463  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2283  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  27.32 
 
 		 749 aa  148  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.402285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2064  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.05 
 
 		 705 aa  147  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0925  putative RNA methylase  28.07 
 
 		 398 aa  147  3e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1540  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.42 
 
 		 713 aa  147  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1791  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.39 
 
 		 705 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2090  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.17 
 
 		 725 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02337  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.58 
 
 		 707 aa  146  5e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1649  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.2 
 
 		 705 aa  146  6e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3009  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.47 
 
 		 725 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.30746  hitchhiker  0.0000000000188031 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1816  N6-adenine-specific DNA methylase  29.09 
 
 		 384 aa  146  7.0000000000000006e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0979861  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0429  putative RNA methylase  30.2 
 
 		 380 aa  146  8.000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.000469504  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1263  N6-adenine-specific DNA methylase-like  30.37 
 
 		 374 aa  146  8.000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0245346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1632  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  27.89 
 
 		 709 aa  145  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0586736  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1421  putative RNA methylase  27.86 
 
 		 375 aa  145  1e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1851  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  27.89 
 
 		 711 aa  144  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2369  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.26 
 
 		 702 aa  144  3e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0183103  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1615  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.55 
 
 		 730 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000568261 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1095  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  27.46 
 
 		 708 aa  144  4e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0184189  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2470  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  27.7 
 
 		 711 aa  144  4e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000238626  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2685  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  27.11 
 
 		 709 aa  143  5e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.379022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18930  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.58 
 
 		 738 aa  143  7e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1136  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.6 
 
 		 702 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.237115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1170  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.6 
 
 		 702 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.988002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1123  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.6 
 
 		 702 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.482785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1102  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.6 
 
 		 702 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.907291  normal  0.597986 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1019  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.6 
 
 		 702 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000163679  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0196  putative RNA methylase  29.46 
 
 		 395 aa  142  8e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.289998 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0422  putative RNA methylase  30.25 
 
 		 441 aa  142  8e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.472219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4484  putative RNA methylase  29.05 
 
 		 468 aa  142  9e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.322135 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2641  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.55 
 
 		 706 aa  142  9e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1987  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.55 
 
 		 706 aa  142  9e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2610  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  27.11 
 
 		 709 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000568014  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1112  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.26 
 
 		 702 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000933928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2552  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.55 
 
 		 706 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1551  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.5 
 
 		 718 aa  142  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.728211  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1774  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  27.11 
 
 		 709 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.828749  hitchhiker  0.000200873 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00959  hypothetical protein  30.26 
 
 		 702 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000774517  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2171  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.26 
 
 		 702 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000766949  normal  0.466381 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2648  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.26 
 
 		 702 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0833868  hitchhiker  0.000556962 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>