113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1526 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1526  putative RNA methylase  100 
 
 
350 aa  707    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1149  putative RNA methylase  91.71 
 
 
350 aa  657    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0482589  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0801  putative RNA methylase  92 
 
 
351 aa  662    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1154  putative RNA methylase  68 
 
 
364 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0667  putative RNA methylase  49.33 
 
 
367 aa  326  3e-88  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.107618  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1330  N2-methylguanosine tRNA methyltransferase  34.08 
 
 
355 aa  182  9.000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.315731  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1623  putative RNA methylase  29.53 
 
 
344 aa  154  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.236365  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0125  putative RNA methylase  29.97 
 
 
317 aa  143  4e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1006  putative RNA methylase  29.58 
 
 
346 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1059  putative RNA methylase  34.07 
 
 
317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000310515  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1210  putative RNA methylase  33.21 
 
 
322 aa  132  9e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00394731 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0103  putative RNA methylase  35.2 
 
 
310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.802972  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2321  putative RNA methylase  30.53 
 
 
318 aa  124  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.334147  normal  0.512947 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0420  hypothetical protein  29.89 
 
 
317 aa  124  3e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0587292 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1249  putative RNA methylase  27.37 
 
 
343 aa  106  7e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1775  putative RNA methylase  32.39 
 
 
315 aa  102  1e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0722  putative RNA methylase  25.98 
 
 
334 aa  101  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2630  putative RNA methylase  27.02 
 
 
356 aa  100  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1864  putative RNA methylase  25.44 
 
 
365 aa  100  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.382861  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0132  putative RNA methylase  25.08 
 
 
371 aa  98.2  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2015  putative RNA methylase  33.65 
 
 
314 aa  95.9  9e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.128985  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1789  putative RNA methylase  30.94 
 
 
304 aa  88.2  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0700  putative RNA methylase  25.94 
 
 
374 aa  75.5  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.46275  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0686  putative RNA methylase  32.28 
 
 
224 aa  72.8  0.000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.502689  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45681  predicted protein  29.29 
 
 
591 aa  72.8  0.000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37849  predicted protein  25.13 
 
 
469 aa  67.8  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00619482  hitchhiker  0.00164206 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1659  putative RNA methylase  29.01 
 
 
224 aa  67.4  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.69991  hitchhiker  0.00475931 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50882  predicted protein  32.76 
 
 
437 aa  62  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.933008  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0592  putative RNA methylase  29.38 
 
 
225 aa  61.6  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10450  RNA methylase family UPF0020 protein (AFU_orthologue; AFUA_4G12140)  30 
 
 
499 aa  60.8  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0151  putative RNA methylase  27.92 
 
 
356 aa  60.5  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0020  putative RNA methylase  28.57 
 
 
359 aa  59.3  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0985  hypothetical protein  26.6 
 
 
284 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0179865  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0408  putative RNA methylase  23.39 
 
 
334 aa  58.2  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0306  putative RNA methylase  35.2 
 
 
259 aa  57.4  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0220171  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0555  putative RNA methylase  23.63 
 
 
336 aa  57  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0793  putative RNA methylase  25.29 
 
 
317 aa  57  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.314828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0801  methyltransferase  25.99 
 
 
317 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0899  hypothetical protein  25.29 
 
 
284 aa  56.6  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000386994  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0987  hypothetical protein  25.29 
 
 
297 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.86692e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0852  hypothetical protein  25.29 
 
 
317 aa  56.2  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1080  hypothetical protein  23.96 
 
 
317 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.118177  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1720  putative RNA methylase  23.56 
 
 
333 aa  55.1  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0118315  decreased coverage  0.000010347 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0941  hypothetical protein  25.42 
 
 
317 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258982  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4390  hypothetical protein  25.42 
 
 
317 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.043324  unclonable  2.45562e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0797  methyltransferase  24.62 
 
 
317 aa  54.3  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.212906  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0366  putative RNA methylase  24.91 
 
 
380 aa  53.9  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000203497  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6722  putative RNA methylase  27.27 
 
 
292 aa  52.8  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.121582  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2778  N-6 DNA methylase  26.21 
 
 
405 aa  52  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.63238e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1254  putative RNA methylase  25.27 
 
 
330 aa  52.4  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.00904523  normal  0.667506 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1038  putative RNA methylase  29.65 
 
 
249 aa  51.2  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2993  putative RNA methylase  33.96 
 
 
350 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.021793 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2309  RNA methyltransferase  26.28 
 
 
493 aa  50.1  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.12141  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1032  putative RNA methylase  27.54 
 
 
399 aa  49.7  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1104  type I restriction-modification system, M subunit  25.86 
 
 
519 aa  49.7  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2746  type I restriction-modification system, M subunit  28.57 
 
 
480 aa  48.9  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.453882  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1484  putative RNA methylase  24.87 
 
 
379 aa  48.9  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0140153  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46959  predicted protein  26.11 
 
 
460 aa  49.3  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.897224  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1218  protein of unknown function Met10  38.1 
 
 
389 aa  48.9  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0747272  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0871  hypothetical protein  28.44 
 
 
281 aa  48.5  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0006  methyltransferase small  25.4 
 
 
209 aa  48.1  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0055  S-adenosyl-methyltransferase MraW  30.63 
 
 
299 aa  48.1  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000417254  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003234  type I restriction-modification system DNA-methyltransferase subunit M  31.73 
 
 
794 aa  48.5  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1282  putative RNA methylase  25.39 
 
 
379 aa  48.1  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000499107  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.91 
 
 
947 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0293  putative RNA methylase  27.04 
 
 
377 aa  48.5  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.107871  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0055  S-adenosyl-methyltransferase MraW  30.63 
 
 
299 aa  48.1  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00424727  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2450  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.57 
 
 
368 aa  48.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1421  putative RNA methylase  28.66 
 
 
375 aa  48.5  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2689  N-6 DNA methylase  25 
 
 
709 aa  47.4  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.227134 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0850  N-6 DNA methylase  28.43 
 
 
675 aa  47.4  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.149563 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1939  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.16 
 
 
375 aa  47  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000888828  hitchhiker  0.0000001156 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1763  putative RNA methylase  26.86 
 
 
371 aa  47.4  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4087  putative RNA methylase  25.37 
 
 
329 aa  47.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134174  normal  0.0349253 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1100  putative RNA methylase  22.48 
 
 
329 aa  47  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1984  putative RNA methylase  29.27 
 
 
227 aa  47  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1367  putative DNA methylase HsdM  30.77 
 
 
793 aa  47  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1690  hypothetical protein  24.35 
 
 
381 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1468  hypothetical protein  24.35 
 
 
379 aa  46.6  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1440  methyltransferase  24.35 
 
 
379 aa  46.6  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1441  methyltransferase  24.35 
 
 
379 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00219601  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1584  hypothetical protein  24.35 
 
 
379 aa  46.6  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1729  hypothetical protein  24.35 
 
 
379 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188996  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1617  hypothetical protein  24.35 
 
 
379 aa  47  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.595181  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3727  hypothetical protein  24.35 
 
 
379 aa  47  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00339425  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1654  hypothetical protein  24.35 
 
 
379 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0207358 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00740  hypothetical protein  25.6 
 
 
475 aa  46.2  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.635907  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1026  putative RNA methylase  27.7 
 
 
379 aa  46.6  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1725  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.7 
 
 
524 aa  46.2  0.0008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110429  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1331  S-adenosyl-methyltransferase MraW  32.69 
 
 
293 aa  45.4  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0028  hypothetical protein  19.71 
 
 
400 aa  45.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138235  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4819  N-6 DNA methylase  30.19 
 
 
499 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0971  putative RNA methylase  21.76 
 
 
384 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.143771  normal  0.522905 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2276  putative RNA methylase  27.61 
 
 
349 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0180  putative RNA methylase  27.96 
 
 
340 aa  44.3  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.504589  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0079  type I restriction-modification system, M subunit  24.32 
 
 
520 aa  44.7  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0610  restriction modification system DNA specificity subunit  25.86 
 
 
730 aa  44.7  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1670  DNA methyltransferase  39.71 
 
 
380 aa  44.7  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1545  type I restriction-modification system, M subunit  25.22 
 
 
522 aa  44.3  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.648114  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2419  hypothetical protein  28.04 
 
 
212 aa  44.3  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>