50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4359 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4359  hypothetical protein  100 
 
 
425 aa  879    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000708265  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1833  hypothetical protein  28.87 
 
 
444 aa  154  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1233  hypothetical protein  29.24 
 
 
438 aa  149  8e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241867  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0068  hypothetical protein  24.55 
 
 
464 aa  89.7  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00010049  hitchhiker  0.00158155 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00410  adenine-specific DNA modification methyltransferase  20.57 
 
 
412 aa  88.6  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1872  hypothetical protein  24.42 
 
 
433 aa  80.1  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.682405  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5607  modification methylase, putative  23.4 
 
 
430 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0295584  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2284  hypothetical protein  21.2 
 
 
450 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2828  hypothetical protein  23.19 
 
 
474 aa  73.2  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0325  hypothetical protein  23.15 
 
 
431 aa  70.1  0.00000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.103576  hitchhiker  0.00000188519 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1658  adenine-specific DNA methylase  23.74 
 
 
416 aa  69.7  0.00000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000448906  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0227  adenine-specific DNA modification methyltransferase  24.45 
 
 
877 aa  68.9  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0765559  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3603  adenine-specific DNA methylase  20.69 
 
 
453 aa  65.9  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3873  hypothetical protein  23.02 
 
 
439 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3922  hypothetical protein  23.02 
 
 
439 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0070396  normal  0.271721 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2187  hypothetical protein  40.2 
 
 
110 aa  64.7  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1917  putative modification methylase  23.23 
 
 
482 aa  64.3  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0419467  hitchhiker  0.0000000000400101 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1306  hypothetical protein  21.52 
 
 
414 aa  64.3  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000125163  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4397  hypothetical protein  20.09 
 
 
475 aa  63.9  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.050702 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1122  DNA methyltransferase  21.33 
 
 
416 aa  62.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.909173  normal  0.0173084 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1918  putative modification methylase  22.79 
 
 
353 aa  60.1  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00266275  hitchhiker  0.00000000000360377 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3012  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  21.57 
 
 
477 aa  59.7  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5606  modification methylase, putative  22.16 
 
 
438 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166814  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1426  hypothetical protein  23 
 
 
432 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.55 
 
 
947 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1620  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.1 
 
 
414 aa  58.2  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4009  hypothetical protein  43.75 
 
 
512 aa  57.8  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000517991  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0958  hypothetical protein  21.23 
 
 
408 aa  56.2  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00607753 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3181  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  23.29 
 
 
482 aa  56.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2825  DNA methylase N-4/N-6  37.35 
 
 
373 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.364595 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0407  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  21.23 
 
 
476 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.144423 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4787  hypothetical protein  22.49 
 
 
441 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3798  putative RNA methylase  21.47 
 
 
495 aa  53.5  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3051  methyltransferase DNA modification enzyme  26.25 
 
 
421 aa  52.8  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0894  hypothetical protein  21.78 
 
 
445 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.118931  hitchhiker  0.00000342492 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0642  hypothetical protein  21.31 
 
 
435 aa  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3799  putative RNA methylase  26.34 
 
 
393 aa  50.4  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0328  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.99 
 
 
383 aa  49.3  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2251  hypothetical protein  21.26 
 
 
393 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0938  putative RNA methylase  32.91 
 
 
461 aa  48.5  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000152524  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2226  hypothetical protein  23.35 
 
 
467 aa  48.5  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0684  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.06 
 
 
528 aa  47.4  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0534  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  30.85 
 
 
239 aa  45.8  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000146587 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1456  putative RNA methylase  26.45 
 
 
463 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2353  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  38.6 
 
 
854 aa  43.9  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2855  DNA methylase N-4/N-6  31.11 
 
 
285 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0194641  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0737  hypothetical protein  24.53 
 
 
407 aa  43.9  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00870561  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0872  nuclease  40 
 
 
684 aa  43.1  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1546  DNA methylase N-4/N-6  37.25 
 
 
470 aa  43.1  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.572545  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2277  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  37.7 
 
 
421 aa  43.1  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0946567  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>