47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A1242 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A1242  modification methylase  100 
 
 		 441 aa  899    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00503065  hitchhiker  0.00000000592753 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1658  adenine-specific DNA methylase  32.33 
 
 		 416 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000448906  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1303  adenine-specific DNA methylase  30.18 
 
 		 418 aa  188  1e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404813  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0931  adenine-specific DNA methylase  28.24 
 
 		 412 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.316794  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3603  adenine-specific DNA methylase  28.54 
 
 		 453 aa  157  3e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0843  Site-specific DNA-methyltransferase (cytosine- N(4)-specific)  25.96 
 
 		 412 aa  124  4e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140978  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2226  hypothetical protein  23.84 
 
 		 467 aa  92.8  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3799  putative RNA methylase  28.69 
 
 		 393 aa  92.4  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1456  putative RNA methylase  25.17 
 
 		 463 aa  82.8  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5606  modification methylase, putative  24.7 
 
 		 438 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166814  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0329  hypothetical protein  25.75 
 
 		 417 aa  79.7  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.94 
 
 		 947 aa  70.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1918  putative modification methylase  23.89 
 
 		 353 aa  67.8  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00266275  hitchhiker  0.00000000000360377 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0958  hypothetical protein  20.49 
 
 		 408 aa  63.2  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00607753 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0068  hypothetical protein  22.94 
 
 		 464 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00010049  hitchhiker  0.00158155 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1122  DNA methyltransferase  19.1 
 
 		 416 aa  60.5  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.909173  normal  0.0173084 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4038  putative RNA methylase  21.98 
 
 		 483 aa  60.5  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00846703 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2251  hypothetical protein  20.9 
 
 		 393 aa  60.1  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0328  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.27 
 
 		 383 aa  58.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6814  hypothetical protein  27.88 
 
 		 433 aa  54.3  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.823873  normal  0.941535 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1306  hypothetical protein  18.95 
 
 		 414 aa  52.8  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000125163  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4787  hypothetical protein  19.29 
 
 		 441 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1948  hypothetical protein  39.68 
 
 		 731 aa  50.4  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4009  hypothetical protein  43.75 
 
 		 512 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000517991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1833  hypothetical protein  22.8 
 
 		 444 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3798  putative RNA methylase  23.42 
 
 		 495 aa  48.5  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3922  hypothetical protein  20.47 
 
 		 439 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0070396  normal  0.271721 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3873  hypothetical protein  20.47 
 
 		 439 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3347  adenine-specific DNA methylase  34.85 
 
 		 878 aa  47.8  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1367  hypothetical protein  34.92 
 
 		 746 aa  47.4  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1233  hypothetical protein  23.83 
 
 		 438 aa  47.4  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241867  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0894  hypothetical protein  23.17 
 
 		 445 aa  47.4  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.118931  hitchhiker  0.00000342492 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3988  hypothetical protein  25.51 
 
 		 982 aa  47  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.172712 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4077  hypothetical protein  27.19 
 
 		 614 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.180847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0374  hypothetical protein  25.83 
 
 		 146 aa  46.6  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000208638  normal  0.261256 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0642  hypothetical protein  25.09 
 
 		 435 aa  45.8  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2761  adenine-specific DNA methylase  39.62 
 
 		 892 aa  45.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0913  site-specific DNA-methyltransferase  41.86 
 
 		 173 aa  45.4  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0325  hypothetical protein  22.06 
 
 		 431 aa  45.4  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.103576  hitchhiker  0.00000188519 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0306  putative RNA methylase  36 
 
 		 259 aa  44.3  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0220171  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2196  adenine-specific DNA methylase  37.1 
 
 		 747 aa  44.3  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0420  site-specific DNA-methyltransferase  41.86 
 
 		 243 aa  44.3  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1486  site-specific DNA-methyltransferase  41.86 
 
 		 243 aa  44.3  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1409  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  39.53 
 
 		 243 aa  43.5  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0420  hypothetical protein  24.32 
 
 		 317 aa  43.1  0.009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0587292 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1772  adenine-specific DNA methylase  32.2 
 
 		 916 aa  43.1  0.01  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1620  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  21.32 
 
 		 414 aa  43.1  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>