44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3926 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3926  putative DNA modification methylase  100 
 
 		 345 aa  713    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2389  putative DNA modification methylase  42.51 
 
 		 369 aa  266  2.9999999999999995e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.198556  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1953  putative DNA modification methylase  44.9 
 
 		 163 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.113562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3939  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.15 
 
 		 633 aa  113  5e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3051  methyltransferase DNA modification enzyme  28.57 
 
 		 421 aa  63.9  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3799  putative RNA methylase  26.09 
 
 		 393 aa  61.6  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00415  adenine-specific DNA modification methyltransferase  25.1 
 
 		 374 aa  59.7  0.00000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.530575  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1620  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.56 
 
 		 414 aa  59.7  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0909  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  41.03 
 
 		 535 aa  58.2  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.90275  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1681  cyclase family protein  24.53 
 
 		 366 aa  57  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.259173  hitchhiker  0.0000210949 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1233  hypothetical protein  30.33 
 
 		 438 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241867  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2206  methyltransferase DNA modification enzyme  22.22 
 
 		 414 aa  55.5  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.612218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2731  methyltransferase DNA modification enzyme  25 
 
 		 410 aa  54.7  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6814  hypothetical protein  26.4 
 
 		 433 aa  54.7  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.823873  normal  0.941535 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0737  hypothetical protein  25.21 
 
 		 407 aa  54.3  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00870561  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5607  modification methylase, putative  24.17 
 
 		 430 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0295584  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1658  adenine-specific DNA methylase  41.3 
 
 		 416 aa  50.1  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000448906  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4787  hypothetical protein  23.83 
 
 		 441 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0227  adenine-specific DNA modification methyltransferase  23.94 
 
 		 877 aa  47.8  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0765559  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1456  putative RNA methylase  28.28 
 
 		 463 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2284  hypothetical protein  43.59 
 
 		 450 aa  47  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3603  adenine-specific DNA methylase  35.82 
 
 		 453 aa  47.4  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1872  hypothetical protein  38.57 
 
 		 433 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.682405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1303  adenine-specific DNA methylase  42 
 
 		 418 aa  47  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404813  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1426  hypothetical protein  37.74 
 
 		 432 aa  46.6  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1725  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  32.86 
 
 		 524 aa  46.2  0.0009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110429  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4038  putative RNA methylase  32.86 
 
 		 483 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00846703 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0684  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  34.72 
 
 		 528 aa  45.8  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1122  DNA methyltransferase  21.71 
 
 		 416 aa  45.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.909173  normal  0.0173084 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  43.75 
 
 		 947 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2190  hypothetical protein  48.72 
 
 		 792 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1917  putative modification methylase  37.5 
 
 		 482 aa  45.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0419467  hitchhiker  0.0000000000400101 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1471  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  45.24 
 
 		 276 aa  44.3  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1753  hypothetical protein  43.48 
 
 		 960 aa  43.9  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1948  hypothetical protein  34.92 
 
 		 731 aa  43.9  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3691  hypothetical protein  31.25 
 
 		 313 aa  43.5  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.454673  normal  0.0109558 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3766  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  37.31 
 
 		 599 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0871751  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0931  adenine-specific DNA methylase  37.5 
 
 		 412 aa  43.5  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.316794  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3628  DNA methylase N-4/N-6  37.31 
 
 		 599 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4183  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  52.78 
 
 		 370 aa  43.5  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  hitchhiker  0.00000333681 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2240  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  45.24 
 
 		 356 aa  43.1  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0162757  hitchhiker  0.0000599239 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2145  protein of unknown function DUF1156  50 
 
 		 937 aa  43.1  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000164543  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1670  DNA methyltransferase  58.62 
 
 		 380 aa  42.7  0.01  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2279  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  40.43 
 
 		 651 aa  42.7  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.132856  hitchhiker  0.000043664 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>