103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1006 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1006  putative RNA methylase  100 
 
 		 346 aa  689    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1330  N2-methylguanosine tRNA methyltransferase  42.29 
 
 		 355 aa  262  8e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.315731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1623  putative RNA methylase  43.02 
 
 		 344 aa  255  6e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.236365  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1059  putative RNA methylase  38.84 
 
 		 317 aa  204  2e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000310515  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2321  putative RNA methylase  39.09 
 
 		 318 aa  204  2e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.334147  normal  0.512947 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1210  putative RNA methylase  38.02 
 
 		 322 aa  198  1.0000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00394731 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0125  putative RNA methylase  36.7 
 
 		 317 aa  193  3e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0420  hypothetical protein  40.43 
 
 		 317 aa  192  7e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0587292 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1249  putative RNA methylase  34.75 
 
 		 343 aa  156  4e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1154  putative RNA methylase  31.84 
 
 		 364 aa  153  4e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0722  putative RNA methylase  34.24 
 
 		 334 aa  147  3e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1864  putative RNA methylase  34.15 
 
 		 365 aa  146  6e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.382861  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0801  putative RNA methylase  30.14 
 
 		 351 aa  145  1e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1526  putative RNA methylase  29.58 
 
 		 350 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1149  putative RNA methylase  33.21 
 
 		 350 aa  138  1e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0482589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0132  putative RNA methylase  33.33 
 
 		 371 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0667  putative RNA methylase  29.46 
 
 		 367 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.107618  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2630  putative RNA methylase  32.55 
 
 		 356 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0103  putative RNA methylase  34.78 
 
 		 310 aa  108  1e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.802972  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0700  putative RNA methylase  30.98 
 
 		 374 aa  95.1  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.46275  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1789  putative RNA methylase  36.21 
 
 		 304 aa  94.4  3e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2015  putative RNA methylase  34.27 
 
 		 314 aa  89.7  6e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.128985  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1775  putative RNA methylase  29.55 
 
 		 315 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37849  predicted protein  25.97 
 
 		 469 aa  63.9  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00619482  hitchhiker  0.00164206 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0555  putative RNA methylase  35.44 
 
 		 336 aa  62  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1511  DNA methylase N-4/N-6  34.55 
 
 		 329 aa  62.8  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0592  putative RNA methylase  37.06 
 
 		 225 aa  62  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0852  hypothetical protein  25.08 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0899  hypothetical protein  25.08 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000386994  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1080  hypothetical protein  25.42 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.118177  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0793  putative RNA methylase  25.59 
 
 		 317 aa  59.7  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.314828  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0985  hypothetical protein  25 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0179865  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0801  methyltransferase  25.08 
 
 		 317 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0987  hypothetical protein  25.08 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.86692e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0941  hypothetical protein  25.42 
 
 		 317 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258982  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4390  hypothetical protein  25.42 
 
 		 317 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.043324  unclonable  2.45562e-26 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0020  putative RNA methylase  32.17 
 
 		 359 aa  57  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  33.9 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1659  putative RNA methylase  39.08 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.69991  hitchhiker  0.00475931 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0938  putative RNA methylase  36.11 
 
 		 461 aa  56.6  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000152524  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0686  putative RNA methylase  40.23 
 
 		 224 aa  55.8  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.502689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1026  putative RNA methylase  29.55 
 
 		 379 aa  55.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0797  methyltransferase  23.79 
 
 		 317 aa  53.9  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.212906  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.32 
 
 		 947 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  34.59 
 
 		 281 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1582  putative RNA methylase  33.33 
 
 		 357 aa  52  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6722  putative RNA methylase  31.19 
 
 		 292 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.121582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50882  predicted protein  33.33 
 
 		 437 aa  51.6  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.933008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2594  Methyltransferase type 11  30.83 
 
 		 262 aa  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0615  putative RNA methylase  26.54 
 
 		 247 aa  51.2  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3798  putative RNA methylase  40.91 
 
 		 495 aa  50.4  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2184  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.66 
 
 		 371 aa  50.4  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0490664  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3216  methyltransferase type 11  36.52 
 
 		 275 aa  49.7  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0408  putative RNA methylase  27.75 
 
 		 334 aa  49.7  0.00008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1720  putative RNA methylase  27.75 
 
 		 333 aa  49.7  0.00008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0118315  decreased coverage  0.000010347 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1670  methyltransferase type 11  32.79 
 
 		 269 aa  49.3  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1068  methyltransferase type 11  31.54 
 
 		 417 aa  48.9  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1988  Methyltransferase type 11  32.79 
 
 		 269 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0306  putative RNA methylase  27.54 
 
 		 259 aa  48.1  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0220171  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1055  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  33.33 
 
 		 849 aa  48.5  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000157491  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0006  methyltransferase small  33.33 
 
 		 209 aa  47.8  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1295  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.41 
 
 		 238 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2993  putative RNA methylase  26.01 
 
 		 350 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.021793 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4087  putative RNA methylase  26.36 
 
 		 329 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134174  normal  0.0349253 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2383  DNA modification methylase-like protein  30.3 
 
 		 307 aa  47.4  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.389013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1303  adenine-specific DNA methylase  37.31 
 
 		 418 aa  47  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404813  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46667  predicted protein  29.09 
 
 		 407 aa  46.6  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000285814  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1038  putative RNA methylase  29.76 
 
 		 249 aa  46.6  0.0006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1590  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.95 
 
 		 385 aa  46.6  0.0007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000278078  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2450  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  36.51 
 
 		 368 aa  46.2  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3585  putative RNA methylase  29.85 
 
 		 352 aa  46.6  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.626531  hitchhiker  0.0000715951 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1428  arsenite S-adenosylmethyltransferase  37.93 
 
 		 268 aa  46.2  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.86 
 
 		 230 aa  45.8  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3799  putative RNA methylase  38.46 
 
 		 393 aa  45.8  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0905  Methyltransferase type 11  38.75 
 
 		 216 aa  45.8  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  30.54 
 
 		 240 aa  45.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3929  UbiE/COQ5 methyltransferase  42.47 
 
 		 269 aa  44.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.880276  normal  0.214466 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0109  methyltransferase type 11  39.52 
 
 		 236 aa  45.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2276  putative RNA methylase  25.74 
 
 		 349 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1456  putative RNA methylase  41.51 
 
 		 463 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1246  Methyltransferase type 11  36.13 
 
 		 288 aa  45.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0909  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  26.58 
 
 		 535 aa  44.3  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.90275  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1254  putative RNA methylase  26.59 
 
 		 330 aa  44.3  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.00904523  normal  0.667506 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2185  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.58 
 
 		 238 aa  44.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  31.76 
 
 		 263 aa  44.3  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4038  putative RNA methylase  37.25 
 
 		 483 aa  44.3  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00846703 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  34.45 
 
 		 266 aa  44.3  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  32.81 
 
 		 276 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0386  methyltransferase  27.46 
 
 		 225 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1026  methyltransferase type 11  33.08 
 
 		 270 aa  43.5  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  34.02 
 
 		 266 aa  43.9  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4211  methyltransferase type 11  30 
 
 		 250 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1592  methyltransferase type 11  28.93 
 
 		 225 aa  43.5  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.367784  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4077  hypothetical protein  32.73 
 
 		 614 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.180847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4277  methyltransferase type 11  30 
 
 		 252 aa  43.1  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4438  methyltransferase type 11  30 
 
 		 252 aa  43.1  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6055  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 360 aa  43.1  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  29.1 
 
 		 280 aa  43.1  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0738  methyltransferase type 11  34.15 
 
 		 236 aa  43.1  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1984  putative RNA methylase  38.2 
 
 		 227 aa  42.7  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>