92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0571 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0571  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  100 
 
 
361 aa  748    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00032193 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2670  DNA methylase N-4/N-6  51.23 
 
 
388 aa  347  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000248914  normal 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4235  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  33.41 
 
 
459 aa  209  4e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7332  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.52 
 
 
345 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000215646  hitchhiker  0.0000000024237 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3617  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.88 
 
 
296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0379764  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4183  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.03 
 
 
370 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  hitchhiker  0.00000333681 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1670  DNA methyltransferase  30.72 
 
 
380 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0864  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.59 
 
 
299 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2524  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.26 
 
 
368 aa  109  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000139446  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1434  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.77 
 
 
345 aa  107  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.927906  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4634  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.33 
 
 
352 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0646  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.09 
 
 
368 aa  105  9e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000621493  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1062  DNA binding domain protein, excisionase family  30.95 
 
 
365 aa  103  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00013023  unclonable  0.00000741257 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2345  DNA methylase N-4/N-6  27.49 
 
 
330 aa  97.1  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0319452  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2404  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.29 
 
 
305 aa  95.9  9e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4169  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.55 
 
 
379 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1670  DNA methylase  26.84 
 
 
378 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000519085  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2240  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  36.96 
 
 
356 aa  93.6  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0162757  hitchhiker  0.0000599239 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1029  gp56  26.27 
 
 
378 aa  90.5  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0905816  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3353  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34.92 
 
 
314 aa  88.6  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.665349 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0833  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.96 
 
 
302 aa  83.6  0.000000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2825  DNA methylase N-4/N-6  27.87 
 
 
373 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.364595 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6269  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.67 
 
 
333 aa  81.3  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2333  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.64 
 
 
276 aa  68.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0137927 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1246  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.22 
 
 
293 aa  67  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0940338  hitchhiker  0.00345461 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2196  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25 
 
 
292 aa  65.5  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0627  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.39 
 
 
274 aa  65.1  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1518  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.66 
 
 
284 aa  64.3  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3152  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.96 
 
 
359 aa  63.9  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0790  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.37 
 
 
293 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0041  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.67 
 
 
441 aa  62  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2337  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  33.98 
 
 
334 aa  60.8  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.628508 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2525  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  36.19 
 
 
396 aa  60.8  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000796245  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2446  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  38.24 
 
 
379 aa  60.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.370845  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0192  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34.82 
 
 
446 aa  59.7  0.00000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.151287  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0229  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.55 
 
 
399 aa  59.7  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0324708 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0560  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.71 
 
 
323 aa  57.8  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4974  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.66 
 
 
597 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0022  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.53 
 
 
412 aa  57.4  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2150  DNA methylase  25.41 
 
 
349 aa  57  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000209549  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3838  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.56 
 
 
311 aa  55.8  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1767  DNA methylase  31.97 
 
 
352 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000189808  hitchhiker  0.00347478 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0073  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.36 
 
 
429 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1263  DNA methylase  32.26 
 
 
349 aa  53.9  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00126419  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1444  DNA methylase  32.26 
 
 
349 aa  53.9  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0286  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.77 
 
 
271 aa  53.9  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.684049  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0054  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  38.24 
 
 
416 aa  53.9  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.549481  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2242  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.45 
 
 
329 aa  53.9  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.310751  hitchhiker  0.0000644694 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3151  DNA methylase  30.33 
 
 
352 aa  53.1  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000168176  hitchhiker  0.000000000119452 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1848  DNA methylase  30.33 
 
 
352 aa  53.1  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000193192  hitchhiker  0.0000000226376 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0768  hypothetical protein  24.62 
 
 
262 aa  53.1  0.000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000323613 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1810  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.91 
 
 
329 aa  53.1  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.729703  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2398  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.8 
 
 
313 aa  52  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0675  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27 
 
 
416 aa  51.6  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1099  DNA modification methylase-like  25.12 
 
 
413 aa  52  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000152418  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2196  DNA methylase  34.95 
 
 
391 aa  51.2  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000872225  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1272  DNA methylase  30.58 
 
 
349 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.342929  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1440  DNA methylase  30.65 
 
 
348 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.294057  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2383  DNA modification methylase-like protein  27.52 
 
 
307 aa  50.8  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.389013  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0117  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.93 
 
 
315 aa  50.4  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00741013  normal  0.263203 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0066  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.64 
 
 
372 aa  50.1  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.711822  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1468  site-specific DNA-methyltransferase  25.55 
 
 
372 aa  50.1  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.661815  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0119  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.55 
 
 
372 aa  50.1  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.222875  normal  0.070794 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2250  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.35 
 
 
348 aa  49.7  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0370672 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0925  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.11 
 
 
294 aa  49.3  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.171639 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2300  DNA methylase N-4/N-6  26.37 
 
 
287 aa  48.1  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.599897  normal  0.437406 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0750  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.93 
 
 
395 aa  48.5  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.296291  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4367  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.66 
 
 
358 aa  48.5  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.721631 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0965  DNA methylase N-4/N-6  30.12 
 
 
379 aa  47.8  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0004  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.43 
 
 
396 aa  47.8  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.0090313 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0392  DNA methylase N-4/N-6  25.12 
 
 
367 aa  47.8  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.723409 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2649  DNA methylase N-4/N-6  27.11 
 
 
389 aa  47.8  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3043  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.47 
 
 
375 aa  47.4  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00264807  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1593  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.52 
 
 
308 aa  47.4  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0446322  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0884  DNA methylase N-4/N-6  30.58 
 
 
451 aa  46.2  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.946324  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1084  cell cycle regulated site-specific DNA-methyltransferase protein  28.87 
 
 
377 aa  45.8  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3573  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.31 
 
 
306 aa  46.2  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.116756  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1367  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.12 
 
 
360 aa  45.1  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3217  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.54 
 
 
471 aa  44.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.77024  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4450  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.12 
 
 
283 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2126  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.46 
 
 
370 aa  44.3  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1809  DNA modification methylase-like protein  26.32 
 
 
273 aa  43.9  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0024  adenine-specific methyltransferase  25.62 
 
 
368 aa  43.9  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.109862  normal  0.210092 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0735  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  32.14 
 
 
330 aa  43.9  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.833245  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0306  putative RNA methylase  34.21 
 
 
259 aa  43.9  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0220171  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1122  DNA methyltransferase  28.45 
 
 
416 aa  43.5  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.909173  normal  0.0173084 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2101  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.1 
 
 
376 aa  43.9  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.528087 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05110  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.57 
 
 
386 aa  43.5  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4513  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.52 
 
 
279 aa  43.5  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0040831  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2231  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.54 
 
 
369 aa  43.5  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0921492  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1474  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.29 
 
 
368 aa  43.5  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1319  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  21.17 
 
 
258 aa  42.7  0.009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000125948 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>