179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0103 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0103  putative RNA methylase  100 
 
 
310 aa  625  1e-178  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.802972  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0801  putative RNA methylase  32.73 
 
 
351 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1149  putative RNA methylase  34.8 
 
 
350 aa  129  6e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0482589  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1526  putative RNA methylase  35.2 
 
 
350 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1330  N2-methylguanosine tRNA methyltransferase  33.49 
 
 
355 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.315731  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1154  putative RNA methylase  34.4 
 
 
364 aa  124  1e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0125  putative RNA methylase  27.3 
 
 
317 aa  124  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1623  putative RNA methylase  29.25 
 
 
344 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.236365  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0420  hypothetical protein  28.22 
 
 
317 aa  113  5e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0587292 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1059  putative RNA methylase  31.9 
 
 
317 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000310515  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1006  putative RNA methylase  34.78 
 
 
346 aa  108  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2321  putative RNA methylase  31.22 
 
 
318 aa  106  5e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.334147  normal  0.512947 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0667  putative RNA methylase  38.01 
 
 
367 aa  105  9e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.107618  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1210  putative RNA methylase  29.96 
 
 
322 aa  101  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00394731 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2015  putative RNA methylase  36.59 
 
 
314 aa  94  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.128985  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1249  putative RNA methylase  29.55 
 
 
343 aa  93.2  6e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1775  putative RNA methylase  32.09 
 
 
315 aa  92.4  9e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0722  putative RNA methylase  28.9 
 
 
334 aa  92  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1789  putative RNA methylase  35.8 
 
 
304 aa  92  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1864  putative RNA methylase  29.38 
 
 
365 aa  91.7  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.382861  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0132  putative RNA methylase  29.47 
 
 
371 aa  75.9  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1080  hypothetical protein  25.52 
 
 
317 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.118177  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0793  putative RNA methylase  25.09 
 
 
317 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.314828  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0852  hypothetical protein  24.91 
 
 
317 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0899  hypothetical protein  24.91 
 
 
284 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000386994  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2630  putative RNA methylase  23.81 
 
 
356 aa  73.9  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0987  hypothetical protein  25.09 
 
 
297 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.86692e-62 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0801  methyltransferase  25.09 
 
 
317 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4390  hypothetical protein  25.17 
 
 
317 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.043324  unclonable  2.45562e-26 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0700  putative RNA methylase  25.93 
 
 
374 aa  72.4  0.000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.46275  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0941  hypothetical protein  25.17 
 
 
317 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258982  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0797  methyltransferase  23.97 
 
 
317 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.212906  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1659  putative RNA methylase  40.86 
 
 
224 aa  67.8  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.69991  hitchhiker  0.00475931 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0985  hypothetical protein  26.9 
 
 
284 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0179865  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0686  putative RNA methylase  40 
 
 
224 aa  65.5  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.502689  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45681  predicted protein  37.96 
 
 
591 aa  64.3  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37849  predicted protein  29.68 
 
 
469 aa  63.5  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00619482  hitchhiker  0.00164206 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1690  hypothetical protein  28.05 
 
 
381 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1468  hypothetical protein  28.05 
 
 
379 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1440  methyltransferase  28.05 
 
 
379 aa  62  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1441  methyltransferase  28.05 
 
 
379 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00219601  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1584  hypothetical protein  28.05 
 
 
379 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3727  hypothetical protein  28.05 
 
 
379 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00339425  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1729  hypothetical protein  28.05 
 
 
379 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188996  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1654  hypothetical protein  28.05 
 
 
379 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0207358 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1617  hypothetical protein  28.05 
 
 
379 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.595181  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0592  putative RNA methylase  32.74 
 
 
225 aa  61.6  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1460  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  24.41 
 
 
702 aa  60.1  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.372421  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1484  putative RNA methylase  28.29 
 
 
379 aa  59.7  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0140153  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1282  putative RNA methylase  28.29 
 
 
379 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000499107  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2429  putative RNA methylase  27.27 
 
 
384 aa  58.5  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.365067  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3242  putative RNA methylase  25.64 
 
 
382 aa  57.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000019855  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0293  putative RNA methylase  26.83 
 
 
377 aa  57.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.107871  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0366  putative RNA methylase  27.27 
 
 
380 aa  57.4  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000203497  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2083  methyltransferase small  26.86 
 
 
204 aa  57  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0180  putative RNA methylase  31.97 
 
 
340 aa  57  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.504589  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0028  hypothetical protein  23.59 
 
 
400 aa  56.2  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138235  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50882  predicted protein  29.83 
 
 
437 aa  56.2  0.0000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.933008  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.95 
 
 
947 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2939  putative RNA methylase  26.21 
 
 
390 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000322588  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00740  hypothetical protein  29.79 
 
 
475 aa  53.9  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.635907  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0287  putative RNA methylase  25.13 
 
 
379 aa  54.3  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0217  methyltransferase  29.29 
 
 
200 aa  53.9  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1743  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  22.5 
 
 
706 aa  53.9  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.171189  hitchhiker  0.000865534 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3798  putative RNA methylase  38.33 
 
 
495 aa  53.5  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0020  putative RNA methylase  27.89 
 
 
359 aa  53.5  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1437  methyltransferase  26.67 
 
 
203 aa  52.8  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0555  putative RNA methylase  24.5 
 
 
336 aa  52  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1984  putative RNA methylase  35.42 
 
 
227 aa  52.4  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1170  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  24.14 
 
 
702 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.988002  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1421  putative RNA methylase  26.74 
 
 
375 aa  51.2  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1019  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  24.14 
 
 
702 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000163679  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2102  putative methyltransferase  24.75 
 
 
375 aa  51.6  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486637  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1816  methyltransferase, putative  24.75 
 
 
375 aa  51.6  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.961633  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2369  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  24.82 
 
 
702 aa  51.2  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0183103  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1136  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  24.14 
 
 
702 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.237115  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1540  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  24.74 
 
 
713 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1607  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  24.74 
 
 
713 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00710463  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0006  methyltransferase small  27.34 
 
 
209 aa  51.6  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1601  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  24.74 
 
 
713 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0419159  normal  0.867514 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1123  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  24.14 
 
 
702 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.482785  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1102  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  24.14 
 
 
702 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.907291  normal  0.597986 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00952  predicted methyltransferase  24.82 
 
 
702 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000729792  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2695  putative RNA methylase  24.82 
 
 
702 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0489936  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00959  hypothetical protein  24.82 
 
 
702 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000774517  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1851  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  24.74 
 
 
711 aa  50.8  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1987  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  20 
 
 
706 aa  50.8  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2641  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  20 
 
 
706 aa  50.8  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2648  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  24.82 
 
 
702 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0833868  hitchhiker  0.000556962 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2552  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  20 
 
 
706 aa  50.8  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0971  putative RNA methylase  23.56 
 
 
384 aa  50.4  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.143771  normal  0.522905 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1057  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  24.82 
 
 
702 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000581203  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1063  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  24.82 
 
 
702 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000372198  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2171  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  24.82 
 
 
702 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000766949  normal  0.466381 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1632  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  24.74 
 
 
709 aa  50.4  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0586736  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2473  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  23.67 
 
 
711 aa  50.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00287682 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2685  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  23.83 
 
 
709 aa  49.7  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.379022  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2610  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  23.83 
 
 
709 aa  49.7  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000568014  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0731  methyltransferase  22.08 
 
 
192 aa  49.3  0.00008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.557885  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1680  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  22.7 
 
 
707 aa  49.3  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.719337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>