77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2731 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2731  methyltransferase DNA modification enzyme  100 
 
 		 410 aa  846    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3051  methyltransferase DNA modification enzyme  59.71 
 
 		 421 aa  521  1e-147  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2206  methyltransferase DNA modification enzyme  65.36 
 
 		 414 aa  518  1.0000000000000001e-145  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.612218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0737  hypothetical protein  48.34 
 
 		 407 aa  344  2e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00870561  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1620  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.86 
 
 		 414 aa  105  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2389  putative DNA modification methylase  28.15 
 
 		 369 aa  78.2  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.198556  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0328  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.58 
 
 		 383 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00415  adenine-specific DNA modification methyltransferase  23.03 
 
 		 374 aa  70.9  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.530575  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1681  cyclase family protein  24.09 
 
 		 366 aa  67.4  0.0000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.259173  hitchhiker  0.0000210949 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.35 
 
 		 947 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4038  putative RNA methylase  51.56 
 
 		 483 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00846703 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0953  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40 
 
 		 372 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.752338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2450  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35.71 
 
 		 368 aa  61.2  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3593  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  33.59 
 
 		 372 aa  61.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.316349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0306  putative RNA methylase  42.31 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0220171  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0227  adenine-specific DNA modification methyltransferase  21.53 
 
 		 877 aa  60.8  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0765559  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1717  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  22.74 
 
 		 739 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000410476  hitchhiker  0.00177802 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0460  putative RNA methylase  41.03 
 
 		 259 aa  58.9  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.258821  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0114  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.57 
 
 		 353 aa  58.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1511  DNA methylase N-4/N-6  39.02 
 
 		 329 aa  57.4  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3603  adenine-specific DNA methylase  32.03 
 
 		 453 aa  56.6  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1246  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  39.29 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0940338  hitchhiker  0.00345461 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1939  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  37.5 
 
 		 375 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000888828  hitchhiker  0.0000001156 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3926  putative DNA modification methylase  25 
 
 		 345 aa  54.7  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1038  putative RNA methylase  31.03 
 
 		 249 aa  53.9  0.000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2184  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  37.5 
 
 		 371 aa  53.5  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0490664  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3799  putative RNA methylase  24.4 
 
 		 393 aa  52.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0038  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  38.36 
 
 		 257 aa  51.2  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2576  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.46 
 
 		 313 aa  51.2  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.304507 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5156  hypothetical protein  22.36 
 
 		 393 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000726262 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0938  putative RNA methylase  23.32 
 
 		 461 aa  50.4  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000152524  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1826  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.27 
 
 		 460 aa  50.1  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478282 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1658  adenine-specific DNA methylase  23.3 
 
 		 416 aa  50.1  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000448906  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6814  hypothetical protein  26.96 
 
 		 433 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.823873  normal  0.941535 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0627  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  33.33 
 
 		 274 aa  49.7  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0790  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  41.67 
 
 		 293 aa  49.3  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3337  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  40.22 
 
 		 345 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.149909  unclonable  0.0000000199825 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4974  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  41.38 
 
 		 597 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2196  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  41.67 
 
 		 292 aa  48.5  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0374  hypothetical protein  35.44 
 
 		 146 aa  48.5  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000208638  normal  0.261256 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1518  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.38 
 
 		 284 aa  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2276  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  42.59 
 
 		 403 aa  47.8  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.265094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1071  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  38.81 
 
 		 391 aa  47.4  0.0004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0054  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  46 
 
 		 416 aa  47.8  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.549481  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0022  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  42.59 
 
 		 412 aa  47.4  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1303  adenine-specific DNA methylase  20.59 
 
 		 418 aa  47  0.0007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404813  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0041  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  34.25 
 
 		 441 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1055  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  40.68 
 
 		 849 aa  46.2  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000157491  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0073  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  46 
 
 		 429 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2383  DNA modification methylase-like protein  45.76 
 
 		 307 aa  45.8  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.389013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3939  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.31 
 
 		 633 aa  46.2  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3275  adenine-specific DNA methylase  42.22 
 
 		 596 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.762851  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1099  DNA modification methylase-like  46 
 
 		 413 aa  45.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000152418  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1456  putative RNA methylase  31.94 
 
 		 463 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1948  hypothetical protein  34.58 
 
 		 731 aa  45.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2333  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  44.23 
 
 		 276 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0137927 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0684  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  33.33 
 
 		 528 aa  45.4  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04295  hypothetical protein  40.28 
 
 		 377 aa  45.1  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2226  hypothetical protein  24.45 
 
 		 467 aa  44.7  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4077  hypothetical protein  31.37 
 
 		 614 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.180847  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2761  adenine-specific DNA methylase  35.48 
 
 		 892 aa  44.7  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0675  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  42 
 
 		 416 aa  44.7  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4984  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  41.82 
 
 		 412 aa  44.3  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.677083  normal  0.015231 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5606  modification methylase, putative  28.18 
 
 		 438 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166814  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0117  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.03 
 
 		 315 aa  44.3  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00741013  normal  0.263203 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1149  putative RNA methylase  36.62 
 
 		 350 aa  44.3  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0482589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0591  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40.74 
 
 		 308 aa  43.9  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000342774  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40.74 
 
 		 308 aa  43.9  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000183696  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0801  putative RNA methylase  36.62 
 
 		 351 aa  43.9  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1466  adenine-specific DNA-methyltransferase-like protein  31.13 
 
 		 312 aa  43.9  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307706  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1546  DNA methylase N-4/N-6  44.44 
 
 		 470 aa  43.5  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.572545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1480  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34.21 
 
 		 255 aa  43.5  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.292437  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1917  putative modification methylase  19.9 
 
 		 482 aa  43.5  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0419467  hitchhiker  0.0000000000400101 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0192  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  42.86 
 
 		 446 aa  43.5  0.007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.151287  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1791  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  40.98 
 
 		 703 aa  43.1  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1494  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.88 
 
 		 1068 aa  43.1  0.009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0283  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  33.93 
 
 		 292 aa  43.1  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>