27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_50882 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009048  PICST_50882  predicted protein  100 
 
 		 437 aa  906    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.933008  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10450  RNA methylase family UPF0020 protein (AFU_orthologue; AFUA_4G12140)  43.08 
 
 		 499 aa  391  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00740  hypothetical protein  36.1 
 
 		 475 aa  246  8e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.635907  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37849  predicted protein  33.84 
 
 		 469 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00619482  hitchhiker  0.00164206 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45681  predicted protein  28.87 
 
 		 591 aa  179  8e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0801  putative RNA methylase  33.62 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1149  putative RNA methylase  33.62 
 
 		 350 aa  62.8  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0482589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1526  putative RNA methylase  32.76 
 
 		 350 aa  62  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0667  putative RNA methylase  29.84 
 
 		 367 aa  59.7  0.00000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.107618  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1059  putative RNA methylase  29.26 
 
 		 317 aa  59.3  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000310515  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1154  putative RNA methylase  29.46 
 
 		 364 aa  56.6  0.0000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0103  putative RNA methylase  29.83 
 
 		 310 aa  56.2  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.802972  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0722  putative RNA methylase  29.41 
 
 		 334 aa  53.9  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1006  putative RNA methylase  33.33 
 
 		 346 aa  51.6  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1210  putative RNA methylase  24.28 
 
 		 322 aa  50.8  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00394731 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1330  N2-methylguanosine tRNA methyltransferase  26.51 
 
 		 355 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.315731  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2015  putative RNA methylase  31.03 
 
 		 314 aa  49.7  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.128985  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0592  putative RNA methylase  33.33 
 
 		 225 aa  48.5  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1789  putative RNA methylase  27.22 
 
 		 304 aa  48.9  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0700  putative RNA methylase  28.68 
 
 		 374 aa  48.9  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.46275  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1864  putative RNA methylase  31.78 
 
 		 365 aa  47.8  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.382861  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1249  putative RNA methylase  28.83 
 
 		 343 aa  47.4  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0420  hypothetical protein  29.2 
 
 		 317 aa  46.2  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0587292 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1659  putative RNA methylase  32.26 
 
 		 224 aa  45.4  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.69991  hitchhiker  0.00475931 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2321  putative RNA methylase  33.33 
 
 		 318 aa  43.9  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.334147  normal  0.512947 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1623  putative RNA methylase  20.61 
 
 		 344 aa  43.9  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.236365  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0125  putative RNA methylase  30.11 
 
 		 317 aa  43.1  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>