94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0938 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0938  putative RNA methylase  100 
 
 		 461 aa  950    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000152524  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.11 
 
 		 947 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3798  putative RNA methylase  27.84 
 
 		 495 aa  93.6  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4038  putative RNA methylase  25.55 
 
 		 483 aa  90.9  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00846703 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4077  hypothetical protein  25.19 
 
 		 614 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.180847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0328  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.82 
 
 		 383 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3799  putative RNA methylase  24.01 
 
 		 393 aa  80.5  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2251  hypothetical protein  24.06 
 
 		 393 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5156  hypothetical protein  25.49 
 
 		 393 aa  73.6  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000726262 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1620  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.01 
 
 		 414 aa  72.8  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5607  modification methylase, putative  23.26 
 
 		 430 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0295584  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0684  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  32.33 
 
 		 528 aa  67.4  0.0000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1725  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  33.33 
 
 		 524 aa  67  0.0000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110429  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0909  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  40.66 
 
 		 535 aa  65.9  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.90275  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0332  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  35.87 
 
 		 530 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00994221  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6814  hypothetical protein  25 
 
 		 433 aa  62  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.823873  normal  0.941535 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0931  adenine-specific DNA methylase  26.56 
 
 		 412 aa  61.6  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.316794  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1233  hypothetical protein  23.85 
 
 		 438 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241867  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1456  putative RNA methylase  44.12 
 
 		 463 aa  60.5  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2284  hypothetical protein  24.11 
 
 		 450 aa  60.1  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2226  hypothetical protein  24.59 
 
 		 467 aa  59.3  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0125  putative RNA methylase  41.18 
 
 		 317 aa  58.9  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1872  hypothetical protein  24.91 
 
 		 433 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.682405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1864  putative RNA methylase  46.03 
 
 		 365 aa  57.4  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.382861  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1658  adenine-specific DNA methylase  33.33 
 
 		 416 aa  57  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000448906  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5606  modification methylase, putative  23.9 
 
 		 438 aa  56.6  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166814  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1006  putative RNA methylase  36.11 
 
 		 346 aa  56.6  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0722  putative RNA methylase  34.52 
 
 		 334 aa  56.2  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0737  hypothetical protein  21.45 
 
 		 407 aa  55.5  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00870561  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3603  adenine-specific DNA methylase  35.37 
 
 		 453 aa  55.1  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4397  hypothetical protein  33.78 
 
 		 475 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.050702 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1775  putative RNA methylase  51.16 
 
 		 315 aa  54.3  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1330  N2-methylguanosine tRNA methyltransferase  34.72 
 
 		 355 aa  53.5  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.315731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0306  putative RNA methylase  42.19 
 
 		 259 aa  53.5  0.000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0220171  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4787  hypothetical protein  21.47 
 
 		 441 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0117  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  32.69 
 
 		 315 aa  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00741013  normal  0.263203 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0460  putative RNA methylase  40.28 
 
 		 259 aa  52.4  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.258821  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1918  putative modification methylase  23.82 
 
 		 353 aa  52.4  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00266275  hitchhiker  0.00000000000360377 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1249  putative RNA methylase  44.9 
 
 		 343 aa  52  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1833  hypothetical protein  23.48 
 
 		 444 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3051  methyltransferase DNA modification enzyme  30.21 
 
 		 421 aa  50.4  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0407  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  23.41 
 
 		 476 aa  50.4  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.144423 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3347  adenine-specific DNA methylase  34.72 
 
 		 878 aa  50.4  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2731  methyltransferase DNA modification enzyme  23.32 
 
 		 410 aa  50.4  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1917  putative modification methylase  22.09 
 
 		 482 aa  50.1  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0419467  hitchhiker  0.0000000000400101 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3922  hypothetical protein  21.88 
 
 		 439 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0070396  normal  0.271721 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0642  hypothetical protein  33.33 
 
 		 435 aa  49.7  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3873  hypothetical protein  21.88 
 
 		 439 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1511  DNA methylase N-4/N-6  42.19 
 
 		 329 aa  49.7  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0420  hypothetical protein  34.55 
 
 		 317 aa  49.3  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0587292 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00415  adenine-specific DNA modification methyltransferase  22.93 
 
 		 374 aa  49.3  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.530575  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1426  hypothetical protein  22.22 
 
 		 432 aa  49.3  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1681  cyclase family protein  21.34 
 
 		 366 aa  48.9  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.259173  hitchhiker  0.0000210949 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1059  putative RNA methylase  31.58 
 
 		 317 aa  48.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000310515  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1623  putative RNA methylase  38.46 
 
 		 344 aa  48.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.236365  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4359  hypothetical protein  32.91 
 
 		 425 aa  48.5  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000708265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1303  adenine-specific DNA methylase  31.71 
 
 		 418 aa  48.1  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404813  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0114  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.58 
 
 		 353 aa  47.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0103  putative RNA methylase  27.17 
 
 		 310 aa  47.4  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.802972  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2206  methyltransferase DNA modification enzyme  36.76 
 
 		 414 aa  47  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.612218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3164  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  43.86 
 
 		 225 aa  47.4  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0356148  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3181  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  22.25 
 
 		 482 aa  47  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1210  putative RNA methylase  29.76 
 
 		 322 aa  47  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00394731 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1717  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.43 
 
 		 739 aa  46.6  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000410476  hitchhiker  0.00177802 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3357  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  42.11 
 
 		 225 aa  46.6  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0286  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  46.15 
 
 		 271 aa  45.8  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.684049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3275  adenine-specific DNA methylase  35.29 
 
 		 596 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.762851  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2450  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  42 
 
 		 368 aa  46.2  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2184  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.1 
 
 		 371 aa  45.8  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0490664  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1386  adenine-specific DNA methylase  40.74 
 
 		 540 aa  45.8  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0156455 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0667  putative RNA methylase  38.89 
 
 		 367 aa  45.1  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.107618  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0120  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40.35 
 
 		 225 aa  45.1  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0225106 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1626  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.57 
 
 		 284 aa  45.1  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2281  adenine-specific DNA methylase  25 
 
 		 751 aa  44.7  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0186187  hitchhiker  0.00483181 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2761  adenine-specific DNA methylase  34.48 
 
 		 892 aa  44.7  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0627  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  56.41 
 
 		 274 aa  44.3  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1154  putative RNA methylase  25.36 
 
 		 364 aa  44.7  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0442  putative RNA methylase  31.43 
 
 		 258 aa  44.3  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1246  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  61.76 
 
 		 293 aa  44.7  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0940338  hitchhiker  0.00345461 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1939  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  36.05 
 
 		 375 aa  44.3  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000888828  hitchhiker  0.0000001156 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0382  protein of unknown function DUF1156  31.94 
 
 		 894 aa  44.3  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.41417  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2196  adenine-specific DNA methylase  37.5 
 
 		 747 aa  43.9  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2630  putative RNA methylase  38.78 
 
 		 356 aa  43.9  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3032  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.7 
 
 		 352 aa  43.9  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.157479 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0021  DNA modification methylase-like protein  32.81 
 
 		 481 aa  43.9  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0801  putative RNA methylase  29.81 
 
 		 351 aa  43.9  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1149  putative RNA methylase  29.81 
 
 		 350 aa  43.9  0.007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0482589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0132  putative RNA methylase  46.94 
 
 		 371 aa  43.5  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2196  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  52.27 
 
 		 292 aa  43.5  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3593  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.51 
 
 		 372 aa  43.5  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.316349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0790  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  41.38 
 
 		 293 aa  43.5  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  35.21 
 
 		 377 aa  43.5  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.220402  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3012  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  22.41 
 
 		 477 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1741  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.89 
 
 		 158 aa  43.5  0.009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.902503  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>