17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0218 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0218  putative RNA methylase  100 
 
 
348 aa  672    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000547055 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0555  putative RNA methylase  29.89 
 
 
336 aa  56.2  0.0000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0020  putative RNA methylase  29.8 
 
 
359 aa  52.8  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1026  putative RNA methylase  30.89 
 
 
379 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6055  Methyltransferase type 11  30.38 
 
 
360 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1059  putative RNA methylase  32.04 
 
 
317 aa  45.4  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000310515  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46959  predicted protein  29.67 
 
 
460 aa  45.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.897224  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2196  DNA methylase  30.49 
 
 
391 aa  44.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000872225  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1582  putative RNA methylase  27.27 
 
 
357 aa  44.3  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0667  putative RNA methylase  25.87 
 
 
367 aa  43.9  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.107618  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1767  DNA methylase  32.86 
 
 
352 aa  43.5  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000189808  hitchhiker  0.00347478 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1623  putative RNA methylase  32.3 
 
 
344 aa  43.5  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.236365  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1848  DNA methylase  31.43 
 
 
352 aa  43.1  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000193192  hitchhiker  0.0000000226376 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3151  DNA methylase  31.43 
 
 
352 aa  43.1  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000168176  hitchhiker  0.000000000119452 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1210  putative RNA methylase  28.21 
 
 
322 aa  43.5  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00394731 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1154  putative RNA methylase  24.81 
 
 
364 aa  43.1  0.008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2321  putative RNA methylase  26.8 
 
 
318 aa  42.7  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.334147  normal  0.512947 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>