62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0132 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_0132  putative RNA methylase  100 
 
 		 371 aa  724    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1864  putative RNA methylase  72.04 
 
 		 365 aa  484  1e-135  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.382861  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0722  putative RNA methylase  61.2 
 
 		 334 aa  387  1e-106  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1249  putative RNA methylase  58.42 
 
 		 343 aa  353  4e-96  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2630  putative RNA methylase  58.31 
 
 		 356 aa  346  5e-94  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1330  N2-methylguanosine tRNA methyltransferase  33.43 
 
 		 355 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.315731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0420  hypothetical protein  32.15 
 
 		 317 aa  167  4e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0587292 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2321  putative RNA methylase  32.97 
 
 		 318 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.334147  normal  0.512947 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1623  putative RNA methylase  33.22 
 
 		 344 aa  152  1e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.236365  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0125  putative RNA methylase  32.34 
 
 		 317 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1006  putative RNA methylase  33.33 
 
 		 346 aa  143  5e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1059  putative RNA methylase  32.07 
 
 		 317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000310515  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1210  putative RNA methylase  29.46 
 
 		 322 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00394731 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1154  putative RNA methylase  28.04 
 
 		 364 aa  113  6e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0801  putative RNA methylase  24.92 
 
 		 351 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1149  putative RNA methylase  26.07 
 
 		 350 aa  110  3e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0482589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1526  putative RNA methylase  25.08 
 
 		 350 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0667  putative RNA methylase  25.57 
 
 		 367 aa  98.6  2e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.107618  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0103  putative RNA methylase  29.47 
 
 		 310 aa  87.8  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.802972  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1789  putative RNA methylase  34.41 
 
 		 304 aa  87  5e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1775  putative RNA methylase  25.54 
 
 		 315 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0700  putative RNA methylase  31.82 
 
 		 374 aa  80.9  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.46275  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2015  putative RNA methylase  24.6 
 
 		 314 aa  71.2  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.128985  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1080  hypothetical protein  30.27 
 
 		 317 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.118177  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0941  hypothetical protein  30.27 
 
 		 317 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258982  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4390  hypothetical protein  30.27 
 
 		 317 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.043324  unclonable  2.45562e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0793  putative RNA methylase  29.73 
 
 		 317 aa  65.1  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.314828  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0899  hypothetical protein  28.96 
 
 		 284 aa  62.8  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000386994  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0852  hypothetical protein  28.96 
 
 		 317 aa  62.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0987  hypothetical protein  28.96 
 
 		 297 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.86692e-62 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0797  methyltransferase  28.96 
 
 		 317 aa  62  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.212906  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0801  methyltransferase  28.96 
 
 		 317 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37849  predicted protein  27.57 
 
 		 469 aa  62  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00619482  hitchhiker  0.00164206 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0985  hypothetical protein  29.19 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0179865  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45681  predicted protein  29.89 
 
 		 591 aa  58.5  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0938  putative RNA methylase  46.94 
 
 		 461 aa  54.3  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000152524  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0592  putative RNA methylase  30.87 
 
 		 225 aa  53.5  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0020  putative RNA methylase  27.52 
 
 		 359 aa  53.1  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0408  putative RNA methylase  23.95 
 
 		 334 aa  53.1  0.000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1720  putative RNA methylase  24.33 
 
 		 333 aa  52.8  0.000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0118315  decreased coverage  0.000010347 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10450  RNA methylase family UPF0020 protein (AFU_orthologue; AFUA_4G12140)  27.81 
 
 		 499 aa  52.8  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1254  putative RNA methylase  24.74 
 
 		 330 aa  52.8  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.00904523  normal  0.667506 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1659  putative RNA methylase  31.36 
 
 		 224 aa  51.2  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.69991  hitchhiker  0.00475931 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1100  putative RNA methylase  25.48 
 
 		 329 aa  49.3  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0217  methyltransferase  30.6 
 
 		 200 aa  49.3  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34.48 
 
 		 947 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3798  putative RNA methylase  30.58 
 
 		 495 aa  48.5  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  38 
 
 		 266 aa  48.5  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50882  predicted protein  30.84 
 
 		 437 aa  48.5  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.933008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1038  putative RNA methylase  27.63 
 
 		 249 aa  47  0.0005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2905  Methyltransferase type 11  27.4 
 
 		 234 aa  46.2  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0286  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  40.3 
 
 		 271 aa  45.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.684049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1305  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 235 aa  45.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4560  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.27 
 
 		 258 aa  45.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2460  methyltransferase type 11  41.1 
 
 		 260 aa  43.9  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.930517  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1820  Methyltransferase type 11  32.73 
 
 		 315 aa  43.5  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6843  putative RNA methylase  36.76 
 
 		 305 aa  43.5  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0223663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1460  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.25 
 
 		 702 aa  43.1  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.372421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6055  Methyltransferase type 11  28.21 
 
 		 360 aa  43.1  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.1 
 
 		 239 aa  43.1  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000221573  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2276  putative RNA methylase  31.76 
 
 		 349 aa  43.1  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0857  protein of unknown function Met10  44.44 
 
 		 381 aa  42.7  0.01  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.149196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>