78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_5607 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_5607  modification methylase, putative  100 
 
 
430 aa  873    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0295584  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1917  putative modification methylase  33.33 
 
 
482 aa  245  9.999999999999999e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0419467  hitchhiker  0.0000000000400101 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0325  hypothetical protein  31.57 
 
 
431 aa  152  1e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.103576  hitchhiker  0.00000188519 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3181  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  30.2 
 
 
482 aa  138  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2828  hypothetical protein  26.67 
 
 
474 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3012  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  26.52 
 
 
477 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0407  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  27.27 
 
 
476 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.144423 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0227  adenine-specific DNA modification methyltransferase  25.37 
 
 
877 aa  117  3e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0765559  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00410  adenine-specific DNA modification methyltransferase  26.79 
 
 
412 aa  115  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1233  hypothetical protein  25 
 
 
438 aa  110  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241867  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0068  hypothetical protein  23.94 
 
 
464 aa  103  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00010049  hitchhiker  0.00158155 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1833  hypothetical protein  23.89 
 
 
444 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4397  hypothetical protein  24.88 
 
 
475 aa  103  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.050702 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1918  putative modification methylase  27.16 
 
 
353 aa  93.2  7e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00266275  hitchhiker  0.00000000000360377 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5606  modification methylase, putative  28.61 
 
 
438 aa  93.2  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166814  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1122  DNA methyltransferase  22.6 
 
 
416 aa  89  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.909173  normal  0.0173084 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1658  adenine-specific DNA methylase  25 
 
 
416 aa  87  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000448906  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1306  hypothetical protein  24.26 
 
 
414 aa  84.3  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000125163  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4038  putative RNA methylase  23.8 
 
 
483 aa  83.2  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00846703 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0958  hypothetical protein  21.28 
 
 
408 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00607753 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3799  putative RNA methylase  24 
 
 
393 aa  78.2  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1303  adenine-specific DNA methylase  24.14 
 
 
418 aa  77  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404813  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4359  hypothetical protein  23.4 
 
 
425 aa  75.1  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000708265  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4009  hypothetical protein  22.67 
 
 
512 aa  73.6  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000517991  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1872  hypothetical protein  28.27 
 
 
433 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.682405  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0931  adenine-specific DNA methylase  23.84 
 
 
412 aa  72.8  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.316794  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2284  hypothetical protein  26.29 
 
 
450 aa  72.4  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0938  putative RNA methylase  23.26 
 
 
461 aa  70.9  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000152524  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0642  hypothetical protein  23.91 
 
 
435 aa  70.5  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  20.77 
 
 
947 aa  66.6  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3691  hypothetical protein  24.03 
 
 
313 aa  63.5  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.454673  normal  0.0109558 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4787  hypothetical protein  22.94 
 
 
441 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3873  hypothetical protein  22.77 
 
 
439 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1456  putative RNA methylase  23.3 
 
 
463 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3922  hypothetical protein  22.77 
 
 
439 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0070396  normal  0.271721 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1725  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  32.47 
 
 
524 aa  58.2  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110429  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1426  hypothetical protein  40 
 
 
432 aa  57.4  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0894  hypothetical protein  31.91 
 
 
445 aa  57  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.118931  hitchhiker  0.00000342492 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6814  hypothetical protein  22.44 
 
 
433 aa  56.6  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.823873  normal  0.941535 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2251  hypothetical protein  25.14 
 
 
393 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2389  putative DNA modification methylase  22.73 
 
 
369 aa  54.7  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.198556  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1000  DNA methyltransferase  37.68 
 
 
472 aa  54.3  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0684  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.97 
 
 
528 aa  51.2  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0909  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  31.03 
 
 
535 aa  51.6  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.90275  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3926  putative DNA modification methylase  24.17 
 
 
345 aa  50.8  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5156  hypothetical protein  22.76 
 
 
393 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000726262 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0332  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  32.22 
 
 
530 aa  50.4  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00994221  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1620  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.51 
 
 
414 aa  50.1  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3603  adenine-specific DNA methylase  22.69 
 
 
453 aa  50.1  0.00009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3097  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  36.36 
 
 
737 aa  50.1  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.622238  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2226  hypothetical protein  20.39 
 
 
467 aa  49.7  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0420  site-specific DNA-methyltransferase  36.76 
 
 
243 aa  48.5  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1948  hypothetical protein  27.42 
 
 
731 aa  48.5  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156697  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1486  site-specific DNA-methyltransferase  36.76 
 
 
243 aa  48.9  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26692  predicted protein  44.74 
 
 
411 aa  48.1  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0281046  decreased coverage  0.00284905 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0442  putative RNA methylase  37.88 
 
 
258 aa  48.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0913  site-specific DNA-methyltransferase  35.29 
 
 
173 aa  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0306  putative RNA methylase  40.62 
 
 
259 aa  47  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0220171  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1409  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  33.82 
 
 
243 aa  46.6  0.0008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0374  hypothetical protein  33.77 
 
 
146 aa  46.6  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000208638  normal  0.261256 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2404  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  37.93 
 
 
305 aa  45.8  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2761  adenine-specific DNA methylase  30.1 
 
 
892 aa  45.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3798  putative RNA methylase  20.37 
 
 
495 aa  45.8  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0833  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  47.92 
 
 
302 aa  45.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2281  adenine-specific DNA methylase  40.91 
 
 
751 aa  45.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0186187  hitchhiker  0.00483181 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1367  hypothetical protein  48.72 
 
 
746 aa  45.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0329  hypothetical protein  22.82 
 
 
417 aa  45.8  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2187  hypothetical protein  28.57 
 
 
110 aa  45.1  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0525  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  52.08 
 
 
284 aa  45.1  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1809  DNA modification methylase-like protein  44.9 
 
 
273 aa  44.7  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1639  DNA methylase N-4/N-6  38.1 
 
 
432 aa  44.3  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3347  adenine-specific DNA methylase  28.57 
 
 
878 aa  44.3  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0675  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  44.07 
 
 
416 aa  44.7  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0041  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  45.76 
 
 
441 aa  43.9  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0382  protein of unknown function DUF1156  36.84 
 
 
894 aa  43.5  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.41417  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0988  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  38 
 
 
225 aa  43.1  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0151076  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0117  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  34.33 
 
 
315 aa  43.1  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00741013  normal  0.263203 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2655  prophage LambdaMc01, DNA methyltransferase  33.73 
 
 
421 aa  43.1  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>