56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1122 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1122  DNA methyltransferase  100 
 
 
416 aa  869    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.909173  normal  0.0173084 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1306  hypothetical protein  42.62 
 
 
414 aa  317  3e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000125163  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1000  DNA methyltransferase  45.32 
 
 
472 aa  317  4e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0958  hypothetical protein  43.21 
 
 
408 aa  313  3.9999999999999997e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00607753 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3691  hypothetical protein  44.93 
 
 
313 aa  227  4e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.454673  normal  0.0109558 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4787  hypothetical protein  30.62 
 
 
441 aa  186  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3922  hypothetical protein  30.79 
 
 
439 aa  179  9e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0070396  normal  0.271721 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3873  hypothetical protein  30.79 
 
 
439 aa  179  9e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0894  hypothetical protein  30.36 
 
 
445 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.118931  hitchhiker  0.00000342492 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1833  hypothetical protein  26.54 
 
 
444 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0068  hypothetical protein  24.43 
 
 
464 aa  102  9e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00010049  hitchhiker  0.00158155 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1233  hypothetical protein  25.59 
 
 
438 aa  97.1  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241867  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5606  modification methylase, putative  26.33 
 
 
438 aa  92  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166814  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1872  hypothetical protein  26.3 
 
 
433 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.682405  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0325  hypothetical protein  22.44 
 
 
431 aa  90.5  5e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.103576  hitchhiker  0.00000188519 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5607  modification methylase, putative  22.6 
 
 
430 aa  89  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0295584  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1917  putative modification methylase  25 
 
 
482 aa  85.5  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0419467  hitchhiker  0.0000000000400101 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00410  adenine-specific DNA modification methyltransferase  21.27 
 
 
412 aa  84.3  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1658  adenine-specific DNA methylase  20.95 
 
 
416 aa  79.7  0.00000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000448906  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1918  putative modification methylase  23.08 
 
 
353 aa  79.3  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00266275  hitchhiker  0.00000000000360377 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3181  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  21.74 
 
 
482 aa  75.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0227  adenine-specific DNA modification methyltransferase  20.6 
 
 
877 aa  72.4  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0765559  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2251  hypothetical protein  24.86 
 
 
393 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4397  hypothetical protein  26.19 
 
 
475 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.050702 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0642  hypothetical protein  21.21 
 
 
435 aa  71.6  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3603  adenine-specific DNA methylase  24.5 
 
 
453 aa  70.9  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2284  hypothetical protein  30.46 
 
 
450 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3799  putative RNA methylase  21.76 
 
 
393 aa  67.4  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1303  adenine-specific DNA methylase  21.79 
 
 
418 aa  67  0.0000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404813  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2828  hypothetical protein  23.17 
 
 
474 aa  65.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0407  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  20.97 
 
 
476 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.144423 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3798  putative RNA methylase  23.95 
 
 
495 aa  62.8  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4359  hypothetical protein  21.33 
 
 
425 aa  62.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000708265  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1426  hypothetical protein  22.19 
 
 
432 aa  61.6  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0931  adenine-specific DNA methylase  21.58 
 
 
412 aa  62.4  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.316794  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0684  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.84 
 
 
528 aa  60.5  0.00000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2389  putative DNA modification methylase  27.34 
 
 
369 aa  58.2  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.198556  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1725  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  48.98 
 
 
524 aa  57.8  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110429  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4009  hypothetical protein  33.94 
 
 
512 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000517991  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0843  Site-specific DNA-methyltransferase (cytosine- N(4)-specific)  20.61 
 
 
412 aa  57  0.0000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140978  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2226  hypothetical protein  21.31 
 
 
467 aa  52.8  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.01 
 
 
947 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0332  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  33.33 
 
 
530 aa  51.6  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00994221  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1242  modification methylase  19.75 
 
 
441 aa  50.4  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00503065  hitchhiker  0.00000000592753 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0909  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  33.8 
 
 
535 aa  49.7  0.00009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.90275  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0700  putative RNA methylase  36.84 
 
 
374 aa  47.8  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.46275  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3012  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  21.21 
 
 
477 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3939  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.72 
 
 
633 aa  45.8  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6814  hypothetical protein  24.22 
 
 
433 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.823873  normal  0.941535 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3593  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.55 
 
 
372 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.316349  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4077  hypothetical protein  47.5 
 
 
614 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.180847  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3926  putative DNA modification methylase  21.71 
 
 
345 aa  45.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4038  putative RNA methylase  51.28 
 
 
483 aa  43.9  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00846703 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0571  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.45 
 
 
361 aa  43.5  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00032193 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0328  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  21.75 
 
 
383 aa  43.1  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2337  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  36.36 
 
 
334 aa  43.1  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.628508 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>