51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1620 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_1620  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  100 
 
 		 414 aa  852    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1681  cyclase family protein  28.39 
 
 		 366 aa  121  3e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.259173  hitchhiker  0.0000210949 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2731  methyltransferase DNA modification enzyme  26.86 
 
 		 410 aa  105  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2206  methyltransferase DNA modification enzyme  26.15 
 
 		 414 aa  105  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.612218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3051  methyltransferase DNA modification enzyme  25.31 
 
 		 421 aa  102  9e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0227  adenine-specific DNA modification methyltransferase  24.82 
 
 		 877 aa  87.4  4e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0765559  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2389  putative DNA modification methylase  26 
 
 		 369 aa  86.7  7e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.198556  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00415  adenine-specific DNA modification methyltransferase  27.04 
 
 		 374 aa  84.3  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.530575  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0328  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.9 
 
 		 383 aa  83.2  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0737  hypothetical protein  23.04 
 
 		 407 aa  83.2  0.000000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00870561  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1456  putative RNA methylase  25.52 
 
 		 463 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2251  hypothetical protein  24.1 
 
 		 393 aa  73.2  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0938  putative RNA methylase  23.01 
 
 		 461 aa  72.4  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000152524  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.08 
 
 		 947 aa  72.4  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3939  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.25 
 
 		 633 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5156  hypothetical protein  24.66 
 
 		 393 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000726262 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1717  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  21.53 
 
 		 739 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000410476  hitchhiker  0.00177802 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3926  putative DNA modification methylase  26.56 
 
 		 345 aa  60.1  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0374  hypothetical protein  38.95 
 
 		 146 aa  58.2  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000208638  normal  0.261256 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4359  hypothetical protein  25.1 
 
 		 425 aa  57.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000708265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4038  putative RNA methylase  39.47 
 
 		 483 aa  57.8  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00846703 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26692  predicted protein  25.28 
 
 		 411 aa  57  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0281046  decreased coverage  0.00284905 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3799  putative RNA methylase  24.21 
 
 		 393 aa  57  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00410  adenine-specific DNA modification methyltransferase  22.29 
 
 		 412 aa  55.8  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0332  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  29.03 
 
 		 530 aa  56.2  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00994221  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5606  modification methylase, putative  24.61 
 
 		 438 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166814  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1791  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  37.5 
 
 		 703 aa  54.7  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2226  hypothetical protein  24.74 
 
 		 467 aa  53.9  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0684  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.63 
 
 		 528 aa  53.5  0.000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3603  adenine-specific DNA methylase  26.56 
 
 		 453 aa  53.1  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3798  putative RNA methylase  26.69 
 
 		 495 aa  52.8  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1725  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  32.98 
 
 		 524 aa  51.6  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110429  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0068  hypothetical protein  23.81 
 
 		 464 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00010049  hitchhiker  0.00158155 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1658  adenine-specific DNA methylase  22.76 
 
 		 416 aa  50.8  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000448906  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1038  putative RNA methylase  26.83 
 
 		 249 aa  50.4  0.00006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5607  modification methylase, putative  23.51 
 
 		 430 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0295584  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0909  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  33.77 
 
 		 535 aa  50.1  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.90275  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1917  putative modification methylase  26.88 
 
 		 482 aa  49.3  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0419467  hitchhiker  0.0000000000400101 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0306  putative RNA methylase  23.03 
 
 		 259 aa  48.5  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0220171  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1426  hypothetical protein  20.68 
 
 		 432 aa  48.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0114  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40.68 
 
 		 353 aa  47  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1918  putative modification methylase  23.08 
 
 		 353 aa  46.6  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00266275  hitchhiker  0.00000000000360377 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1303  adenine-specific DNA methylase  20.9 
 
 		 418 aa  45.4  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404813  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1000  DNA methyltransferase  22.58 
 
 		 472 aa  43.9  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1099  DNA modification methylase-like  38 
 
 		 413 aa  43.9  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000152418  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1948  hypothetical protein  38.98 
 
 		 731 aa  43.5  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2450  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  40.38 
 
 		 368 aa  43.5  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1353  putative DNA methylase containing a Zn-ribbon  37.7 
 
 		 995 aa  43.5  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0627  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.16 
 
 		 274 aa  43.1  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0310  DNA methylase N-4/N-6  26.21 
 
 		 599 aa  43.1  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2487  hypothetical protein  32.1 
 
 		 328 aa  43.1  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>