131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1330 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1330  N2-methylguanosine tRNA methyltransferase  100 
 
 
355 aa  722    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.315731  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1623  putative RNA methylase  53.33 
 
 
344 aa  377  1e-103  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.236365  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1006  putative RNA methylase  42.29 
 
 
346 aa  262  8e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1059  putative RNA methylase  39.13 
 
 
317 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000310515  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0125  putative RNA methylase  36.13 
 
 
317 aa  203  4e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2321  putative RNA methylase  39.26 
 
 
318 aa  203  4e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.334147  normal  0.512947 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0420  hypothetical protein  35.14 
 
 
317 aa  189  7e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0587292 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1210  putative RNA methylase  36.47 
 
 
322 aa  187  2e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00394731 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0722  putative RNA methylase  36.39 
 
 
334 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1526  putative RNA methylase  34.08 
 
 
350 aa  182  9.000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0801  putative RNA methylase  33.24 
 
 
351 aa  178  1e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1149  putative RNA methylase  33.61 
 
 
350 aa  177  2e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0482589  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1249  putative RNA methylase  34.39 
 
 
343 aa  171  1e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1154  putative RNA methylase  32.87 
 
 
364 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1864  putative RNA methylase  32 
 
 
365 aa  166  6.9999999999999995e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.382861  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2630  putative RNA methylase  32.96 
 
 
356 aa  161  2e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0132  putative RNA methylase  33.43 
 
 
371 aa  159  9e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0667  putative RNA methylase  32.96 
 
 
367 aa  138  2e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.107618  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0103  putative RNA methylase  33.49 
 
 
310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.802972  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0700  putative RNA methylase  31.44 
 
 
374 aa  107  4e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.46275  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1789  putative RNA methylase  34.3 
 
 
304 aa  100  3e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2015  putative RNA methylase  30.39 
 
 
314 aa  100  5e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.128985  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0020  putative RNA methylase  32.95 
 
 
359 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1775  putative RNA methylase  29.53 
 
 
315 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0555  putative RNA methylase  29.86 
 
 
336 aa  76.6  0.0000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3569  putative RNA methylase  31.97 
 
 
430 aa  65.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0408  putative RNA methylase  27.54 
 
 
334 aa  65.5  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37849  predicted protein  24.86 
 
 
469 aa  64.7  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00619482  hitchhiker  0.00164206 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1720  putative RNA methylase  27.54 
 
 
333 aa  63.9  0.000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0118315  decreased coverage  0.000010347 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1026  putative RNA methylase  27.33 
 
 
379 aa  62  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0985  hypothetical protein  25.12 
 
 
284 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0179865  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0592  putative RNA methylase  33.33 
 
 
225 aa  59.3  0.00000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2582  putative RNA methylase  33.6 
 
 
362 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2801  putative RNA methylase  31.97 
 
 
368 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1100  putative RNA methylase  25.45 
 
 
329 aa  56.6  0.0000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0852  hypothetical protein  28.67 
 
 
317 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0801  methyltransferase  28.67 
 
 
317 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0899  hypothetical protein  28.67 
 
 
284 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000386994  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1582  putative RNA methylase  29.1 
 
 
357 aa  55.8  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0686  putative RNA methylase  39.13 
 
 
224 aa  55.5  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.502689  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0987  hypothetical protein  28.67 
 
 
297 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.86692e-62 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1659  putative RNA methylase  35.96 
 
 
224 aa  54.7  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.69991  hitchhiker  0.00475931 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1080  hypothetical protein  26.29 
 
 
317 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.118177  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0793  putative RNA methylase  25.77 
 
 
317 aa  54.7  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.314828  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0941  hypothetical protein  27.97 
 
 
317 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258982  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4390  hypothetical protein  27.97 
 
 
317 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.043324  unclonable  2.45562e-26 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0938  putative RNA methylase  34.72 
 
 
461 aa  53.5  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000152524  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46959  predicted protein  24.4 
 
 
460 aa  53.5  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.897224  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0797  methyltransferase  27.27 
 
 
317 aa  53.1  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.212906  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1254  putative RNA methylase  28.44 
 
 
330 aa  52.8  0.000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.00904523  normal  0.667506 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  29.66 
 
 
266 aa  52.8  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6055  Methyltransferase type 11  28.74 
 
 
360 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45681  predicted protein  27.13 
 
 
591 aa  52.4  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4087  putative RNA methylase  27.72 
 
 
329 aa  50.4  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134174  normal  0.0349253 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1423  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.79 
 
 
237 aa  50.4  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1395  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.79 
 
 
237 aa  50.4  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1395  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.79 
 
 
237 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1534  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.79 
 
 
237 aa  50.4  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.67 
 
 
947 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.79 
 
 
237 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000970326  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3585  putative RNA methylase  30.6 
 
 
352 aa  50.4  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.626531  hitchhiker  0.0000715951 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1607  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.79 
 
 
237 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000707225 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10450  RNA methylase family UPF0020 protein (AFU_orthologue; AFUA_4G12140)  28.57 
 
 
499 aa  50.1  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6722  putative RNA methylase  27.52 
 
 
292 aa  49.7  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.121582  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50882  predicted protein  26.51 
 
 
437 aa  49.3  0.00009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.933008  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0217  methyltransferase  37.89 
 
 
200 aa  48.9  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0655  D-alanine--D-alanine ligase  31.06 
 
 
663 aa  49.3  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24382  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0306  putative RNA methylase  23.35 
 
 
259 aa  49.3  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0220171  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1569  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.03 
 
 
237 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.781622  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3776  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.03 
 
 
237 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0393069  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1640  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.03 
 
 
237 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.169643  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2198  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.91 
 
 
238 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1985  methyltransferase type 11  32 
 
 
261 aa  48.1  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0151  putative RNA methylase  28.06 
 
 
356 aa  47.8  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  29.85 
 
 
276 aa  47.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1984  putative RNA methylase  32.3 
 
 
227 aa  47.8  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0736  N-6 DNA methylase  29.31 
 
 
725 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0698793  normal  0.0155301 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1167  methyltransferase  34.53 
 
 
183 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.46316 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  29.66 
 
 
233 aa  47  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1190  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.57 
 
 
272 aa  46.6  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1437  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.79 
 
 
237 aa  46.6  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00740  hypothetical protein  28.57 
 
 
475 aa  46.2  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.635907  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  32 
 
 
225 aa  46.2  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0857  protein of unknown function Met10  31.71 
 
 
381 aa  46.2  0.0008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.149196  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1038  putative RNA methylase  26.35 
 
 
249 aa  45.4  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1456  putative RNA methylase  33.02 
 
 
463 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0286  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  36.62 
 
 
271 aa  46.2  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.684049  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0823  N-6 DNA methylase  29.71 
 
 
768 aa  45.1  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0181192  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1511  DNA methylase N-4/N-6  24.34 
 
 
329 aa  45.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2085  putative methyltransferase  32.59 
 
 
184 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0503  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.84 
 
 
242 aa  44.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2550  type I restriction-modification system, M subunit  28.26 
 
 
527 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.19461  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0537  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.28 
 
 
235 aa  45.1  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.383652 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.19 
 
 
236 aa  44.3  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2460  methyltransferase type 11  27.59 
 
 
260 aa  44.3  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.930517  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2276  putative RNA methylase  27.27 
 
 
349 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0176  hypothetical protein  29.27 
 
 
279 aa  44.3  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.261727  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2993  putative RNA methylase  27.48 
 
 
350 aa  44.3  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.021793 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5711  Methyltransferase type 11  24.24 
 
 
265 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0942  Type I restriction-modification system M subunit  29.36 
 
 
495 aa  43.9  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>